bioinformatics पेपर

Discovery of Selective Nrf2 Activators from Natural Products: AComputational Screening Approach to Minimize Off-Target Effects on PXR and CYP2D6

यह अध्ययन लगभग 630,000 प्राकृतिक उत्पादों की एक बड़े पैमाने पर कम्प्यूटेशनल स्क्रीनिंग प्रस्तुत करता है, जिसमें 10 अति-चयनात्मक (ultraseelective) Nrf2 सक्रियकर्ताओं की पहचान करने के लिए एक नवीन तीन-स्तरीय चयनात्मकता रणनीति का उपयोग किया गया है जो PXR और CYP2D6 के साथ ऑफ-टारगेट इंटरैक्शन को न्यूनतम करते हुए प्रभावी रूप से KEAP1 से बंधते हैं, जिससे ऑक्सीडेटिव स्ट्रेस से संबंधित रोगों के लिए सुरक्षित उपचार विकसित करने हेतु एक आशाजनक मार्ग प्राप्त होता है।

Wang, Y., Gong, Y., Li, R., Li, Z., Cai, H., Fan, L., Ma, H.2026-04-15

💻 bioinformatics

Benchmarking precision matrix estimation methods for differential co-expression network analysis

यह शोध पत्र सिम्युलेटेड डेटा का उपयोग करके डिफरेंशियल को-एक्सप्रेशन नेटवर्क विश्लेषण के लिए विभिन्न प्रिसिजन मैट्रिक्स अनुमान विधियों का बेंचमार्किंग करता है, जो यह प्रकट करता है कि प्रदर्शन विशिष्ट डेटा विशेषताओं पर अत्यधिक निर्भर है और GLassoElnetFast को सबसे सटीक विधि के रूप में पहचानते हुए भ्रामक निष्कर्षों से बचने के लिए व्यापक मूल्यांकन ढांचे की आवश्यकता पर बल देता है।

Overmann, M., Grabert, G., Kacprowski, T.2026-04-15

💻 bioinformatics

Sex-biased gene expression shapes sex differences in gene essentiality

यह अध्ययन लिंग-पक्षपाती ट्रांसक्रिप्टोमिक प्रोफाइल को CRISPR स्क्रीन्स के साथ एकीकृत करता है ताकि यह प्रकट किया जा सके कि जबकि लिंग-पक्षपाती जीन अभिव्यक्ति जीन की अनिवार्यता में लिंग संबंधी अंतर को प्रभावित कर सकती है, लिंग-पक्षपाती कार्यात्मक निर्भरता मुख्य रूप से प्रत्यक्ष, अभिव्यक्ति-स्वतंत्र प्रभावों द्वारा संचालित होती है, विशेष रूप से X गुणसूत्र पर जहाँ खुराक (dosage) एक प्रमुख भूमिका निभाती है।

Rocca, C., DeCasien, A. R.2026-04-15

💻 bioinformatics

Beyond Structure and Affinity: Context-Dependent Signals for de novo Binder Success

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि जीवविज्ञान-सूचित अनुक्रम विशेषताओं—विशेष रूप से वे जो एकत्रीकरण प्रवृत्ति (aggregation propensity), टोपोलॉजी और संदर्भ-निर्भर संकेतों को कैप्चर करती हैं—को एकीकृत करने से पारंपरिक संरचना- और आत्मीयता-आधारित मूल्यांकनों की तुलना में 'डी नोवो' प्रोटीन बाइंडर डिजाइनों की प्रयोगात्मक सफलता दर में महत्वपूर्ण सुधार होता है।

Bozkurt, C.2026-04-15

💻 bioinformatics

Decoding Single-Cell Omics of Perturbation Responses Using DeSCOPE

DeSCOPE एक हल्का कंडीशनल वेरिएशनल ऑटोएन्कोडर फ्रेमवर्क है जो अनदेखे जीन, सेल प्रकारों और संयोजी बहु-जीन परिदृश्यों में आनुवंशिक परिवर्तनों के प्रति सिंगल-सेल प्रतिक्रियाओं की भविष्यवाणी करने में मौजूदा बेसलाइन से बेहतर प्रदर्शन करता है, जो चिकित्सीय लक्ष्य डिजाइन के लिए एक बहुमुखी मल्टी-मोडल वर्चुअल सेल मॉडल के रूप में कार्य करता है।

Wu, P., Wei, H., Li, Y., Zheng, X., Zhou, C., Hu, X., Wang, C.2026-04-15

💻 bioinformatics

Differential co-localisation analysis of multi-sample and multi-condition experiments with spatialFDA

यह शोध पत्र spatialFDA को प्रस्तुत करता है, जो एक ओपन-सोर्स Bioconductor R पैकेज है जो स्थानिक सांख्यिकी (spatial statistics) और कार्यात्मक डेटा विश्लेषण (functional data analysis) को एकीकृत करता है ताकि स्थानिक ओमिक्स डेटा में कई स्थितियों के बीच कोशिकीय सह-स्थानीयकरण (cellular co-localization) के अंतर को सटीक रूप से परिमाणित और परीक्षण किया जा सके, जो सिमुलेशन और टाइप-1 मधुमेह में जैविक अनुप्रयोगों के माध्यम से इसकी प्रभावशीलता को प्रदर्शित करता है।

