1211 पेपर
लगभग 20 लाख जीवाणु जीनोम के बड़े पैमाने पर लक्षित जीनोम माइनिंग को संरचना-निर्देशित मॉडलिंग के साथ एकीकृत करके, यह अध्ययन 900 से अधिक अनिश्चित 7-डीएज़ाप्यूरीन (7-deazapurine) जैव-संश्लेषण जीन क्लस्टर का अनावरण करता है और उनके संरचनात्मक विविधीकरण को चलाने वाले एंजाइमी तंत्रों को स्पष्ट करता है।
DOME Copilot एक स्केलेबल, लार्ज लैंग्वेज मॉडल-आधारित समाधान है जिसे पांडुलिपियों से संरचित विधि रिपोर्ट को स्वचालित रूप से निकालकर वैश्विक AI साहित्य की व्याख्या और एनोटेट करने के माध्यम से जीवन विज्ञान में आर्टिफिशियल इंटेलिजेंस की पारदर्शिता और पुनरुत्पादकता को बढ़ाने के लिए डिज़ाइन किया गया है।
यह अध्ययन एक उच्च-विश्वास डेटासेट और ACMG/AMP-अनुपालन स्कोर थ्रेशोल्ड स्थापित करने के लिए एक सांख्यिकीय ढांचे का उपयोग करके आठ कम्प्यूटेशनल प्रेडिक्टर्स को कैलिब्रेट करके इन-फ्रेम इंडेल्स (in-frame indels) के लिए नैदानिक व्याख्या अंतराल को संबोधित करता है, जो मिसेंस वेरिएंट टूल्स की तुलना में वर्तमान में उनके निम्न प्रदर्शन को उजागर करते हुए उनकी मापने योग्य उपयोगिता को प्रदर्शित करता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि इम्यून चेकपॉइंट इनहिबिटर्स से उपचारित विषम पैन-कैंसर कोहॉर्ट्स में, नैदानिक चर जीवित रहने की भविष्यवाणी करने में ट्यूमर म्यूटेशनल बर्डन जैसे जीनोमिक लक्षणों से काफी बेहतर और अधिक प्रभावी सिद्ध होते हैं, जो वर्तमान भविष्य कहने वाले मॉडलों में होल-जीनोम सीक्वेंसिंग डेटा को एकीकृत करने के अतिरिक्त मूल्य की मौलिक संरचनात्मक सीमाओं को प्रकट करते हैं।
यह शोध पत्र LagCI को प्रस्तुत करता है, जो एक ऐसा कम्प्यूटेशनल ढांचा है जो सघन मल्टी-ओमिक समय-श्रृंखला डेटा (dense multi-omic time-series data) से सुदृढ़, समय-विलंबित (time-lagged) कारण संबंधी संबंधों का अनुमान लगाने के लिए स्पार्स सैंपलिंग और मौजूदा विधियों की सीमाओं को दूर करता है, और चयापचय एवं प्रतिरक्षा प्रतिक्रियाओं को संचालित करने वाले आणविक अंतःक्रियाओं के एक विशाल नेटवर्क की सफलतापूर्वक पहचान करता है।
यह शोध पत्र यह प्रदर्शित करता है कि सामान्यीकृत लोटका-वोल्टेरा मॉडलों में स्थानिक संरचना को सम्मिलित करने से सैद्धांतिक भविष्यवाणियों और अनुभवजन्य अवलोकनों के बीच के विसंगति का समाधान होता है, यह दिखाते हुए कि विशिष्ट जैविक तंत्रों के बजाय एक खंडित परिदृश्य में सूक्ष्मजीव प्रचुरता का समूहन, मैक्रोइकोलॉजिकल पैटर्न में देखे जाने वाले सार्वभौमिक गामा वितरण को उत्पन्न करता है।
यह शोध पत्र PeptideCLM-2 को प्रस्तुत करता है, जो एक रासायनिक भाषा मॉडल है जिसे जटिल पेप्टाइड रसायन विज्ञान का मूल रूप से प्रतिनिधित्व करने और प्रमुख विकास संबंधी परिणामों (endpoints) की भविष्यवाणी करने में मौजूदा विधियों से बेहतर प्रदर्शन करने के लिए 10 करोड़ से अधिक अणुओं पर प्रशिक्षित किया गया है, ताकि चिकित्सीय पेप्टाइड इंजीनियरिंग में कम्प्यूटेशनल अंतर को पाटा जा सके।
यह शोध पत्र एक एजेंट-निर्देशित कम्प्यूटेशनल वर्कफ़्लो प्रस्तुत करता है जिसने एक नवीन कैंसर लक्ष्य के विरुद्ध उच्च-आत्मीयता वाले 'डी नोवो' नैनोबॉडी बाइंडर्स को सफलतापूर्वक डिज़ाइन और प्रयोगात्मक रूप से मान्य किया है, जिससे पूर्व संरचनात्मक या एंटीबॉडी डेटा के बिना सब-नैनोमोलर से नैनोमोलर आत्मीयता वाले उम्मीदवारों को उत्पन्न करने में 39.7% सफलता दर प्राप्त की गई है।
यह अध्ययन एक अनिश्चितता-जागरूक बेंचमार्किंग फ्रेमवर्क पेश करता है जो नियंत्रित मूल्यांकन, अंतर-उपकरण सहमति विश्लेषण और विस्तारित विशेषता प्रोफाइलिंग को संयोजित करता है ताकि उन अनुक्रम गुणों और पैटर्न की पहचान की जा सके जो mRNA और lncRNA के बीच वर्गीकरण अस्पष्टता को संचालित करते हैं, जिससे अधिक सुदृढ़ क्लासिफायर के विकास को मार्गदर्शन मिल सके।
पाथवेसीकर (PathwaySeeker) एक साक्ष्य-आधारित एआई प्रणाली है जो जीव-विशिष्ट चयापचय नेटवर्क के पुनर्निर्माण के लिए प्रोटिओमिक और मेटाबोलोमिक डेटा को एकीकृत करती है, और स्पष्ट प्रयोगात्मक उत्पत्ति के साथ स्थिति-विशिष्ट जैविक परिकल्पनाओं को उत्पन्न करने और सत्यापित करने के लिए एक "ओरेकल-इन-द-लूप" (Oracle-in-the-Loop) अनुमान पद्धति का उपयोग करती है।