💻 जैव सूचना विज्ञान

MetaHarmonizer: robust biomedical metadata harmonization and a contamination control for inflated LLM performance on public benchmarks

MetaHarmonizer एक सुदृढ़, पूर्णतः स्थानीय और नियतात्मक स्वचालित प्रणाली है जो बायोमेडिकल मेटाडेटा सामंजस्य के लिए नियंत्रित शब्दावलियों के साथ एक बहु-चरणीय कैस्केड को संयोजित करती है ताकि मतिभ्रम (hallucinations) और अतिरंजित बेंचमार्क प्रदर्शन को रोका जा सके, जिससे स्कीमा और ऑन्टोलॉजी मैपिंग में अत्याधुनिक सटीकता प्राप्त होती है और सिद्धांतिक मानव-इन-द-लूप ट्राइएज सक्षम होता है।

Li, C., Dahl, A., Gravel-Pucillo, K. D., Long, K., Waters, M., de Bruijin, I., Davis, S., Oh, S.2026-06-17
💻 जैव सूचना विज्ञान

VLab4Mic: prediction of structural resolvability in super-resolution microscopy

VLab4Mic एक सिमुलेशन प्लेटफॉर्म है जो विभिन्न सुपर-रेज़ोल्यूशन माइक्रोस्कोपी मोडैलिटीज के माध्यम से प्रोटीन असेंबली की संरचनात्मक रिज़ॉल्वेबिलिटी (resolvability) की भविष्यवाणी करने के लिए प्रोब प्लेसमेंट और स्टेरिक बाधाओं (steric constraints) को मॉडल करता है, जिससे शोधकर्ताओं को भौतिक प्रयोग करने से पहले प्रयोगात्मक व्यवहार्यता का आकलन करने में सक्षम बनाया जा सके।

Martinez, D., Saraiva, B. M., Shakespeare, T., Bates, M., Owen, D. M., Leterrier, C., Del Rosario, M., Henriques, R.2026-06-16
💻 जैव सूचना विज्ञान

THEOBROMA: an aggregated open database of 1.13 million natural products with per-compound license auditing, three-tier classification, and stereochemistry-aware deduplication

THEOBROMA 29 स्रोतों से 1.13 मिलियन से अधिक प्राकृतिक उत्पादों को एकत्रित करने वाला एक खुला डेटाबेस है जो लाइसेंस-अनुपालन वर्चुअल स्क्रीनिंग और आइसोमर-विशिष्ट जैव-सक्रियता विश्लेषण को सक्षम करने के लिए प्रति-यौगिक लाइसेंस ऑडिटिंग, एक त्रि-स्तरीय वर्गीकरण प्रणाली और स्टीरियोकेमिस्ट्री-जागरूक डीडुप्लीकेशन के माध्यम से स्वयं को विशिष्ट बनाता है।

Klamt, T., Jaczkowski, A., Franke, J., Nejdl, W.2026-06-16
💻 जैव सूचना विज्ञान

Rapid and consistent clustering of millions of genomes highlights the diversity of prokaryotic life

लेखक gemsparcl प्रस्तुत करते हैं, जो एक अत्यधिक स्केलेबल और कुशल उपकरण है जो लगभग 14 घंटों में 5.6 मिलियन से अधिक जीवाणु जीनोम को 92,954 प्रजाति-स्तर की जीनोमिक सुसंगत इकाइयों में क्लस्टर करता है, जिससे प्रोकैरियोटिक विविधता और वर्गीकरण के व्यापक, संदर्भ-मुक्त विश्लेषण को सक्षम करने के लिए कम्प्यूटेशनल बाधाओं को दूर किया जा सके।

von Wachsmann, J. H., Lorenz, L. J., Gurbich, T. A., Russell, M. J., Rodriguez Bouza, V., Horsfield, S. T., Lees, J. A. (…)2026-06-15
💻 जैव सूचना विज्ञान

Biological meaning in protein embedding space is resolution-dependent

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि प्रोटीन लैंग्वेज मॉडल एम्बेडिंग्स का जैविक अर्थ स्थिर नहीं है बल्कि रिज़ॉल्यूशन-निर्भर है, जहाँ जैविक पदानुक्रमों के साथ विभिन्न संरेखण स्तर सदस्यता सीमाओं, कार्यात्मक समूहों या स्थानीय पारिवारिक संरचनाओं जैसे विशिष्ट संगठनात्मक संबंधों को चुनिंदा रूप से संरक्षित करते हैं।

Zong, L., Ren, J., Li, Y., Finn, R. D., Wang, J.2026-06-15
💻 जैव सूचना विज्ञान

WitChi: Efficient Detection and Pruning of Compositional Bias in Phylogenomic Alignments Using Empirical Chi-Squared Testing

