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TDEP: Predicting Target Perturbation Response from Drug-Induced Transcriptomes
TDEP es una red neuronal profunda que aprovecha los embeddings de modelos de lenguaje de proteínas y redes de atención de grafos para predecir con precisión las respuestas de perturbación de objetivos en todo el transcriptoma a partir de perfiles inducidos por fármacos, igualando la precisión de los métodos basados en estructura mientras proporciona información mecanística detallada a nivel de genes para la priorización de objetivos y el reposicionamiento de fármacos.