💻 Category

bioinformatics

1188 पेपर

💻 जैव सूचना विज्ञान

An agentic AI environment to support biomedical research in collaborative academic environments

यह शोध पत्र मर्मुरेंट (Murmurent) को प्रस्तुत करता है, जो एक ओपन-सोर्स, साझा सॉफ्टवेयर वातावरण है जिसे विशेष एजेंट, टियर्ड मेमोरी (tiered memory), ट्रेसिबिलिटी और प्रवर्तित मानक संचालन प्रक्रियाओं (standard operating procedures) को प्रदान करके सहयोगात्मक बायोमेडिकल अनुसंधान का समर्थन करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जो एजेंटिक एआई (agentic AI) का उपयोग करने वाली शैक्षणिक प्रयोगशालाओं के लिए तकनीकी बाधाओं को कम करता है, जैसा कि पिन1 (Pin1) प्रोटीन के अवरोधकों की पहचान करने में इसके अनुप्रयोग के माध्यम से प्रदर्शित किया गया है।

Wu, T., Browne, T. S., Meawad, M., Emam, H. E., Simsam, N. H., Xia, Y., Jaafar, A., Ma, A., Kabbani, B., Gupta, V., Muca (…)2026-09-29
💻 जैव सूचना विज्ञान

Detecting Random Mutations in 16S rRNA Sequences

यह शोध पत्र संरक्षित रूपांकनों (conserved motifs) और गैप्ड k-mers का उपयोग करके एक नवीन वर्गीकरण पद्धति प्रस्तुत करता है जो प्राकृतिक जैविक डेटा की नकल करने वाले यादृच्छिक रूप से उत्परिवर्तित 16S rRNA अनुक्रमों का पता लगाने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जिससे AI-जनित या संशोधित अनुक्रमों द्वारा संभावित प्रदूषण से सार्वजनिक डेटाबेस को सुरक्षित रखने हेतु 90% से अधिक सटीकता प्राप्त होती है।

Haworth, R. M., Commichaux, S., Pop, M.2026-09-29
💻 जैव सूचना विज्ञान

Biological rationales from language models enable leakage-resistant forecasts of target-indication success

यह शोध पत्र PRIORITI को प्रस्तुत करता है, जो एक लीकेज-प्रतिरोधी (leakage-resistant) ढांचा है जो लक्ष्य-इंडिकेशन (target-indication) की सफलता के कैलिब्रेटेड और व्याख्यात्मक पूर्वानुमान उत्पन्न करने के लिए ड्रग-अग्नोस्टिक जैविक साक्ष्य को संश्लेषित करने हेतु डोमेन-निर्देशित लार्ज लैंग्वेज मॉडल्स का लाभ उठाता है, जो ऐतिहासिक और भविष्योन्मुखी दोनों मूल्यांकनों में मौजूदा बेसलाइन से बेहतर प्रदर्शन करता है।

Zhang, W., Xu, J., Zhang, Z., Liu, M., Sun, R., Al-lazikani, B., Shen, X., Kopetz, S., Wu, L., Zhao, B., Wu, C.2026-09-29
💻 जैव सूचना विज्ञान

PanVasc Research for AI assisted evidence analysis in panvascular intervention

यह शोध पत्र PanVasc Research को प्रस्तुत करता है, जो पैनवैस्कुलर हस्तक्षेपों (panvascular interventions) में एआई-सहायता प्राप्त साक्ष्य विश्लेषण के लिए एक निष्पादन योग्य ढांचा है, जो नियंत्रित प्रयोगों के माध्यम से स्रोत निष्ठा और अर्थ संबंधी सटीकता बनाए रखने की एक स्थानीय Qwen3-4B मॉडल की क्षमता का मूल्यांकन करता है, और अंततः स्वायत्त वैज्ञानिक खोज का दावा करने के बजाय डोमेन-विशिष्ट एनोटेशन और सत्यापन की आवश्यकता पर प्रकाश डालता है।

You, L., Guo, Y., Wang, W., Peng, Z., Zhong, X., Shen, L., Ge, J.2026-09-28
💻 जैव सूचना विज्ञान

Perfect 21-nucleotide matches to beneficial fungi are common in canonical antifungal dsRNA targets: an in-silico off-target hazard screen for spray-induced gene silencing

यह अध्ययन प्रकट करता है कि स्प्रे-प्रेरित जीन साइलेंसिंग में उपयोग किए जाने वाले मानक एंटिफंगल dsRNA लक्ष्य अक्सर लाभकारी कवक के साथ पूर्ण 21-न्यूक्लियोटाइड मिलान रखते हैं, जो एक महत्वपूर्ण ऑफ-टारगेट खतरे का संकेत देते जिसे वर्तमान नियामक स्क्रीनिंग पैनल पहचानने में विफल रहते हैं।

