⚗️ biochemistry

Breaking Barriers: Transitioning from X-ray Crystallography to Cryo-EM for Structural Studies

यह शोधपत्र ATAD2B प्रोटीन के अध्ययन के लिए एक्स-रे क्रिस्टलोग्राफी से क्रायो-इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी में एक प्रयोगशाला के सफल संक्रमण का विवरण देता है, जो जैव रासायनिक और तकनीकी चुनौतियों से पार पाने के व्यावहारिक रणनीतियों को रेखांकित करता है और इस परिवर्तनकारी तकनीक को अपनाने वाले संरचनात्मक जीवविज्ञानियों के लिए एक व्यापक वर्कफ़्लो मार्गदर्शिका प्रदान करता है।

Zafar, H., Malone, K. L., Singh, A. K., Cianfrocco, M. A., Glass, K. C.2026-02-25
⚗️ biochemistry

Flux organizations and control modes in antagonistically combined negative feedback loops

यह शोध पत्र इस बात की जांच करता है कि कैसे एक साझा चर पर दो प्रतिपक्षी (antagonistic) इंटीग्रल नियंत्रकों को संयोजित करने से विशिष्ट नियामक मोड—प्रत्याशित (delegated), पृथक (isolated), और मेटास्टेबल (metastable) नियंत्रण—निर्मित होते हैं, जो साइबेरियाई हैम्स्टर्स में फोटोपीरियडिक वजन परिवर्तन और रक्त ग्लूकोज होमियोस्टैसिस की जटिल गतिशीलता की व्याख्या करने वाले अनुप्रयोगों के साथ होमियोस्टैटिक और रियोस्टैटिक दोनों व्यवहारों को सक्षम बनाता है।

Ruoff, P.2026-02-25
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Distinct mechanisms of inhibition of Kv2 potassium channels by tetraethylammonium and RY785

यह अध्ययन यह प्रकट करने के लिए ऑल-एटम मॉलिक्यूलर डायनेमिक्स सिमुलेशन का उपयोग करता है कि जहाँ टेट्राएथिलअमोनियम चयनात्मकता फिल्टर (सेलेक्टिविटी फिल्टर) के पास ऑन-एक्सिस पर बंधकर Kv2.1 चैनलों को अवरुद्ध करता है, वहीं विशिष्ट अवरोधक RY785 चैनल की दीवारों पर ऑफ-एक्सिस बंधता है, जो एक सेमी-ओपन गेट अवस्था को स्थिर करता है जो आयन प्रवाह को बाधित करती है और दूरस्थ वोल्टेज सेंसर को प्रभावित करती है।

Zhang, S., Stix, R., Orabi, E. A., Bernhardt, N., Faraldo-Gomez, J. D.2026-02-24
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Targeting von Willebrand factor selectively under inflammatory conditions

यह अध्ययन एक उच्च-थ्रूपुट ELISA परख को मान्य करता है जो यह प्रदर्शित करता है कि दवा लुमाकाफ्टर सूजन संबंधी, ऑक्सीकरण स्थितियों के तहत वॉन विलेब्रांड कारक बंधन को चुनि적으로 रोकता है, जो रक्तस्राव के जोखिमों को कम करने वाले एंटी-थ्रॉम्बोटिक चिकित्सीय उपचार विकसित करने के लिए एक आशाजनक रणनीति प्रदान करता है।

Interlandi, G., Carter, V. S., Wang, Y., Fu, X., St. John, A., Le, J., Chen, J., Lopez, J. A.2026-02-24
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Change in topological linking number during Xer recombination at the plasmid pSC101 psi site

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि प्लाज्मिड pSC101 psi साइट पर Xer पुनर्संयोजन (recombination) एक सटीक टोपोलॉजिकल लिंकिंग नंबर परिवर्तन +4 के साथ आगे बढ़ता है, जो स्थिर प्लाज्मिड विरासत सुनिश्चित करने के लिए एक एंटीपैरेलल संरेखण और हॉलिडे जंक्शन मध्यवर्ती के माध्यम से चार नकारात्मक सुपरकॉइल्स को कैटेनेशन नोड्स में परिवर्तित करता है।

Provan, J. I., Tomatcheva, A. O., Sherratt, D. J., Colloms, S. D.2026-02-24
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Structural insight into sodium-dependent bile acid transport by members of the SLC10 family

