360 पेपर
लेखक एंजाइम-टूलकिट (Enzyme-tk) प्रस्तुत करते हैं, जो विशिष्ट प्रतिक्रियाओं के लिए पहले से अज्ञात एंजाइमों की खोज करने हेतु 23 ओपन-सोर्स टूल्स और दो नवीन विधियों (Func-e और Oligopoolio) को एकीकृत करने वाला एक एकीकृत पाइपलाइन है, जिसने DEHP और TPP जैसे मानव-निर्मित प्रदूषकों को नष्ट करने में सक्षम थर्मोस्टेबल उम्मीदवारों की सफलतापूर्वक पहचान की है।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि माइटोसिस के दौरान कंडेंसिन II (condensin II) का सक्रियण एक द्विभाजित तंत्र के माध्यम से संचालित होता है जहाँ प्रोटीन M18BP1, NCAPD3 पूंछ द्वारा होने वाले ऑटोइनहिबिशन (autoinhibition) को कम करता है और एक धनावेशित लूप के माध्यम से सीधे DNA एंकरिंग को बढ़ाता है, जिससे स्थिर गुणसूत्र संगठन संभव हो पाता है।
यह अध्ययन जौबर्ट सिंड्रोम प्रोटीन INPP5E के आणविक तंत्रों को स्पष्ट करता है, जिसमें ग्रोथ फैक्टर सिग्नलिंग रेगुलेटर्स के साथ इसके टायरोसिन फॉस्फोरिलेशन-निर्भर इंटरेक्टोम की पहचान की गई है और प्राइमरी सिलिया में PDGF और TGFβ मार्गों के इसके विभेदात्मक मॉड्यूलेशन को प्रदर्शित किया गया है।
यह शोध पत्र एक कम्प्यूटेशनल रूप से डिज़ाइन की गई प्रोटीन बाइंडर रणनीति प्रस्तुत करता है जो DHX9 हेलिकेज कोर और इसके dsRBD2 डोमेन के बीच ऑटोरेगुलेटरी इंटरफेस को लक्षित करती है ताकि कैंसर चिकित्सा के लिए विशेष रूप से DHX9 गतिविधि को बाधित किया जा सके, जो पारंपरिक लाइब्रेरी-आधारित स्क्रीनिंग विधियों का एक कुशल विकल्प प्रदान करता है।
यह शोध पत्र यह प्रदर्शित करके PROTACs और मॉलिक्यूलर ग्लूज़ में कूपरेटिविटी (सहकारिता) की परिभाषाओं से जुड़े विवाद को सुलझाता है कि "पार्शियल-एम्बेडेड" मॉडलों में देखी गई स्पष्ट नकारात्मक कूपरेटिविटी वास्तव में बड़े लिगेंड्स के उजागर द्रव्यमान (एक्सपोज़्ड मास) को प्रतिबंधित करने से होने वाला एक एंट्रोपिक दंड (एंट्रोपिक पेनल्टी) है, जिससे यह स्पष्ट होता है कि इस लिगेंड एंट्रॉपी लागत को घटाने के बाद वास्तविक सकारात्मक प्रोटीन-प्रोटीन इंटरेक्शन (PPI) कूपरेटिविटी मौजूद है।
यह शोध पत्र क्वांटल पीसीआर (quPCR) को प्रस्तुत करता है, जो एक नवीन कैलिब्रेटर-मुक्त विधि है जो सिस्टम के ऊष्मागतिक और गतिक गुणों से एक अंतर्निहित क्वांटल इकाई व्युत्पन्न करके एकल-अणु स्तर पर पूर्ण न्यूक्लिक एसिड प्रतिलिपि संख्या निर्धारित करती है।
यह अध्ययन व्यापक प्रोटिओमिक और ग्लाइकोमिक विश्लेषणों का उपयोग करता है यह प्रकट करने के लिए कि इन्फ्लुएंजा ए वायरस संक्रमण वायरल न्यूरामिनिडेज़ के माध्यम से व्यापक डिसायलियलेशन (desialylation) को प्रेरित करके और गॉल्जी ग्लाइकोप्रोटीन प्रवाह को बाधित करके मेजबान ग्लाइकोप्रोटीओम को महत्वपूर्ण रूप से पुनर्गठित करता है, जबकि साथ ही एक लंबे समय तक चलने वाले अनफोल्डेड प्रोटीन रिस्पॉन्स (unfolded protein response) को सक्रिय करता है जो ओलिगोमैनोस ग्लाइकोसिलेशन (oligomannose glycosylation) को बढ़ाता है।
यह अध्ययन ग्लाइकोप्रोटीओमिक्स, क्रायो-ईएम (cryo-EM), और सरफेस प्लास्मोन रेजोनेंस का उपयोग करके यह प्रदर्शित करता है कि अल्फाहर्पीसवायरस gB प्रोटीनों के एन- (N-) और ओ- (O-) लिंक्ड ग्लाइकन शील्ड्स, विशेष रूप से उनकी सियालिक एसिड सामग्री, होस्ट को-रिसेप्टर्स MAG, PILR, और NMHC-IIA के साथ बाइंडिंग को विभेदी रूप से नियंत्रित करते हैं, जिससे HSV-1, HSV-2, और VZV के बीच विशिष्ट ट्रॉपिज्म और संक्रामकता पैटर्न की व्याख्या होती है।
यह शोध पत्र एक पुनरावृत्ति नमूनाकरण ढांचे (iterative sampling framework) को प्रस्तुत करता है जो विविध, उच्च-गुणवत्ता वाले विशिष्ट प्रोटीन विन्यासों के संकलनों को कुशलतापूर्वक उत्पन्न करने के लिए सह-विकासवादी सूचना और अवशेष-विशिष्ट आवृत्तियों का लाभ उठाता है, जो फोल्ड-स्विचिंग प्रोटीनों के संरचनात्मक परिदृश्यों को चित्रित करने में मौजूदा विधियों से काफी बेहतर प्रदर्शन करता है।
यह अध्ययन दर्शाता है कि आहार संबंधी कोलेस्ट्रॉल लिपिड प्रोफाइल को बदलकर और एराकिडोनिक एसिड-प्रोस्टाग्लैंडिन E2 अक्ष को दबाकर, स्ट्रोक-प्रवण स्वतः उच्च रक्तचाप वाले चूहों में सिस्टोलिक रक्तचाप को कम करता है और गुर्दे की सूजन को कम करता है, जिससे इस मॉडल में इसके पहले से देखे गए जीवनकाल बढ़ाने वाले प्रभावों के लिए एक संभावित यांत्रिक स्पष्टीकरण प्रदान होता है।