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Cette étude propose un indicateur d'alerte précoce géométrique, basé sur la largeur de la séparatrice stochastique d'un modèle écosystémique à deux états, capable de prédire les efflorescences algales sous-glaciaires dans l'Arctique là où les signaux conventionnels échouent en raison du bruit intense ou du manque de données.
En modélisant la dynamique du pathogène de la Peste Noire au sein d'une théorie de jauge non abélienne, cette étude démontre que les zones géographiques épargnées, telles que la Pologne et la Bohême, ne sont pas des anomalies statistiques mais des vides topologiques nécessaires résultant d'une interférence destructive des ondes de mutation.
Cette étude propose un cadre théorique prédictif pour décrire la dynamique proie-prédateur quantifiée en analysant les propriétés de stabilité quantique d'un hamiltonien de type Toda, qui reproduit les solutions analytiques du modèle classique de Lotka-Volterra tout en intégrant des corrections quantiques non perturbatives via des courants de Wigner.
Cette étude démontre que la supposition d'une distribution homogène du temps de génération dans les populations structurées fausse les estimations du nombre de reproduction effectif (Rt), et propose une méthodologie pour corriger ce biais afin d'améliorer la précision des politiques de santé publique.
Le papier présente CLEF, un modèle d'édition de séquences contrôlable qui encode les concepts temporels pour modifier de manière ciblée le moment et la portée des conditions dans des trajectoires biologiques et cliniques, surpassant ainsi les méthodes existantes en précision pour la génération de scénarios contrefactuels réalistes.
Cet article étend la représentation par matrices F, initialement conçue pour les arbres phylogénétiques isochrones, aux arbres entièrement hétérochrones en établissant une bijection explicite qui permet l'énumération et la modélisation probabiliste de ces structures évolutives complexes.
Cet article propose et étudie les réseaux phylogénétiques non enracinés -découpables, une nouvelle classe reconnaissable en temps polynomial et permettant de résoudre efficacement le problème de la contenance d'arbre, comblant ainsi le vide laissé par les réseaux orientables en arbre-enfant dont la reconnaissance est NP-difficile.
Cette étude développe un cadre d'évaluation des risques fondé sur les données pour quantifier la probabilité de transmission de la grippe aviaire hautement pathogène (H5N1) des oiseaux sauvages au bétail au Danemark, en identifiant des périodes et des zones géographiques à haut risque afin de renforcer la surveillance et la préparation.
Ce papier présente SDSR, une méthode évolutive de reconstruction d'arbres d'espèces basée sur une approche spectrale diviser-pour-régner qui, tout en préservant la précision, réduit considérablement le temps de calcul par rapport aux méthodes existantes.
Ce papier présente un modèle stochastique de compétition pour les ressources démontrant que si la rupture de symétrie initiale est régie par les statistiques des valeurs extrêmes des temps de premier passage, une interaction non réciproque est strictement nécessaire pour stabiliser la domination macroscopique contre les fluctuations locales.
Cet article établit l'existence de solutions d'ondes voyageuses non monotones et de fronts-pulsations pour le système de compétition faible de Lotka-Volterra à deux espèces, en fournissant des conditions suffisantes vérifiables pour la première fois, y compris dans le cas de la vitesse critique.
Le papier présente CoSiNE, un modèle d'évolution neuronale conditionnellement indépendant du site qui combine la puissance des réseaux de neurones avec les dynamiques évolutives pour prédire les effets des variants d'anticorps et optimiser leur affinité de liaison, surpassant ainsi les modèles de langage actuels.
Cette étude démontre que négliger l'incertitude vaccinale dans les modèles épidémiologiques entraîne des erreurs significatives, particulièrement à long terme, car l'application du taux de vaccination à l'ensemble des sujets sensibles plutôt qu'aux seuls volontaires fausse les prévisions d'équilibre et de propagation.
Cette étude développe un modèle à grande échelle basé sur des acteurs et intégrant des données démographiques néerlandaises détaillées pour simuler la propagation de pathogènes respiratoires sur des réseaux de contacts dynamiques, démontrant ainsi l'importance des profils géographiques et démographiques initiaux ainsi que l'efficacité des stratégies d'intervention comportementale pour contrôler les épidémies.
Cet article établit une loi forte des grands nombres fonctionnelle pour un modèle spatial de la roue de Muller, démontrant la convergence vers un système d'équations aux dérivées partielles qui permet de déterminer la vitesse de propagation et de confirmer que les mutations délétères peuvent effectivement « surfer » sur les vagues de population.
Cette étude démontre que, bien que les modèles d'accumulation évolutive supposant l'irréversibilité introduisent certaines erreurs, ils restent capables de fournir des informations fiables sur l'ordre relatif d'acquisition des traits et la structure dynamique fondamentale des voies évolutives, même lorsque les processus réels sont réversibles.
Le papier présente abx_amr_simulator, un simulateur Python compatible avec l'API Gymnasium qui modélise la dynamique de la résistance aux antimicrobiens et permet d'optimiser les politiques de prescription d'antibiotiques grâce à l'apprentissage par renforcement dans un environnement contrôlé et incertain.
En caractérisant les jeux de distanciation sociale sous des dynamiques SI classiques, cet article démontre que l'équilibre de Nash unique est une stratégie « tout ou rien » (bang-bang) composée d'une phase d'attente suivie d'un confinement, qui coïncide également avec la politique publique optimale.
Cette étude théorique examine la compétition entre la croissance aléatoire multiplicative et la redistribution dans la limite des champs moyens, révélant que si une migration suffisante empêche la localisation pour des taux de croissance statiques, l'ajout de bruit temporel engendre une troisième phase partiellement localisée qui atténue mais ne supprime pas la concentration extrême, avec des implications pour la démographie et les inégalités de richesse.
Cet article présente une approche de modélisation hybride discrète-continu pour étudier les interactions entre le système immunitaire et les infections virales oncolytiques, démontrant que la stochasticité joue un rôle clé et que une réponse immunitaire trop précoce peut réduire l'efficacité de la thérapie.