⚛️ biophysics

Yoda molecules agonize PIEZO2

यह अध्ययन प्रकट करता है कि योडा (Yoda) अणु, जिन्हें पहले PIEZO1 को चयनात्मक रूप से सक्रिय करने वाला माना जाता था, PIEZO2 की ओपन प्रोबेबिलिटी (open probability) को बढ़ाकर और इसके इनएक्टिवेशन (inactivation) को धीमा करके इसे भी प्रभावी ढंग से एगोनाइज़ (agonize) करते हैं, जिसमें Yoda2 की बढ़ी हुई क्षमता एक विशिष्ट साल्ट ब्रिज इंटरेक्शन (salt bridge interaction) के कारण है, जिससे PIEZO चैनल कार्यों के बीच अंतर करने के लिए उनके उपयोग के पुनर्मूल्यांकन की आवश्यकता है।

Wijerathne, T. D., Chandrasekharan, A., Bhatt, A., Luo, Y. L., Lacroix, J. J.2026-05-12
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Dynamics of Take-off in Bipedal Animals and Robots

यह अध्ययन लैग्रेंजियन गतिकी (Lagrangian dynamics) और हिल मसल समीकरणों (Hill muscle equations) को संयोजित करने वाले एक नवीन गतिज ढांचे (kinetic framework) को विकसित करता है ताकि यह प्रदर्शित किया जा सके कि द्विपाद टेक-ऑफ यांत्रिकी (bipedal take-off mechanics) विविध शरीर द्रव्यमानों में कुशलतापूर्वक स्केल होती है, जो इस बात की पुष्टि करता है कि *टायरानोसॉरस रेक्स* (Tyrannosaurus rex) कूदने में सक्षम था और साथ ही स्केलेबल जैव-प्रेरित रोबोटों को डिजाइन करने के लिए एक नई कार्यप्रणाली प्रदान करता है।

Chen, G.-Y., Wu, Z.-Y., Chen, S.-H., Yang, P.2026-05-11
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Triplet tumbling microscopy enables in situ quantification of protein complex assembly and dynamics

लेखकों ने ट्रिपलेट टम्बलिंग माइक्रोस्कोपी (TTM) विकसित किया है, जो एक बहुमुखी इमेजिंग तकनीक है जो जीवित कोशिकाओं में रोटेशनल डिफ्यूजन को मापने के लिए इन्फ्रारेड-ट्रिगर करने योग्य ट्रिपलेट अवस्थाओं का लाभ उठाती है, जिससे परस्पर क्रिया करने वाले भागीदारों के पूर्व ज्ञान की आवश्यकता के बिना प्रोटीन कॉम्प्लेक्स असेंबली, आकार और गतिशीलता के वास्तविक समय, इन सीटू मात्रात्मक निर्धारण को सक्षम बनाया जा सके।

Lazzari-Dean, J. R., Millett-Sikking, A., Rao, P., Jensvold, Z. D., Baddock, H., Ingaramo, M., Nile, A. H., York, A. G. (…)2026-05-11
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Dpb11 facilitates the colocalization of Mec1-Ddc2 with its activators on gapped DNA

सिंगल-मॉलिक्यूल इमेजिंग और फोर्स स्पेक्ट्रोस्कोपी का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन प्रकट करता है कि चेकपॉइंट मीडिएटर Dpb11 ss-dsDNA जंक्शन्स पर Mec1-Ddc2 काइनेज कॉम्प्लेक्स को उसके एक्टिवेटर्स के साथ सह-स्थानीयकरण (colocalization) करने में सुविधा प्रदान करता है और ssDNA को ब्रिज बनाकर प्रभावी गैप लंबाई को कम करता है।

Beckwitt, E. C., Chua, G. N. L., Liu, S., O'Donnell, M. E.2026-05-10
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Quantum kernel support vector machines for trabecular bone classification: comparing feature reduction strategies on synthetic micro-CT data

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि जबकि अधिकांश आयामी न्यूनीकरण (dimensionality reduction) रणनीतियाँ क्वांटम कर्नेल SVM को ट्रैबेक्यूलर बोन वर्गीकरण में शास्त्रीय बेसलाइन से कम प्रदर्शन करने के लिए मजबूर करती हैं, UMAP एकमात्र ऐसी विधि है जो क्वांटम कर्नेल को प्रतिस्पर्धी बने रहने की अनुमति देती है, हालांकि देखा गया लाभ सांख्यिकीय रूप से महत्वहीन है और संभवतः फोल्ड निर्भरता द्वारा बढ़ा हुआ है, साथ ही यह निष्कर्ष भी निकलता है कि ZZ क्वांटम कर्नेल रिग्रेशन कार्यों के लिए सुचारू मीट्रिक संरचनाओं को पकड़ने में विफल रहते हैं।

