388 पेपर
यह अध्ययन प्रकट करता है कि सक्रिय प्रक्रियाओं और क्रोमेटिन क्रॉसलिंकिंग द्वारा संचालित न्यूक्लियोप्लाज्म में स्थानिक रूप से सहसंबंधित उतार-चढ़ाव, पास के गुणसूत्र लोकी (chromosomal loci) को सुसंगत रूप से गति करने के लिए प्रेरित करते हैं, जिससे उनकी सापेक्ष विसरण (relative diffusion) धीमी हो जाती है और जीन विनियमन के लिए आवश्यक परमाणु मुठभेड़ों की गतिकी मौलिक रूप से बदल जाती है।
यह शोध पत्र एक मात्रात्मक सिद्धांत प्रस्तुत करता है जो यह स्पष्ट करता है कि कैसे *Chlamydomonas* का गोलाकार कोशिका शरीर एक लेंस के रूप में कार्य करते हुए आंतरिक प्रकाश कॉस्टिक्स (caustics) उत्पन्न करता है, जिसके कारण "नित्र दृष्टियुक्त" (eyeless) उत्परिवर्ती (mutants) उल्टा फोटोटैक्सिस (phototaxis) प्रदर्शित करते हैं क्योंकि उनकी फ्लैगेलर प्रतिक्रिया प्रत्यक्ष प्रकाश के बजाय तेजी से बदलते लेंस वाले संकेत द्वारा नियंत्रित होती है।
यह शोध पत्र edENM प्रस्तुत करता है, जो एक आवश्यक गतिकी-परिष्कृत (essential dynamics-refined) इलास्टिक नेटवर्क मॉडल है जिसे डीएनए, आरएनए और प्रोटीन-न्यूक्लिक एसिड परिसरों की संरचनात्मक गतिकी को सटीक रूप से पकड़ने के लिए मॉलिक्यूलर डायनेमिक्स सिमुलेशन के साथ पैरामीटराइज किया गया है, जिसे क्रोमैटिन उपइकाइयों और राइबोसोम जैसे सिस्टम में बड़े पैमाने पर कार्यात्मक गतियों को सिम्युलेट करने के लिए eBDIMS फ्रेमवर्क में एकीकृत किया गया है।
यह शोध पत्र SAP (सेगमेंट एनी प्लांट) प्रस्तुत करता है, जो एक प्रशिक्षण-मुक्त, फ्यू-शॉट फ्रेमवर्क है जो विभिन्न प्रजातियों और इमेजिंग स्थितियों में विविध पादप संरचनाओं के सटीक, स्वचालित विभाजन और मात्रात्मक समय-श्रृंखला फेनोटाइपिंग को सक्षम करने के लिए पूर्व-प्रशिक्षित सेगमेंट एनीथिंग मॉडल 2 (SAM2) का लाभ उठाता है, जिसके लिए कार्य-विशिष्ट पुन: प्रशिक्षण की आवश्यकता नहीं है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर हब का निर्माण मोटिफ संख्या द्वारा संचालित एनहांसर-एन्कोडेड बाइंडिंग काइनेटिक्स का एक इमर्जेंट गुण है, न कि एक ऐसा तंत्र जो सक्रिय रूप से लक्ष्य अधिभोग (टारगेट ऑक्यूपेंसी) को बढ़ाता है या ट्रांसक्रिप्शनल बर्स्ट व्यवहार की भविष्यवाणी करता है।
यह शोध पत्र इंजीनियर किए गए TPR मोटिफ्स और स्व-लेबलिंग एंजाइमों पर आधारित एक मॉड्यूलर प्रोटीन लैडर प्रस्तुत करता है जो विविध प्रयोगात्मक प्लेटफार्मों, अभिव्यक्ति प्रणालियों और लेबलिंग रणनीतियों में FRET दूरी मापन को मानकीकृत और सामंजस्यपूर्ण बनाने के लिए एक सार्वभौमिक बेंचमार्क के रूप में कार्य करता है, जिससे इन विट्रो डेटा का इंट्रासेल्युलर वातावरण में प्रत्यक्ष अनुवाद सक्षम होता है।
यह अध्ययन वक्रता-नियंत्रित जैविक ऊतक वृद्धि (biological tissue growth) को अनुकरण करने के लिए एक नवीन विविक्त गणितीय मॉडल (discrete mathematical model) और इसके व्युत्पन्न निरंतर प्रतिक्रिया-विसरण सीमा (continuum reaction-diffusion limit) प्रस्तुत करता है, जो यह प्रदर्शित करता है कि कैसे यांत्रिक कोशिका अंतःक्रियाएं और स्थानिक बाधाएं प्रायोगिक अवलोकनों के अनुरूप इंटरफ़ेस स्मूथिंग (interface smoothing) को संचालित करती हैं।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि हेटरोमेरिक GABA रिसेप्टर्स के सबयूनिट के M2-M3 लिंकर के साइट 2 पर एक प्रोलिन अवशेष (residue) को सम्मिलित करना, लेकिन सबयूनिट में नहीं, एक 'मॉलिक्यूलर ब्रेक रिलिवर' (molecular brake reliever) के रूप में कार्य करता है जो चैनल को एक सक्रिय अवस्था की ओर पक्षपाती बनाता है, जिससे GABA संवेदनशीलता और स्वतःस्फूर्त गतिविधि बढ़ जाती है।
यह अध्ययन "chlamylipo" को प्रस्तुत करता है, जो एक बायो-हाइब्रिड माइक्रो-स्विमर है जहाँ एक विशाल लिपोसॉम (liposome) में समाहित एक *Chlamydomonas reinhardtii* शैवाल आवधिक झिल्ली विरूपण (membrane deformations) और युग्मित श्यान तरल प्रवाह (coupled viscous fluid flows) के माध्यम से लिपिड द्विपरत (lipid bilayer) के पार आंतरिक कशाभिका बलों (flagellar forces) को संचारित करके स्व-चालित तैराकी और प्रकाशानुवर्तन (phototaxis) प्राप्त करता है।
बड़े पैमाने पर आणविक गतिशीलता (molecular dynamics) सिमुलेशन का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन प्रकट करता है कि Nanog, Oct4, और Sox2 चरण-पृथक्कृत (phase-separated) ट्रांसक्रिप्शनल कंडेनसेट्स बनाते हैं जिनमें गैर-योगात्मक, उभरते हुए गुण होते हैं जहाँ DNA एक स्थानिक आयोजक के रूप में कार्य करता है जो Oct4 की भर्ती को बढ़ाता है, जिससे एक सहक्रियात्मक "वितरक-प्राप्तकर्ता" (deliverer-receiver) तंत्र स्थापित होता है जो कैनोनिकल बाइंडिंग से परे जीन अभिव्यक्ति विनियमन का एक नया स्तर जोड़ता है।