⚛️ biophysics
Spatial confinement reshapes the folding of an ion-stabilized DNA with three-way junction
DNAfold2 कोर्स-ग्रेन्ड मॉडल का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि नैनोस्केल स्थानिक परिरोध (spatial confinement) एक संरचनात्मक चयनकर्ता के रूप में कार्य करता है जो विस्तारित मध्यवर्ती अवस्थाओं (extended intermediates) को एंट्रॉपी द्वारा वर्जित करके, आयन-स्थिरित डीएनए थ्री-वे जंक्शन्स के फोल्डिंग परिदृश्य को नया आकार देता है, जिससे सघन टोपोलॉजी स्थिर होती है और विविध आयनिक स्थितियों में सहकारी संक्रमण (cooperative transitions) प्रवर्तित होते हैं।