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paRDal: Bioinformatics Framework for a Parallel RNA and DNA NGS Analysis in Hereditary Cancer Diagnostics

El artículo presenta paRDal, un marco de bioinformática contenedorizado que integra datos de NGS de ADN y ARN germinales emparejados para mejorar el diagnóstico del cáncer hereditario mediante la detección de anomalías en el splicing y la expresión, mejorando así la interpretación de variantes y el rendimiento diagnóstico a través de un flujo de trabajo intuitivo y basado en evidencia.

Kateřina Matějková, Petr Nehasil, Petra Kleiblová, Taťána Ptáčková, Marta Černá, Pavel Just, Ondřej Vít, Petra Zemánková (…)2026-07-09
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Biodiversity as the source of heterospecific social information: the effect on territory selection in the marsh warbler

Aunque un experimento a gran escala sugirió inicialmente que la información social interespecífica influye en la selección de territorios de la golondrina común, un análisis riguroso que tuvo en cuenta las distribuciones espaciales preexistentes reveló que su abundancia está impulsada principalmente por la estructura del hábitat y la riqueza de especies locales, más que por las señales acústicas manipuladas.

Sylwia Pustkowiak, Zbigniew Kwieciński, Piotr Skórka2026-07-09
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Fungal–Fungal Interactions Drive Metabolic Reprogramming in Root-Associated Endophytes of Salvia abrotanoides

Este estudio demuestra que las interacciones hongo-hongo entre los endófitos asociados a las raíces de *Salvia abrotanoides* impulsan la reprogramación metabólica, lo que conduce a la regulación diferencial de compuestos de señalización y a la activación de vías biosintéticas silenciosas que producen nuevos metabolitos secundarios.

Yeganeh Teimoori-Boghsani, Ali Ganjeali, Gabriele Berg, Tomislav Cernava, Javad Asili, Fatemeh Masoudi-Khorasani, Nasrin (…)2026-07-09
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Diversity of microbiome associated with the didemnid ascidian Lissoclinum patella in North Sulawesi, Indonesia

Este estudio utiliza la secuenciación de ARNr 16S de longitud completa para revelar que el microbioma bacteriano de la ascidia *Lissoclinum patella* en el norte de Sulawesi exhibe estructuras de comunidad distintas según el sitio y la profundidad, siendo la población de la isla Talise, de aguas someras, la que alberga los consorcios bacterianos más ricos y diversos dominados por *Hoeflea*, en comparación con las comunidades menos diversas en aguas más profundas y urbanizadas.

Inneke Fenny Melke Rumengan, Robert A. Bara, Deiske Adeline Sumilat, Trezya Nilam Sari Pangemanan, Irene Shelyn Poluan (…)2026-07-09
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Response Surface Optimization of PEG-Mediated Precipitation for Efficient Recovery of ClearColi™ Outer Membrane Vesicles

Este estudio demuestra que la precipitación con polietilenglicol (PEG) optimizada mediante la Metodología de Superficie de Respuesta ofrece una alternativa escalable y rentable a la ultracentrifugación para la recuperación de vesículas de membrana externa de alto rendimiento y estructuralmente intactas de ClearColi™, logrando una recuperación de proteínas un 63.4% mayor al tiempo que preserva la integridad de las vesículas.

shiva bayat, Seyed Latif Mousavi Gargari, Shahram Nazarian2026-07-09
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Local structure-activity landscape roughness detects the activity-cliff failure mode that standard QSAR reliability methods miss

Este artículo introduce una medida por compuesto de la rugosidad del paisaje de la relación estructura-actividad local que detecta con éxito los modos de falla de acantilados de actividad omitidos por los métodos estándar de confiabilidad de QSAR, permitiendo la construcción de predictores conformes calibrados que mantienen una cobertura válida incluso en regiones donde los modelos tradicionales fallan.

Krishna Harish2026-07-09
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OTrack: A High-Throughput Organoid Detection and Tracking Framework Using Neighborhood-Guided Descriptors

OTrack es un marco de trabajo libre de entrenamiento que logra un seguimiento de organoides robusto y de alto rendimiento a través de intervalos de imagen prolongados al aprovechar las distribuciones espaciales estables de los vecindarios en lugar de depender de características morfológicas que cambian con el tiempo.

Binlin Chen, Jian Wang, Jiaqi He, Yuan Li, Jianfa Zhou, Linjie Guo, Haofeng Li, Liang Yang, Bohui Chen2026-07-09
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Prevalence, Virulence Gene Profiles, and Multidrug Resistance of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli in Farmed Carp (Labeo rohita) from Punjab, Pakistan: Implications for Food Safety and One Health

Este estudio revela una prevalencia significativa de *E. coli* productora de toxina Shiga multirresistente que porta genes de virulencia en la carpa de cultivo y en el agua de Punjab, Pakistán, lo que destaca riesgos urgentes para la inocuidad alimentaria y la necesidad de mejorar la gestión de antimicrobianos en la industria de la acuicultura de la región.

Talib Hussain, Fayyaz Rasool, Sarjito Sarjito, Shahid Mahmood, Aninditia Sabdaningsih, Agus Trianto, Shahid Sherzada2026-07-09