Florez, I., Farhat, A., Le Houx, J., Altamura, E., Tozzi, G.2026-05-07
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Deep Learning-Enhanced TopoStats for the Automated Quantification of DNA and Complex Biomolecular Structures

यह शोध पत्र 'डीप लर्निंग-एन्हांस्ड टोपोस्टैट्स' (Deep Learning-Enhanced TopoStats) को प्रस्तुत करता है, जो एक ओपन-सोर्स पायथन पैकेज है जो डीएनए और जटिल बायोमॉलिक्यूल्स के लिए एटॉमिक फोर्स माइक्रोस्कोपी (AFM) डेटा के मात्रात्मक विश्लेषण को स्वचालित करता है, जिससे AFM को एक गुणात्मक विज़ुअलाइज़ेशन टूल से बदलकर एक सुदृढ़, उच्च-थ्रूपुट विश्लेषणात्मक ढांचे में परिवर्तित किया जा सकता है जो सूक्ष्म संरचनात्मक अंतरों को पहचानने में सक्षम है।

Whittle, S., Firth, T. A., Gamill, M. C., Wiggins, L., Shephard, N., Allwood, T., Catley, T. E., Pyne, A. L. B.2026-05-07
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Mechanics-Driven Emergence of Mesenchymal Migration Features

यह शोध पत्र एक न्यूनतम, द्वि-आयामी कम्प्यूटेशनल मॉडल प्रस्तुत करता है जो यह प्रदर्शित करता है कि मेसेनकाइमल कोशिका प्रवासन, जो निरंतर यादृच्छिक चाल (परसिस्टेंट रैंडम वॉक) और विविध आकारिकी द्वारा विशेषता रखता है, केवल इंट्रासेल्युलर ट्रैक्शन बलों और गतिशील आसंजन चक्रों के यांत्रिक परस्पर क्रिया से उभर सकता है, जिसके लिए किसी आरोपित ध्रुवीकरण या दिशात्मक पूर्वाग्रह की आवश्यकता नहीं है।

Louviaux, N., Cheddadi, I., Verdier, C., Stephanou, A., Chauviere, A.2026-05-04
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In silico design and validation of high-affinity RNA aptamers for SARS-CoV-2 comparable to neutralizing antibodies

यह अध्ययन CAAMO को पेश करता है, जो एक एकीकृत कम्प्यूटेशनल और प्रयोगात्मक ढांचा है जिसने सफलतापूर्वक एक SARS-CoV-2 RNA एप्टामर को न्यूट्रलाइजिंग एंटीबॉडीज के तुलनीय बाइंडिंग एफिनिटी प्राप्त करने के लिए अनुकूलित किया है, जो उच्च-एफिनिटी एप्टामर-आधारित चिकित्साओं और निदानों को विकसित करने के लिए एक मजबूत मार्ग प्रदर्शित करता है।

Yang, Y., Qiao, L., Jiang, Y., Wang, Z., Zhang, D., Buratto, D., Huang, L., Zhou, R.2026-05-03
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Phase separation determines treadmilling-like movement ofactin bundles

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि ज़िक्सिन (zyxin) और VASP के लिक्विड-लिक्विड फेज-सेपरेटेड कंडेनसेट्स, स्व-आत्मीयता (self-affinity) की एक मध्यवर्ती सीमा के माध्यम से बहुलकीकरण (polymerization) और कोफिलिन-संचालित विघटन के बीच संतुलन बनाकर एक्टिन बंडलों की निरंतर, ट्रेडमिलिंग जैसी गति को सक्षम करते हैं, जो एक ऐसी प्रक्रिया है जिसे इन विट्रो पुनर्संरचना (in vitro reconstitution) और एजेंट-आधारित सिमुलेशन दोनों द्वारा मान्य किया गया है।

Nast-Kolb, T., Nettuno, B., Toffenetti, D., Striebel, M., Frey, E., Bausch, A. R.2026-04-29
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Charged agar surfaces affect E. coli biofilm properties by balancing curli amyloid quantity and quality

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि धनायनिक (cationic) और ऋणायनिक (anionic) पॉलीइलेक्ट्रोलाइट कोटिंग्स, एक्स्ट्रासेलुलर मैट्रिक्स के भीतर कर्ली अमाइलॉइड फाइबर की मात्रा और संरचनात्मक गुणवत्ता के बीच एक ट्रेड-ऑफ (trade-off) उत्पन्न करके *E. coli* बायोफिल्म के स्थूल गुणों को नियंत्रित करती हैं।

Siri, M., Vazquez-Davila, M., Bidan, C. M.2026-04-28