💻 bioinformatics

A universal model for drug-receptor interactions

यह शोध पत्र एक मशीन लर्निंग मॉडल प्रस्तुत करता है जो नए रासायनिक पदार्थों के लिए ड्रग-रिसेप्टर बाइंडिंग की भविष्यवाणी करने हेतु नॉन-बॉन्डेड इंटरैक्शन के सिद्धांतों को सफलतापूर्वक सीखता है, जो वर्तमान आकस्मिक औषधि खोज विधियों की सीमाओं को दूर करने के लिए एक सैद्धांतिक ढांचा प्रदान करता है।

Menezes, F., Wahida, A., Froehlich, T., Grass, P., Zaucha, J., Napolitano, V., Siebenmorgen, T., Pustelny, K., Barzowska (…)2026-03-24
💻 bioinformatics

FlashDeconv enables atlas-scale, multi-resolution spatial deconvolution via structure-preserving sketching

FlashDeconv एक स्केलेबल, संरचना-संरक्षण करने वाली डीकनवोल्यूशन विधि है जो कई रिज़ॉल्यूशन पर Visium HD डेटा के सटीक, एटलस-स्केल स्थानिक विश्लेषण को सक्षम बनाती है, जो ऊतक-विशिष्ट रिज़ॉल्यूशन क्षितिज और पहले से अनडिटेक्टेबल इम्यून माइक्रोडोमेन जैसे महत्वपूर्ण जैविक अंतर्दृष्टि को प्रकट करती है जिन्हें वर्तमान वर्गीकरण-आधारित दृष्टिकोणों द्वारा छोड़ दिया जाता है।

Yang, C., Chen, J., Zhang, X.2026-03-24
💻 bioinformatics

Col-Ovo: Smartphone-based artificial intelligence for rapid counting of Aedes mosquito eggs under field conditions

Col-Ovo एक स्मार्टफोन-आधारित आर्टिफिशियल इंटेलिजेंस टूल है जो फील्ड छवियों से *Aedes aegypti* के अंडों की 95% से अधिक सटीकता के साथ तीव्र, स्वचालित गणना सक्षम करता है, जो बड़े पैमाने पर मच्छर निगरानी कार्यक्रमों में मैनुअल प्रोसेसिंग की बाधा को प्रभावी ढंग से दूर करता है।

Almanza, J., Montenegro, D.2026-03-24
💻 bioinformatics

PACMON: Pathway-guided Multi-Omics data integration for interpreting large-scale perturbation screens

यह शोध पत्र PACMON को प्रस्तुत करता है, जो एक स्केलेबल बेयसियन लेटेंट फैक्टर मॉडल है जो बड़े पैमाने पर परटर्बेशन स्क्रीन्स से मल्टी-ओमिक्स डेटा को एकीकृत करता है ताकि पाथवे-स्तरीय प्रोग्राम और प्रयोगात्मक परटर्बेशन द्वारा उनके विशिष्ट मॉड्यूलेशन को संयुक्त रूप से अनुमान लगाकर जीन फंक्शन की व्याख्या की जा सके।

Qoku, A., Stickel, T., Amerifar, S., Wolf, S., Oellerich, T., Buettner, F.2026-03-24
💻 bioinformatics

TCRseek: Scalable Approximate Nearest Neighbor Search for T-Cell Receptor Repertoires via Windowed k-mer Embeddings

TCRseek एक स्केलेबल, दो-चरणीय रिट्रीवल फ्रेमवर्क है जो बड़े टी-सेल रिसेप्टर रिपरटोइर की कुशल, उच्च-संवेदनशीलता वाली खोज को सक्षम करने के लिए जैविक रूप से सूचित विंडोयुक्त k-mer एम्बेडिंग्स को अनुमानित निकटतम पड़ोसी इंडेक्सिंग और सटीक रीरैंकिंग के साथ जोड़ता है, जिससे लगभग इष्टतम सटीकता बनाए रखते हुए ब्रूट-फोर्स विधियों की तुलना में महत्वपूर्ण गति प्राप्त होती है।