WitChi एक गणनात्मक रूप से कुशल उपकरण है जो बड़े पैमाने के फाइलोगेनोमिक संरेखणों (phylogenomic alignments) से संरचनात्मक रूप से पक्षपाती स्थलों का पता लगाने और उन्हें पुनरावृत्ति के माध्यम से हटाने के लिए अनुभवजन्य ची-स्क्वेर्ड परीक्षण (empirical chi-squared testing) का उपयोग करता है, जिससे जटिल संरचना-जागरूक मॉडलों की उच्च गणना लागत के बिना सटीक फाइलोगेनेटिक टोपोलॉजी को पुनर्स्थापित किया जा सके।

Koestlbacher, S., Panagiotou, K., Tamarit, D., Ettema, T.2026-06-13
💻 जैव सूचना विज्ञान

Testing the reliability of AI-generated protein structures

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि अल्फाफोल्ड2 (AlphaFold2) और कोलबफोल्ड (ColabFold) गैर-प्रोटीन अनुक्रमों के लिए संरचनाओं की भविष्यवाणी करते समय बहुत कम फॉल्स पॉजिटिव दर प्रदर्शित करते हैं, जबकि संयोगवश यह भी प्रकट करते हैं कि गैर-कोडिंग मानव जीनोमिक क्षेत्रों में कुछ उच्च-स्कोरिंग भविष्यवाणियाँ पहले से अज्ञात छद्म जीन (pseudogenes) के अनुरूप हैं, जो मौजूदा जीन एनोटेशन में संभावित त्रुटियों का सुझाव देती हैं और आगे की जांच के लिए उच्च-स्कोरिंग संरचनात्मक भविष्यवाणियों की उपयोगिता को प्रमाणित करती हैं।

Xu, A., Salzberg, S.2026-06-13
💻 जैव सूचना विज्ञान

ADMETron: An AI-driven SaaS platform for comprehensive ADMET prediction and compound prioritisation

ADMETron एक AI-संचालित SaaS प्लेटफॉर्म है जो 34 ADMET एंडपॉइंट्स की भविष्यवाणी करने के लिए RNN-व्युत्पन्न आणविक एम्बेडिंग को ग्रेडिएंट बूस्टिंग मशीनों के साथ एकीकृत करता है और इसमें एक इंटरैक्टिव रडार ग्राफ विज़ुअलाइज़ेशन टूल है, जो ड्रग डिस्कवरी में व्यापक, उच्च-थ्रूपुट यौगिक प्राथमिकता और डेटा-संचालित निर्णय लेने में सक्षम बनाता है।

Nair, D. N., Yadav, R. S., Jondhale, P. M., Didhate, S., Gunjal, G., Ranjit, A., Patil, P., Dawande, A., Shisode, A., Bh (…)2026-06-13
💻 जैव सूचना विज्ञान

MoE-Bind: Guiding De Novo Protein Binder Generation with Sparse Experts

MoE-Bind ने डे नोवो (de novo) प्रोटीन बाइंडर जनरेशन के लिए पहले स्पार्स मिक्स्चर-ऑफ-एक्सपर्ट्स आर्किटेक्चर को पेश किया है, जो पूर्व संरचनात्मक जानकारी की आवश्यकता के बिना, डेंस बेसलाइन्स के बराबर या उनसे बेहतर, तेज़, अधिक कुशल और व्याख्या योग्य सीक्वेंस-ओनली डिज़ाइन प्राप्त करता है।

Sarkar, D., Sarkar, C.2026-06-13
💻 जैव सूचना विज्ञान

Revealing trajectories of multi-modal voxel-level changes in neurodegenerative diseases using latent event mapping

यह शोध पत्र लेटेंट इवेंट मैपिंग (LEMING) को प्रस्तुत करता है, जो एक स्केलेबल और व्याख्यात्मक अनसुपरवाइज्ड मॉडलिंग तकनीक है जो अल्जाइमर रोग में मल्टी-मोडल न्यूरोइमेजिंग परिवर्तनों के वोक्सेल-स्तरीय प्रक्षेपवक्रों (trajectories) को पुनर्गठित करती है, जिससे एसीटाइलकोलाइन रिसेप्टर घनत्व और अमाइलॉइड पैथोलॉजी के बीच देर-चरण के जुड़ाव जैसे प्रगति-निर्भर तंत्रों में नई अंतर्दृष्टि प्राप्त होती है।

Pinnawala, S., Hartanto, A., Jairamani, M., Simpson, I. J. A., Wijeratne, P. A.2026-06-11