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यह शोध पत्र प्रदर्शित करता है कि AI फाउंडेशनल मॉडल Boltz-2 वर्चुअल स्क्रीनिंग में मौजूदा रीस्कोरिंग रणनीतियों से काफी बेहतर प्रदर्शन करता है, जो चुनौतीपूर्ण डेटासेट्स पर सफलता की दर को दोगुना करने और कमोडिटी हार्डवेयर पर लाखों यौगिकों की सटीक एवं कुशल रैंकिंग सक्षम करने में सफल रहा है।
यह शोध पत्र SIR को प्रस्तुत करता है, जो एक नॉनपैरामेट्रिक फ्रेमवर्क है जो सांख्यिकीय रूप से कठोर और पुनरुत्पादक ड्रग सिनर्जी टेस्टिंग प्रदान करने के लिए 2D आइसोटोनिक रिग्रेशन को वाइल्ड बूटस्ट्रैप प्रक्रिया के साथ जोड़ता है, जो सहमति (concordance), मजबूती (robustness) और लुप्त डेटा की भविष्यवाणी करने में मौजूदा विधियों से बेहतर प्रदर्शन करता है।
यह शोध पत्र CosMxScope को प्रस्तुत करता है, जो एक ओपन-सोर्स पायथन फ्रेमवर्क है जो इमेज टाइल्स को जोड़ने, स्थानिक निर्देशांकों (spatial coordinates) को QuPath अनुकूलता के लिए GeoJSON में बदलने और सेल मॉर्फोलॉजी के साथ जीन एक्सप्रेशन के इंटरैक्टिव विज़ुअलाइज़ेशन को सक्षम करके CosMx Spatial Molecular Imager डेटा और डिजिटल पैथोलॉजी टूल्स के बीच के अंतर को पाटता है।
ट्रैक हब क्विकलोड ट्रांसलेटर एक निःशुल्क उपलब्ध पायथन-आधारित वेब एप्लिकेशन है जो UCSC जीनोम ब्राउज़र ट्रैक हब्स और इंटीग्रेटेड जीनोम ब्राउज़र क्विकलोड प्रारूपों के बीच डेटा को परिवर्तित करता है, जिससे शोधकर्ता किसी भी ब्राउज़र में दस-हजारों प्रकाशित जीनोम असेंबली को विज़ुअलाइज़ करने में सक्षम होते हैं।
यह शोध पत्र VaLPAS को प्रस्तुत करता है, जो एक पायथन-आधारित फ्रेमवर्क है जो ज्ञात कार्य वाले अणुओं के साथ जुड़ाव की पहचान करके अज्ञात प्रोटीनों के कार्यों की भविष्यवाणी करने के लिए मल्टी-ओमिक्स डेटा में भिन्नता का लाभ उठाता है, जिससे प्रोटीन स्थान में "फंक्शनल डार्क मैटर" की समस्या का समाधान होता है।
यह शोध पत्र MOAflow प्रस्तुत करता है, जो एक पुन: इंजीनियर किया गया, कंटेनराइज्ड Nextflow पाइपलाइन है जो मूल परिणामों के साथ निरंतरता बनाए रखते हुए MOA-seq डेटा विश्लेषण की स्केलेबिलिटी, पुनरुत्पादकता और पोर्टेबिलिटी को बढ़ाता है।
यह अध्ययन एआई प्रोटीन संरचना भविष्यवाणियों का उपयोग करके यह प्रदर्शित करता है कि कशेरुकी टीएलआर2 (TLR2) में हाइड्रोफोबिक लिगैंड-बाइंडिंग कैविटी एक विकासवादी रूप से संरक्षित विशेषता है जो रोगजनक पहचान के लिए आवश्यक है, जबकि यह भी प्रकट करता है कि इनवर्टिब्रेट टीएलआर (invertebrate TLRs) और अन्य एलआरआर (LRR) डोमेन में समान कैविटी साझा पूर्वज के बजाय स्वतंत्र अभिसारी विकास (convergent evolution) के माध्यम से उत्पन्न हुई हैं।
CLOP-DiT एक नवीन तीन-चरणीय पाइपलाइन है जो संरचित जैविक मेटाडेटा से यथार्थवादी, टेक्स्ट-निर्देशित सिंगल-सेल ट्रांसक्रिप्टोमिक प्रोफाइल उत्पन्न करने के लिए कंट्रास्टिव लैंग्वेज-ओमिक्स प्रीट्रेनिंग और कंडीशनल डिफ्यूजन ट्रांसफॉर्मर्स का लाभ उठाती है, जो क्रॉस-डेटासेट परिवर्तनशीलता को पुनरुत्पादित करने में वर्तमान सीमाओं को पारदर्शी रूप से स्वीकार करते हुए नियंत्रित सेल-स्टेट सिमुलेशन की व्यवहार्यता को प्रदर्शित करती है।
इस अध्ययन ने एक सिंथेटिक GluN1-मिमेटिक पेप्टाइड को कम्प्यूटेशनल रूप से डिजाइन और मूल्यांकित किया जो एक स्कैम्बल नियंत्रण की तुलना में रोगजनक ऑटोएंटीबॉडीज के प्रति काफी मजबूत अनुमानित बाइंडिंग एफिनिटी प्रदर्शित करता है, जो एंटी-NMDAR ऑटोइम्यून एन्सेफलाइटिस के उपचार के लिए पेप्टाइड डिकॉय विकसित करने के लिए एक स्केलेबल रूपरेखा स्थापित करता है।
यह शोध पत्र Cellector को प्रस्तुत करता है, जो सिंगल-सेल आरएनए सीक्वेंसिंग डेटा में दुर्लभ विदेशी जीनोटाइप कोशिकाओं का सटीक रूप से पता लगाने के लिए डिज़ाइन किया गया एक कम्प्यूटेशनल टूल है, जो ट्रांसप्लांट के बाद ल्यूकेमिया रोगियों में मापने योग्य अवशिष्ट रोग की पहचान करने और उच्च संवेदनशीलता के साथ माइक्रोकाइमेरिज्म के विश्लेषण को सक्षम बनाता है।