Yang, Y.2026-03-24
💻 bioinformatics

From SNPs to Pathways: A genome-wide benchmark of annotation discrepancies and their impact on protein- and pathway-level inference

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि केवल एक एकल SNP एनोटेशन टूल या जीन मॉडल पर निर्भर रहने से महत्वपूर्ण विसंगतियां और अपूर्ण पाथवे अनुमान उत्पन्न होते हैं, जबकि एक बहु-टूल, बहु-मॉडल रणनीति कवरेज को अधिकतम करती है और सुदृढ़, पुनरुत्पादक जीनोमिक व्याख्या सुनिश्चित करती है।

Queme, B., Muruganujan, A., Ebert, D., Mushayahama, T., Gauderman, W. J., Mi, H.2026-03-24
💻 bioinformatics

dreampy: Pseudobulk mixed-model differential expression for single-cell RNA-seq in Python

dreampy, R/Bioconductor के dreamlet फ्रेमवर्क का एक Python कार्यान्वयन है जो scverse इकोसिस्टम के भीतर empirical Bayes moderation के साथ voom प्रिसिजन-वेटेड लीनियर मिक्सड मॉडल्स को एकीकृत करके सिंगल-सेल RNA-seq डेटा के लिए स्यूडोबल्क मिक्सड-मॉडल डिफरेंशियल एक्सप्रेशन विश्लेषण को सक्षम बनाता है।

Wells, S. B., Shahnawaz, H., Jones, J. L.2026-03-24
💻 bioinformatics

Micro16S: Universal Phylogenetic 16S rRNA Gene Representations for Deep Learning of the Microbiome

यह शोध पत्र Micro16S को प्रस्तुत करता है, जो एक डीप लर्निंग फ्रेमवर्क है जो माइक्रोबायोम रिप्रजेंटेशन (microbiome representation) को बेहतर बनाने के लिए फाइलोगैनेटिक रूप से सूचित (phylogenetically informed), क्षेत्र-अपरिवर्तनीय (region-invariant) 16S rRNA एम्बेडिंग्स उत्पन्न करता है, हालांकि क्लास इम्बैलेंस (class imbalance) जैसी चुनौतियों के कारण वर्गीकरण कार्यों पर इसका वर्तमान प्रदर्शन शास्त्रीय मशीन लर्निंग बेसलाइन्स की तुलना में निम्न बना हुआ है।

Bishop, H. V., Ogilvie, O. J., Dobson, R. C. J., Herbold, C. W.2026-03-24
💻 bioinformatics

ExposoGraph: An Interactive Platform for Carcinogen Bioactivation and Detoxification Pathway Visualization

ExposoGraph एक इंटरैक्टिव नॉलेज-ग्राफ प्लेटफॉर्म है जो कार्सिनोजेनिक एक्सपोज़र, मेटाबॉलिक एक्टिवेशन/डिटॉक्सिफिकेशन, डीएनए डैमेज और जेनेटिक वेरिएशन्स को जोड़ने वाले जटिल मार्गों को विज़ुअलाइज़ और एक्सप्लोर करने के लिए प्रमुख कार्सिनोजेन और फार्माकोजेनोमिक संसाधनों से डेटा को एकीकृत करता है, ताकि जीन-एनवायरनमेंट इंटरेक्शन अनुसंधान में सुधार किया जा सके।

Pienta, K., Kazi, J. U.2026-03-24
💻 bioinformatics

Breaking the Extraction Bottleneck: A Single AI Agent Achieves Statistical Equivalence with Human-Extracted Meta-Analysis Data Across Five Agricultural Datasets

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि एक एकल एआई एजेंट पांच विविध कृषि डेटासेट में मानव-निर्मित मेटा-विश्लेषण डेटा के साथ सांख्यिकीय समानता प्राप्त कर सकता है, जो प्रभावी रूप से डेटा निष्कर्षण की प्राथमिक बाधा को हल करता है और लागत को एक से दो क्रम अधिक कम करता है।

Halpern, M.2026-03-23