💻 bioinformatics

Siderophore identification in microorganisms associated with marine sponges by LC-HRMS and a data analytic approach in R.

यह अध्ययन तीन समुद्री स्पंज प्रजातियों के माइक्रोबायोम के भीतर 59 संभावित साइडरोफोर के एक विविध परिदृश्य की पहचान और सत्यापन करने के लिए R का उपयोग करते हुए एक कल्चर-स्वतंत्र, LC-HRMS-आधारित विश्लेषणात्मक वर्कफ़्लो प्रस्तुत करता है।

Rios, A. G., Kato, M. J., Yamaguchi, L. F., Esposito, B. P., Arenas, A. F.2026-02-11
💻 bioinformatics

The Phylogenetic Structure of β-diversity: Covariance Matrix Sparsification of Critical Beta-splitting Trees

यह शोध पत्र यह प्रदर्शित करता है कि हार-लाइक (Haar-like) वेवलेट्स यथार्थवादी "क्रिटिकल बीटा-स्प्लिटिंग" वृक्षों के फाइलोजेनेटिक कोवेरिएंस मैट्रिसेस को प्रभावी ढंग से स्पार्सिफाई करते हैं, जिससे एक जैविक रूप से सार्थक दूरी मीट्रिक सक्षम होता है जो सूक्ष्मजीव वातावरण के बीच संरचनात्मक अंतरों के लिए जिम्मेदार महत्वपूर्ण विकासवादी विभाजनों की पहचान करता है।

Svihla, S. P., Lladser, M. E.2026-02-11
💻 bioinformatics

CoPrimeEEG: CRT-Guided Dual-Branch Reconstruction from Co-Prime Sub-Nyquist EEG

CoPrimeEEG एक न्यूरल रिकंस्ट्रक्शन फ्रेमवर्क है जो उच्च-सटीकता वाले EEG संकेतों को कुशलतापूर्वक पुनर्निर्मित करने के साथ-साथ टेम्पोरल मास्क और बैंडपावर फीचर्स की भविष्यवाणी करने के लिए को-प्राइम सब-नाइक्विस्ट सैंपलिंग और एक CRT-गाइडेड ड्यूल-ब्रांच आर्किटेक्चर का उपयोग करता है।

Yu, Y., Liu, D., Wu, Y. N.2026-02-10
💻 bioinformatics

Parsimonious cell co-localization scoring for spatial transcriptomics

यह शोध पत्र नेबरहुड प्रोडक्ट को-लोकलाइज़ेशन (NPC) स्कोर प्रस्तुत करता है, जो एक कुशल और व्याख्यात्मक बहुभिन्नरूपी मीट्रिक है जिसे स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स डेटासेट में कोशिका प्रकारों के स्थानिक सह-उपस्थिति (spatial co-occurrence) को मापने और स्थानीयकृत करने के लिए डिज़ाइन किया गया है।

Gingerich, I. K., Frost, H. R.2026-02-10
💻 bioinformatics

Enumerating the chemical exposome using in-silico transformation analysis : an example using insecticides

यह शोध पत्र मशीन लर्निंग और रासायनिक डेटा संसाधनों का उपयोग करते हुए एक एकीकृत इन-सिलिको वर्कफ़्लो प्रस्तुत करता है, जो हजारों संभावित कीटनाशक रूपांतरण उत्पादों (ट्रांसफॉर्मेशन प्रोडक्ट्स) को सूचीबद्ध और प्राथमिकता देने के लिए उपयोग किया जाता है, जिससे एक्सपोज़ोम के ज्ञात रासायनिक स्थान का विस्तार होता है।

Jothiramajayam, M., Barupal, D. K.2026-02-09
💻 bioinformatics

Orchestrating Spatial Transcriptomics Analysis with Bioconductor

यह शोध पत्र एक मुक्त रूप से सुलभ, निरंतर अपडेट होने वाली ऑनलाइन पुस्तक प्रस्तुत करता है जो Bioconductor में R का उपयोग करके स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स (spatial transcriptomics) डेटा का विश्लेषण करने के लिए पुनरुत्पादक कोड उदाहरण, डेटासेट और वर्कफ़्लो प्रदान करती है, जबकि यह Python के साथ अंतर-संचालनीयता (interoperability) का भी समर्थन करती है।

Crowell, H. L., Dong, Y., Billato, I., Cai, P., Emons, M., Gunz, S., Guo, B., Li, M., Mahmoud, A., Manukyan, A., Pages (…)2026-02-09
💻 bioinformatics

Exercise-conditioned tear fluid suppresses myopia progression

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि मध्यम-तीव्रता वाले एरोबिक व्यायाम के बाद एकत्र किया गया अश्रु द्रव, न कि व्यायाम से पहले, गिनी पिग मॉडल में मायोपिया (निकट दृष्टि दोष) की प्रगति को महत्वपूर्ण रूप से रोकता है, जो मायोपिया के उपचार के लिए एक नवीन व्यायाम-मध्यस्थ चिकित्सीय तंत्र को प्रकट करता है।

Yao, H., Liang, M., Fei, Q., Cao, J., Liang, T., Zhou, X., Zhang, S., Cui, Q.2026-02-09
💻 bioinformatics

DEPower: approximate power analysis with DESeq2

यह शोध पत्र DEPower को प्रस्तुत करता है, जो DESeq2 मॉडल फ्रेमवर्क पर आधारित एक वेब-आधारित टूल है जो शोधकर्ताओं को बल्क और सिंगल-सेल आरएनए-अनुक्रमण (RNA-seq) प्रयोगों में इष्टतम नमूना आकार निर्धारित करने के लिए कठोर, विश्लेषणात्मक शक्ति विश्लेषण करने में सक्षम बनाता है।

Gorin, G., Guruge, D., Goodman, L.2026-02-09
💻 bioinformatics

Proteins as Statistical Languages: Information-Theoretic Signatures of Proteomes Across the Tree of Life

यह शोध पत्र विविध जीवों में अंतर्निहित सूचना-सैद्धांतिक विवरणों (information-theoretic descriptors) और संपीड्यता (compressibility) को परिमाणित करके प्रोटीओम का विश्लेषण करने के लिए एक सांख्यिकीय भाषा ढांचे का प्रस्ताव करता है, जो यह प्रकट करता है कि वास्तविक प्रोटीन अनुक्रम जटिल स्थितिजन्य निर्भरता और अतिरेक (redundancy) प्रदर्शित करते हैं जो सरल संरचनात्मक या प्रथम-क्रम मार्कोव मॉडल द्वारा अनुमानित स्तरों से काफी अधिक हैं।

Alegre, E. O. T.2026-02-08
💻 bioinformatics

Scaling Variant-Aware Multiplex Primer Design

यह शोध पत्र Δ\Delta-PRO को प्रस्तुत करता है, जो वेरिएंट-अवेयर मल्टीप्लेक्स प्राइमर डिज़ाइन के लिए एक स्केलेबल और सिद्धांतपूर्ण ढांचा है, जो रोबस्ट प्राइमर डिज़ाइन रीजन अनुकूलन के लिए एक नियर-लीनियर एल्गोरिदम को थर्मोडायनामिक सबसेट चयन के लिए एक कुशल ह्यूरिस्टिक के साथ जोड़ता है, और विविध रोगजनक डेटासेट के लिए कॉम्पैक्ट और स्थिर PCR पैनल बनाने में मौजूदा उपकरणों से बेहतर प्रदर्शन करता है।

Han, Y., Boucher, C.2026-02-06