यह अध्ययन एक ASBT होमोलॉग और एक ह्यूमनाइज्ड संस्करण की क्रिस्टल संरचनाओं को हल करता है ताकि यह प्रकट किया जा सके कि, NTCP के विपरीत, इन SLC10 परिवार के ट्रांसपोर्टर्स में एक लचीले TM6 हेलिक्स के कारण ट्रांसमेम्ब्रेन पोर (transmembrane pore) का अभाव है, और आणविक गतिशीलता सिमुलेशन आगे यह प्रदर्शित करते हैं कि कैसे झिल्ली लिपिड बड़े हाइड्रोफोबिक समूहों वाले पित्त अम्लों (bile acids) के परिवहन को सुगम बनाते हैं।

Li, C. Y., Grob, A., Repa, L., Huxley, O., Brotherton, D. H., Becker, P., Dadzie, R., Beckstein, O., Cameron, A. D.2026-02-23
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Rapid Histone Post-Translational Modification Analysis Using Alternative Proteases and Tandem Mass Tags

यह शोध पत्र RIPUP को प्रस्तुत करता है, जो Arg-C Ultra और r-Chymotrypsin पाचन को TMT लेबलिंग और HiP-Frag विश्लेषण के साथ संयोजित करने वाला एक तीव्र मल्टी-प्रोटीज वर्कफ़्लो है, जो हिस्टोन PTM नमूना तैयार करने की प्रक्रिया को दिनों से घटाकर घंटों में करने के साथ-साथ पहले से मायावी रहे एसाइलेशन (acylations) और वेरिएंट-विशिष्ट संशोधनों का पता लगाने के लिए कवरेज का महत्वपूर्ण विस्तार करता है।

Turner, N. P., Baboo, S., Garrett, P., Diedrich, J. K., Bajo, M., Roberto, M., Yates, J. R.2026-02-22
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Regulation of mitochondrial DNA homeostasis by a mitochondrial microprotein

यह अध्ययन AltSLC35A4 को, जो एक वैकल्पिक ओपन रीडिंग फ्रेम द्वारा कूटबद्ध (encoded) एक संरक्षित माइक्रोप्रोटीन है, माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए होमियोस्टेसिस के एक नवीन नियामक के रूप में पहचानता है जो प्रतिकृति या बायोएनेर्गेटिक अवस्थाओं से स्वतंत्र रूप से न्यूक्लियोइड के स्थानिक वितरण और प्रति संख्या को बनाए रखने के लिए एक्टोमायोसिन साइटोस्केलेटल घटकों के साथ अंतःक्रिया करता है।

Ajala, I., Lipuma, D., Bonnamour, G., Vanderperre, B.2026-02-21
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Linking biochemical and cellular efficacy of MERS coronavirus main protease inhibitors

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि जबकि कई डेटा विश्लेषण विधियाँ MERS-CoV मुख्य प्रोटीज अवरोधकों के लिए जैव रासायनिक निषेध (biochemical inhibition) को एंटीवायरल गतिविधि के साथ सह-संबद्ध कर सकती हैं, एक एंजाइम काइनेटिक्स मॉडल जो डाइमराइजेशन (dimerization) और द्विचरित सांद्रता-प्रतिक्रिया वक्रों (biphasic concentration-response curves) को ध्यान में रखता है, कोशिकीय प्रभावकारिता की सबसे सटीक भविष्यवाणी प्रदान करता है।

La, V. N. T., Lahav, N., Rodriguez, M., Diaz-Tapia, R., McGovern, B., Benjamin, J., Barr, H., Kang, L., Chodera, J. D. (…)2026-02-21
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The promoter-poised Rpd3 HDAC complex orchestrates global chromatin reprogramming upon nutrient transition

यह अध्ययन प्रकट करता है कि Rpd3L हिस्टोन डीएसेटिलेज कॉम्प्लेक्स *Saccharomyces cerevisiae* में एक मेटाबॉलिक गेटकीपर के रूप में कार्य करता है, जो पोषक तत्वों के बदलाव के दौरान सक्रिय प्रमोटरों से गतिशील रूप से H3K9 एसिटिलीकरण को हटाकर, विकास कार्यक्रमों को बंद करने और मेटाबॉलिक संक्रमणों के दौरान ट्रांसक्रिप्शनल फिडेलिटी सुनिश्चित करने का समन्वय करता है।

Bhattacharya, S., Sutter, B. M., Tu, B.2026-02-20