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Naturally cysteine-less LOV domains from halophilic archaea exhibit magnetic field effects on their fluorescence

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि हेलोफिलिक आर्किया (halophilic archaea) से प्राप्त प्राकृतिक रूप से उत्पन्न सिस्टीन-रहित (cysteine-less) LOV डोमेन चुंबकीय क्षेत्र-निर्भर प्रतिदीप्ति (fluorescence) प्रदर्शित करते हैं, जो यह प्रकट करता है कि रेडिकल-पेयर मैग्नेटोसेंसिटिविटी (radical-pair magnetosensitivity) इंजीनियरिंग का एक कृत्रिम परिणाम होने के बजाय प्राकृतिक प्रोटीनों का एक व्यापक गुण है।

Ross, B. L.2026-08-02
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Benchmarking Deep Learning Predictions of Mutation-Induced Fold Switching

यह अध्ययन डीप लर्निंग और भौतिकी-आधारित मॉडलिंग टूल्स का मूल्यांकन करने के लिए GA/GB प्रोटीन सिस्टम में उत्परिवर्तन-प्रेरित फोल्ड स्विचिंग (mutation-induced fold switching) के एक व्यवस्थित NMR-चरितकृत बेंचमार्क को प्रस्तुत करता है, जो यह प्रकट करता है कि हालांकि कुछ AlphaFold2-आधारित एल्गोरिदम विशिष्ट साइटों पर उत्परिवर्तित प्रभावों की भविष्यवाणी कर सकते हैं, वर्तमान विधियाँ अभी भी संरचनात्मक अवस्था परिवर्तनों का सटीक पूर्वानुमान लगाने में महत्वपूर्ण स्थिति-निर्भर सीमाओं का सामना करती हैं।

Felbinger, N., Carillo, K. J., Chen, Y., Orban, J., Pierce, B.2026-08-02
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Information-theoretic Limits on Programmatic Specification of Biological Systems

यह शोधपत्र सूचना सिद्धांत (information theory) का उपयोग यह प्रदर्शित करने के लिए करता है कि जैविक जीवों में अपने सूक्ष्म संगठन को पूर्णतः पूर्व-निर्धारित करने के लिए पर्याप्त आंतरिक सूचना का अभाव है, जो एक स्थूल-कणीकरण सीमा (coarse-graining threshold) स्थापित करता है जिसके कारण जीनोम को साझा भौतिक गतिकी और पर्यावरणीय यादृच्छिकता द्वारा संकलित एक स्थूल विनिर्देश (coarse specification) के रूप में कार्य करना आवश्यक हो जाता है, न कि एक नियतात्मक कार्यक्रम के रूप में।

Kiiskinen, T., Kivinen, O., Rivas, M. A.2026-07-30
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Kinase inhibitors can change protonation or tautomeric state upon binding

मल्टी-कॉन्फ़ॉर्मेशन कंटीन्यूअस इलेक्ट्रोस्टैटिक्स (MCCE) सिमुलेशन का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि काइनेज इनहिबिटर अक्सर बाइंडिंग के दौरान प्रोटोनेशन और टॉटोमर अवस्थाओं में गतिशील बदलावों से गुजरते हैं, जिससे यह पता चलता है कि अल्पसंख्यक प्रजातियां बाध्य कॉम्प्लेक्स (bound complex) में प्रमुख हो सकती हैं और यह बाइंडिंग ऊर्जा विज्ञान के सटीक पूर्वानुमान के लिए पूर्ण प्रोटोनेशन और टॉटोमर एन्सेम्बल पर विचार करने की महत्वपूर्ण आवश्यकता को रेखांकित करता है।

Ranepura, G. A., Chowdhury, S. I., Rosenzweig, E. A., Rustenburg, A. S., Lopez-Rios de Castro, R., Mao, J., Chodera, J. (…)2026-07-30
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Asymmetry and Allostery: Insights into the Mechanism of DirectionalPeptide Translocation in AAA+ Unfoldases

यह अध्ययन AAA+ अनफोल्डेसेस (unfoldases) के ऑल-एटम मॉलिक्यूलर डायनेमिक्स सिमुलेशन का उपयोग करके यह प्रदर्शित करता है कि कैसे संरचनात्मक विषमता (structural asymmetry) स्थिति-निर्भर एलोस्टेरिक नेटवर्क स्थापित करती है जो प्रयोगात्मक रूप से देखे गए परिवर्तनशील स्टेपिंग व्यवहारों को समायोजित करते हुए, स्टोकेस्टिक ATP हाइड्रोलिसिस को दिशात्मक सबस्ट्रेट ट्रांसलोकेशन में परिवर्तित करती है।

Southam, T. G., Oh, M., Swanson, J. M.2026-07-29
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Simulation of Protein Structure using a Coarse-Grained Potential incorporating the Backbone Dihedral Interactions

