🧬 biology

Recognition of BCL-2-interacting killer by GRP78; in silico perspective

Este estudio emplea un marco computacional multinivel para revelar que la región R2 extendida de BIK, estabilizada por un puente salino crítico con ARG439 en GRP78, sirve como el determinante de unión primario en un mecanismo de doble anclaje que inhibe la apoptosis, lo que sugiere a ARG439 como un objetivo terapéutico prometedor para restaurar la muerte celular en el cáncer de mama.

Nada R. Abd Alhadiy, Yasser Y. Ebaid, Y. Mohammed, Abdo A. Elfiky2026-09-10
🧬 biology

Disentangling Loss Design and Ontology-Aware Architecture in GNN-Based Protein Function Prediction A Controlled Ablation Study

Este estudio de ablación controlada revela que, en la predicción de funciones proteicas basada en GNN, la función de pérdida propuesta de acreción de información es contraproducente, mientras que el rendimiento óptimo se logra combinando una arquitectura GCN con atención de ontología cruzada y la pérdida de entropía cruzada binaria estándar.

Yongjin Chen, Xiyuan Wang, Yiman Gao, Songze Zhu2026-09-10
🧬 biology

H18 haemagglutinin binds MHC class II at a site distant from the canonical sialic-acid binding site

Este estudio revela que la hemaglutinina H18 de influenza derivada de murciélagos se une a las moléculas del MHC clase II en un nuevo sitio distinto del bolsillo canónico de ácido siálico, induciendo cambios conformacionales que preparan la fusión viral y demostrando la adaptabilidad estructural de la proteína para utilizar receptores proteicos para la entrada al huésped.

Antoni Wrobel, Jonathan Robert, Maria Osman, Valeria Calvaresi, Benjamin Bouzabia, Selene Franchini, Sophie Focks, Liubo (…)2026-09-10
🧬 biology

Evaluating porcine antisense oligonucleotide RNA-seq for cross- species virtual-knockout benchmarking

Este estudio evalúa datos de RNA-seq de oligonucleótidos antisentido porcinos para determinar la viabilidad de la evaluación comparativa de knockout virtual entre especies, concluyendo que, si bien la puntuación del transcriptoma completo es poco fiable debido a las discrepancias de los estimadores, la puntuación de clasificación de genes líderes es reproducible y ofrece un objetivo defendible para extender los modelos de perturbación derivados de humanos al ganado.

Xiaotong Zhao, Hua Chang, Zhuoyu Zhao, Xun Xiang2026-09-10
🧬 biology

Geographic Variation in the Urinary Microbiota of Patients with Urolithiasis

Este estudio transnacional revela que, si bien la riqueza microbiana urinaria es similar, la composición general de la comunidad y las abundancias taxonómicas específicas en pacientes con urolitiasis difieren significativamente entre Taiwán y Corea del Sur, lo que sugiere que los factores geográficos y ambientales moldean perfiles de microbiota urinaria distintos asociados con la enfermedad de cálculos.

Hsiang Ying Lee, Chun Kai Chang, Wen-Jeng Wu, Deng‐Chyang Wu, Sung Yong Cho2026-09-10
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A Genome-Wide Causal Network Reveals Conserved Cross-Module Regulatory Architecture in Human Cancer

Este estudio introduce un método de descubrimiento causal diferenciable de bajo rango y escalable para reconstruir la primera red regulatoria dirigida de todo el genoma en el cáncer humano, revelando una arquitectura trans-módulo conservada dominada por centros de datos farmacológicos que capturan relaciones regulatorias mayoritariamente independientes de la esencialidad genética.

Shuaidong Gao2026-09-10
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Adaptation and psychometric evaluation of the BANKS-SP biobanking survey in longstanding dengue virus cohorts in Colombia and Nicaragua

Este estudio adapta y evalúa las propiedades psicométricas de la encuesta de biobanco BANKS-SP en cohortes de dengue colombianas y nicaragüenses, encontrando que mientras la Escala de Autoeficacia funcionó adecuadamente, la Escala de Actitudes requiere revisión y ambos sitios exhibieron brechas significativas de conocimiento con respecto a la gobernanza de bioespecímenes y los marcos legales.

Lauren Maxwell, Mahir Bhatt, Harold Suazo Laguna, Jackeline Bravo Chamorro, María Consuelo Miranda Montoya, Luz Leegstra (…)2026-09-10
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Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells Alleviate Osteoblast Differentiation Disorder Induced by Oxidative Stress by Inhibiting Ferroptosis Through the miR-218-5p/CBX3 Axis

Este estudio demuestra que las células madre mesenquimales del cordón umbilical (UC-MSCs) alivian los trastornos de la diferenciación de los osteoblastos inducidos por el estrés oxidativo e inhiben la ferroptosis mediante la regulación al alza de miR-218-5p, que tiene como objetivo y suprime a CBX3, restaurando así la función osteogénica a través del eje de señalización miR-218-5p/CBX3.

Lintong Li, Yunda Huang, Yuan Ma, Jiaxin Liu, Yu Chang2026-09-10
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Noncanonical catalytic-relay geometry and PET-oligomer accommodation in a CheB-like α/β-hydrolase from Pseudomonas marincola

Este estudio demuestra que, si bien una hidrolasa tipo CheB de *Pseudomonas marincola* posee un motivo Ser–His–Asp, su geometría catalítica no canónica y sus limitados poses de acoplamiento de oligómeros indican que no está preorganizada para una degradación eficiente de PET, resaltando que la conservación del motivo por sí sola no garantiza la función enzimática.

Mahira Shaikh2026-09-10
🧬 biology

A novel topology-guided adaptive strategy for automated nuclear-cytoplasmic H-Score quantification in immunohistochemistry

Este artículo presenta un complemento de ImageJ/Fiji de código abierto y libre de entrenamiento que combina la detección nuclear de StarDist con una estrategia de segmentación basada en Voronoi guiada por topología y calibración adaptativa para lograr una cuantificación automatizada altamente precisa y reproducible de los H-scores nucleares y citoplasmáticos a través de diversos conjuntos de datos de inmunohistoquímica.

Weiyu Wang, Mengting Lin, Fuxian Zou, Zhenzhen Yang, Mingqing Huang, Changxian Chen2026-09-10