Wasif, M., Tarcali, G., Khan, M. A., Saleem, H., Azmat, M. A.2026-09-28
💻 जैव सूचना विज्ञान

ProcessNets: Towards an efficient approach for ensemble analysis of biological networks

यह शोध पत्र ProcessNets को प्रस्तुत करता है, जो एक nc-tree नामक नवीन फाइलोगेनी-समान डेटा संरचना का उपयोग करने वाला एक ढांचा है, जो समान जैविक नेटवर्क के एंसेम्बल्स (ensembles) में नेटवर्क गुणों को संक्षिप्त रूप से प्रदर्शित करने और कुशलतापूर्वक गणना करने के लिए, पारंपरिक स्वतंत्र विश्लेषण विधियों की तुलना में महत्वपूर्ण स्थान और समय की बचत करता है।

Mahapatra, S., Narayanan, M.2026-09-28
💻 जैव सूचना विज्ञान

vep-rs: high-throughput Rust variant annotation with population-scale concordance to Ensembl VEP

vep-rs, Ensembl VEP का एक उच्च-थ्रूपुट (high-throughput) Rust पुनर्कल्पन है जो लाखों वेरिएंट्स में मूल टूल के साथ लगभग पूर्ण समानता प्राप्त करता है और 78x से 284x तेज़ प्रदर्शन प्रदान करते हुए Perl कार्यान्वयन में कई प्रलेखित दोषों को सुधारता है।

Porter, M., Borkowski, R.2026-09-28
💻 जैव सूचना विज्ञान

When label-free morphology is sufficient for targeted cellular measurements

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि लेबल-मुक्त कोशिकीय आकारिकी (सेलुलर मॉर्फोलॉजी) विशिष्ट संदर्भों में लक्षित फ्लोरोसेंट मापों के लिए प्रभावी रूप से प्रतिस्थापन कर सकती है, जैसा कि विविध स्क्रीन्स में अधिकांश प्रबल जीन नॉकआउट हिट्स को पुनः प्राप्त करने और महत्वपूर्ण चयापचय हानियों वाले यौगिकों को प्राथमिकता देने की इसकी क्षमता से सिद्ध होता है, हालांकि इसकी पर्याप्तता अंततः केवल भविष्य कहनेवाला सहसंबंध (प्रेडिक्टिव कोरिलेशन) के बजाय विशिष्ट लक्ष्य, भविष्यवक्ता और वैज्ञानिक कार्य पर निर्भर करती है।

Li, M., Zhu, J., Li, B., Zhang, C., Tang, Z., Wang, J., Xing, W., Zhang, B., Xu, J., Meng, L., Zhang, B., Chen, J., Zhan (…)2026-09-28
💻 जैव सूचना विज्ञान

Targeted finetuning enables co-folding models to learn ligand-induced protein conformational states

यह शोध पत्र प्रदर्शित करता है कि बोलत्ज़-1 (Boltz-1) जैसे फाउंडेशन मॉडल्स की लक्षित फाइन-ट्यूनिंग (targeted finetuning), प्रशिक्षण डेटा के पूर्वाग्रहों (training data biases) को दूर करके, नवीन लिगैंड-प्रेरित प्रोटीन कन्फर्मेशनल अवस्थाओं (ligand-induced protein conformational states) और एलोस्टेरिक बाइंडिंग साइटों (allosteric binding sites) की सटीक भविष्यवाणी कर सकती है, जिससे अधिक प्रभावी ड्रग डिस्कवरी अनुप्रयोगों को सक्षम बनाया जा सकता है।

Gorantla, R., Schleberger, C., Sesterhenn, F.2026-09-27
💻 जैव सूचना विज्ञान

Benchmarking single-cell foundation models for aging biology

यह अध्ययन 2.5 मिलियन ट्रांसक्रिप्टोम में दस सामान्य-उद्देश्यीय और तीन उम्र-विशिष्ट सिंगल-सेल फाउंडेशन मॉडल्स का बेंचमार्किंग करता है, जो यह प्रकट करता है कि हालांकि उनका प्रदर्शन कार्य के अनुसार भिन्न होता है, वे उम्र बढ़ने के अनुसंधान के लिए विशिष्ट लाभ प्रदान करते हैं, विशेष रूप से क्रोनोलॉजिकल आयु की भविष्यवाणी करने, दुर्लभ सेलुलर अवस्थाओं की पहचान करने और नियामक अंतःक्रियाओं को पुनः प्राप्त करने में।

Ni, X., Liang, Y., Zhu, J., Zhang, L., Shen, X., Yang, M., Xu, R., Li, H., Ji, R., Jin, C., Ni, S.2026-09-27