Emons, M., Scheipl, F., Gunz, S., Purdom, E., Robinson, M. D.2026-04-15

💻 bioinformatics

Predicting Antibody Self-Association with Sequence Structure Fusion Models: The Central Role of CSI-BLI in Early Developability Screening

यह अध्ययन एक एंड-टू-एंड डीप लर्निंग फ्रेमवर्क प्रस्तुत करता है जो एंटीबॉडी सेल्फ-एसोसिएशन (CSI-BLI द्वारा मापा गया) की सटीक भविष्यवाणी करने के लिए फाइन-ट्यून्ड प्रोटीन लैंग्वेज मॉडल्स को अल्फाफोल्ड-व्युत्पन्न 3D स्ट्रक्चरल ग्राफ्स के साथ फ्यूज करता है, जो यह प्रदर्शित करता है कि अनुक्रम (sequence) और स्थानिक संदर्भ (spatial context) को एकीकृत करना केवल अनुक्रम-आधारित बेसलाइन्स की तुलना में काफी बेहतर प्रदर्शन करता है और चार्ज एवं हाइड्रोफोबिसिटी जैसे प्रमुख डेवेलोपेबिलिटी ड्राइवर्स के बारे में व्याख्यात्मक अंतर्दृष्टि प्रदान करता है।

Ahmed, S., Devalle, F., Leisen, L., Pham, T., Amofah, B., Lee, A., Hutchinson, M., Chakiath, C., DiChiara, J., Farzandh (…)2026-04-15

💻 bioinformatics

Testing and Estimating Causal Treatment Effect Heterogeneity in Observational Studies via Revised Deep Semiparametric Regression: A Lung Transplant Case Study

यह शोध पत्र deepHTL को प्रस्तुत करता है, जो एक गहरा अर्ध-पैरामीट्रिक प्रतिगमन ढांचा (deep semiparametric regression framework) है जो अवलोकनात्मक अध्ययनों में कारण उपचार प्रभाव विषमता (causal treatment effect heterogeneity) का प्रभावी ढंग से परीक्षण और अनुमान लगाता है, जो सिमुलेशन में मौजूदा विधियों पर इसकी श्रेष्ठता को प्रदर्शित करता है और यह प्रकट करता है कि कम उम्र के, कम जोखिम वाले फेफड़े प्रत्यारोपण प्राप्तकर्ता, एकल फेफड़े के प्रत्यारोपण की तुलना में द्विपक्षीय फेफड़े प्रत्यारोपण से काफी अधिक कार्यात्मक लाभ प्राप्त करते हैं।

Yuan, S., Zou, F., Zou, B.2026-04-15

💻 bioinformatics

From Movement to METs: A Validation of ActTrust(R) for Energy Expenditure Estimation and Physical Activity Classification in Young Adults

यह अध्ययन एक्टट्रस्ट (ActTrust®) एक्सेलेरोमीटर को युवा वयस्कों में ऊर्जा व्यय का अनुमान लगाने और शारीरिक गतिविधि की तीव्रता को वर्गीकृत करने के लिए एक सरल, लागत प्रभावी उपकरण के रूप में मान्य करता है, जो ट्रेडमिल की गति और मेटाबॉलिक इक्विवेलेंट्स के साथ इसके मजबूत सहसंबंध, साथ ही व्यापक रूप से उपयोग किए जाने वाले एक्टिग्राफ (Actigraph®) GT3X+ के तुलनीय गतिविधि स्तरों की भविष्यवाणी करने में इसकी उच्च सटीकता को प्रदर्शित करता है।

dos Santos Batista, E., Basilio Gomes, S. R., Bruno de Morais Ferreira, A., Franca, L. G. S., Fontenele Araujo, J., Mort (…)2026-04-14

💻 bioinformatics

Beyond Single Algorithms: A Framework for Validating and Aggregating Active Modules in Genetic Interaction Networks

यह शोध पत्र एक ऐसे ढांचे को प्रस्तुत करता है जो स्पेक्ट्रल क्लस्टरिंग और ग्रीडी कंडक्टेंस-आधारित मर्जिंग (Greedy Conductance-based Merging) का उपयोग करके कई एक्टिव मॉड्यूल आइडेंटिफिकेशन एल्गोरिदम के विशिष्ट आउटपुट को मान्य और एकत्रित करता है, ताकि एकल-एल्गोरिदम दृष्टिकोण की सीमाओं को दूर किया जा सके और जेनेटिक इंटरेक्शन नेटवर्क में छिपे हुए जीन्स सहित सुसंगत जैविक मॉड्यूलों को प्रकट किया जा सके।

Liu, J., Xu, M., Xing, J.2026-04-14

← पिछला अगला →