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🧬 biology

Interaction-Token Structural Alignment (ITSA): An Interpretable Framework for Protein Similarity Based on Residue-Level Chemical Interactions

El artículo presenta la Alineación Estructural de Tokens de Interacción (ITSA, por sus siglas en inglés), un marco interpretable que convierte las estructuras proteicas en tokens de interacción bioquímica a nivel de residuo para la alineación local, demostrando su eficacia al capturar la similitud a nivel de familia y preservar el contexto mecanístico donde los métodos tradicionales centrados en la geometría resultan insuficientes.

Samanyu Kulkarni, Ranjita Thapa2026-07-30
🧬 biology

Transforming MRI volumes with Space-Filling Curves reveals Multifractal Signatures of Ageing and Dementia Progression

Este estudio introduce el Análisis de Curva de Llenado de Espacio Multifractal (MFSCA, por sus siglas en inglés) para demostrar que la organización espacial de las estructuras cerebrales, medida mediante la multifractalidad en datos de RM, se deteriora progresivamente desde un estado complejo y heterogéneo hacia uno más simple y homogéneo con el avance de la edad y la progresión de la demencia.

Marta Lotka, Jacek Grela, Zbigniew Drogosz, Jeremi K Ochab, Paweł Oświęcimka2026-07-30
🧬 biology

Novel genes in spermatozoa as robust markers for reproductive behavior in fish: Physiological perspectives on environmental RNA sequencing

Este estudio identifica transcritos de genes específicos de los testículos, novedosos y altamente abundantes, particularmente similares a *pmfbp1*, como marcadores de ARN ambiental robustos para detectar el comportamiento reproductivo de los peces mediante el muestreo de agua no invasivo.

Marty Kwok-Shing Wong, Yuto Aminaka, Takehiro Tsukada, Susumu Hyodo2026-07-30
🧬 biology

Exploring ubiquitination-related biomarkers in osteoarthritis based on single-cell and transcriptomic data

Este estudio integra datos transcriptómicos de célula única y de tipo bulk para identificar cinco biomarcadores relacionados con la ubiquitinación (MYC, TLR7, CX3CR1, PER1 y GADD45B) implicados en la patogénesis de la osteoartritis, revelando su enriquecimiento en la vía TNF-alfa/NF-kappaB, su asociación con poblaciones de células inmunitarias específicas y su expresión elevada en fibroblastos sinoviales, ofreciendo así nuevas dianas terapéuticas para la enfermedad.

Tian Lan, Huan Dai, DeGuang Li, ChongYu Zhao, XiaoYu Mu, Li Li, Chao Wang2026-07-30
🧬 biology

Transformed Callus of Panax vietnamensis: Promising In Vitro Platform for Majonoside R2 Production alongside Hairy Roots

Este estudio demuestra que el callo transformado de *Panax vietnamensis* inducido por *Agrobacterium rhizogenes* sirve como una alternativa estable, libre de hormonas y altamente productiva a las raíces pilosas para la producción in vitro sostenible de la rara saponina majonosida R2, particularmente cuando es potenciada por la elicitación con MeJA.

HUYEN TRAN, THI QUY TRAN, HongIk Yoon, Hei Chan Lee2026-07-30
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Polarity-Registered Nuclear Mapping Reveals Discrete Topological Classes of Chromosome Organization

Este estudio introduce un sistema de coordenadas nucleares registrado por polaridad que normaliza la geometría nuclear para revelar clases topológicas discretas y reproducibles de la organización cromosómica en células madre mesenquimales humanas, demostrando que las restricciones mecánicas y de polaridad impulsan comportamientos espaciales asimétricos y específicos de cada homólogo.

Paolo Netti, Luca Messina, Carlo Natale2026-07-30
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BMP9 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression By Accelerating Cell Cycle through CKS1B Lactylation

Este estudio revela que la expresión elevada de BMP9 impulsa la progresión del carcinoma hepatocelular al promover la lactilación de CKS1B, lo que potencia la interacción de CKS1B con CDK1–3 y facilita la degradación de p27 para acelerar la progresión del ciclo celular.

Hong Tang, Han Chen, Jianhao li, Ying-Yi Li, Mingming Zhang, Jiayi Wang, Xia Zhu, Weixiu Li, Junpeng Zhou, Xiangnan Teng (…)2026-07-30
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FuncDECODE Resolves Cell-Type-Specific Functional Heterogeneity across Biological States and Spatial Contexts

FuncDECODE es un marco computacional que aprovecha las referencias de célula única para deconvolucionar datos de transcriptómica masiva y espacial mixtos, permitiendo así la identificación de la remodelación de programas funcionales específicos de cada tipo celular a través de diversos estados biológicos, contextos de enfermedad y arquitecturas tisulares espaciales.

Yadong Wang, Renjie Liu, Tianyi Zhao2026-07-30
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Malaria parasites coordinate host cell remodeling through the AP2-HCR DNA-binding protein

Este estudio identifica a PfAP2-HCR como un factor de transcripción ApiAP2 esencial en *Plasmodium falciparum* que orquesta la remodelación de la célula huésped mediante la regulación directa de la expresión de proteínas exportadas clave, asegurando así la supervivencia, el desarrollo y la transmisión del parásito a través de las etapas sanguíneas asexuales y sexuales.

Arnab Pain, Amit Subudhi, Dhiviya Vedagiri, Sara Mfarrej, Reem Abu-Shamma, Rohit Satyam, Rahul Salunke, Di Liu, Maya Aya (…)2026-07-30