लेखक स्पष्ट विलायक (explicit solvent) में एक नवीन मोटे-दाने वाले (coarse-grained) प्रोटीन मॉडल को प्रस्तुत करते हैं जो प्रत्येक अवशेष मोती (residue bead) को दो अतिरिक्त स्वतंत्रता स्तर (degrees of freedom) प्रदान करके बैकबोन डायहेड्रल कोण की जानकारी को सुरक्षित रखता है, जिससे क्रिस्टल संरचनाओं और ऑल-एटम सिमुलेशन के अनुरूप अवशेष-स्तरीय संरचनात्मक विवरणों को सफलतापूर्वक पुनरुत्पादित किया जा सकता है और साथ ही काफी बड़े समय और लंबाई के पैमाने वाले अध्ययन सक्षम होते हैं।

Kole, K., Ghosh Moulick, A., Chakrabarti, J.2026-07-28
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Correlating Structure and Rheology in Ionically Crosslinked Alginate Biopolymer Hydrogels - A Case for Why "Less" can be "More"

यह अध्ययन प्रकट करता है कि आयनिक रूप से क्रॉसलिंक्ड एल्जिनेट हाइड्रोgels में एक महत्वपूर्ण स्टोइकीओमेट्रिक अनुपात से आगे क्रॉसलिंक सांद्रता बढ़ाने से एक सजातीय नेटवर्क से मोटे बंडल जैसी संरचना में संक्रमण होता है, जो विरोधाभासी रूप से बल्क लोच (bulk elasticity) और माइक्रोविस्कोसिटी को कम करता है जबकि तन्यता (ductility) को बढ़ाता है, यह प्रदर्शित करते हुए कि उच्च क्रॉसलिंकिंग का अर्थ आवश्यक रूप से इष्टतम यांत्रिक प्रदर्शन नहीं है।

Kopnar, V., Sherin, P. S., Graham, S., Fyfe, H., Garcia Gonzalez, R., O'Connell, A., Shirshova, N., Barnard, A., Girkin (…)2026-07-26
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Optimized cryo-FIB milling strategy to generate thin, minimally damaged biological lamellae

यह शोध पत्र 'नीलास' (Nilas) को प्रस्तुत करता है, जो एक कम-ऊर्जा वाली क्रायो-एफआईबी (cryo-FIB) मिलिंग रणनीति है जो अल्ट्रा-थिन लैमेला (ultra-thin lamellae) बनाने के लिए बीम क्षति को न्यूनतम करती है, जिससे इन सीटू (in situ) संरचनात्मक जीव विज्ञान के रिज़ॉल्यूशन और आणविक द्रव्यमान संवेदनशीलता को महत्वपूर्ण रूप से बढ़ाया जा सकता है ताकि आरएनए पॉलीमरेज़ III (RNA polymerase III) जैसे छोटे मैक्रोमोलेक्यूलर कॉम्प्लेक्स का पता लगाया जा सके।

Hall, L. N., Paul, J., Ngo, P., Lucas, B. A.2026-07-25
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Spatial deconstruction of the plasma membrane

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि प्लाज्मा झिल्ली विशिष्ट प्रोटीन और लिपिड के विभेदात्मक विभाजन द्वारा संचालित प्रोटीन-समृद्ध और प्रोटीन-विहीन डोमेन में व्यवस्थित है, एक ऐसी संरचनात्मक विषमता जो पृथक पुटिकाओं (वेसिकल्स) में भी बनी रहती है और संभवतः विभिन्न कोशिकीय प्रक्रियाओं के पृथक्करण को सुगम बनाती है।

Mandala, V. S., Zhao, C., Chen, Q., Gross, S., Geri, J. B., MacKinnon, R.2026-07-23
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Conformational dynamics of exopolysaccharides underlie biofilm matrix mechanics in Vibrio cholerae

यह अध्ययन प्रयोगात्मक बायोफिजिकल मापन और कम्प्यूटेशनल सिमुलेशन को एकीकृत करता है ताकि यह प्रदर्शित किया जा सके कि कैसे *Vibrio cholerae* एक्सोपॉलीसेकेराइड (VPS) में एक एकल ग्लाइकोसिडिक लिंकेज का संरचनात्मक लचीलापन (conformational flexibility), पॉलीमर के संकुचन और गैर-शास्त्रीय उलझाव (nonclassical entanglement) को निर्धारित करता है, जिससे बायोफिल्म मैट्रिक्स मैकेनिक्स के आणविक आधार की स्थापना होती है।

Nam, K.-M., Fowler, N., Kandel, R., Zhu, Y., Liu, Y., Lai, Y.-J., Hassan, M. F., Gerace, E., Asp, M., Olson, R., Li, Y. (…)2026-07-23