🧬 genomics

Superabundant microRNAs are transcribed from human rDNA spacer promoters insulated by CTCF

यह अध्ययन प्रकट करता है कि अतिप्रचुर माइक्रोआरएनए (microRNAs), विशेष रूप से miR-1275 और miR-6724, CTCF द्वारा घिरे मानव rDNA स्पेसर प्रमोटरों से ट्रांसक्राइब होते हैं, और कैनोनिकल मार्गों से स्वतंत्र रूप से तेजी से प्रोसेस और एक्सपोर्ट होते हैं, तथा संभावित सामान्य नियामक भूमिकाओं के साथ संचारित कैंसर बायोमार्कर के रूप में कार्य करते हैं।

Henikoff, S., Henikoff, J. G.2026-02-26
🧬 genomics

WITHDRAWN: Genome Report: Long read, high-coverage reference genomes of the Nymphalid butterflies Catonephele acontius and C. numilia (Nymphalidae: Biblidinae)

यह पांडुलिपि इसलिए वापस ले ली गई है क्योंकि *Catonephele numilia* के नमूने की पहचान गलत तरीके से *Catonephele acontius* के रूप में कर दी गई थी, जिससे रिपोर्ट किया गया *C. numilia* जीनोम डेटा अमान्य हो गया जबकि *C. acontius* का डेटा अप्रभावित रहा।

Hicks, M., Pham, T. N., Seudre, O., Escalante, Z., Knowles, L. S., Gallice, G., Oostra, V.2026-02-26
🧬 genomics

Genome of Trichoderma gamsii strain T035 a promising beneficial fungus in agriculture

यह अध्ययन लाभकारी कृषि कवक *ट्राइकोडर्मा गैम्सी* (Trichoderma gamsii) स्ट्रेन T035 का उच्च-गुणवत्ता वाला, गुणसूत्र-स्तर के निकट (near-chromosome-scale) जीनोम असेंबली प्रस्तुत करता है, जो इसके जैव-नियंत्रण तंत्रों को स्पष्ट करने और सतत पादप संरक्षण रणनीतियों को आगे बढ़ाने के लिए एक महत्वपूर्ण संसाधन प्रदान करता है।

Colou, J., Bremand, E., Robin, A., Bastide, F., Guillemette, T.2026-02-25
🧬 genomics

Deep learning framework ChIANet predicts protein-mediated chromatin architecture across functional contexts

CHIAnet एक मल्टीमॉडल डीप लर्निंग फ्रेमवर्क है जो केवल बाइंडिंग प्रोफाइल से प्रोटीन-मध्यस्थ 3D क्रोमैटिन आर्किटेक्चर की सटीक भविष्यवाणी करता है, जिससे यह पता चलता है कि जीनोम फोल्डिंग विविध सेलुलर और कैंसर अवस्थाओं में कार्यात्मक संदर्भ और नियामक लक्ष्यों द्वारा गतिशील रूप से आकार लेती है।

Luo, H., Wen, R., Tang, L., Chen, L., Li, M.2026-02-25
🧬 genomics

Comprehensive mRNA annotation in trypanosomatid parasites

यह शोध पत्र ट्रिपैनोसोमेटिड परजीवियों में शॉर्ट-रीड आरएनए अनुक्रमण डेटा का उपयोग करके स्प्लिस्ड लीडर एक्सेप्टर साइट्स, पॉलीएडेनाइलेशन साइट्स और अनट्रांसलेटेड क्षेत्रों को एनोटेट करने के लिए व्यावहारिक, स्केलेबल सॉफ्टवेयर टूल प्रस्तुत करता है, जिन्हें इन जीवों के सभी उपलब्ध जीनोमों में यूटीआर (UTRs) को व्यापक रूप से एनोटेट करने के लिए लागू किया गया था।

Dobramysl, U., Wheeler, R. J.2026-02-25
🧬 genomics

Interactive exploration of biobank-scale ancestral recombination graphs with Lorax.

यह शोधपत्र Lorax को प्रस्तुत करता है, जो एक GPU-त्वरित (GPU-accelerated), वेब-नेटिव प्लेटफॉर्म है जो जीनोमिक स्थिति, कोलेसेंट समय (coalescent time), स्थानीय वंशावली और मेटाडेटा को एकीकृत करके बायोबैंक-स्तर के पूर्वज पुनर्संयोजन ग्राफ (ancestral recombination graphs) के वास्तविक समय, संवादात्मक विज़ुअलाइज़ेशन और अन्वेषण को सक्षम बनाता है।

Katte, P., Corbett-Detig, R.2026-02-24
🧬 genomics

Whole-genome sequencing of CRFK and PG-4 cells to infer the phenotype of the original donor cats

इस अध्ययन में CRFK और PG-4 बिल्ली की सेल लाइनों के मूल दाता बिल्लियों के कोट और आइरिस फेनोटाइप का अनुमान लगाने के लिए होल-जीनोम सीक्वेंसिंग का उपयोग किया गया, जिससे उनके पहले से अज्ञात आनुवंशिक पृष्ठभूमि को स्पष्ट किया जा सका और बिल्ली के सेल डेटा की अधिक सटीक व्याख्या तथा भविष्य के जीनोम-संपादन अनुसंधान के लिए एक आधार प्रदान किया जा सका।

Tanaka, G., Goto, R., Komoto, T., Kubota, A., Hayashi, R., Igawa, T., Sakamoto, N., Awazu, A.2026-02-23
🧬 genomics

A scalable approach to resolving variants of uncertain significance

यह शोध पत्र एक स्केलेबल वर्कफ़्लो प्रस्तुत करता है जो 40 रोग-संबंधित जीनों के लिए मौजूदा अनिश्चित महत्व वाले वेरिएंट्स (VUS) के बहुमत को पुनर्वर्गीकृत करने और भविष्य के अप्रलेखित वेरिएंट्स को पूर्व-वर्गीकृत करने के लिए बड़े पैमाने के प्रयोगात्मक डेटा और भविष्य कहनेवाला मॉडल (predictive models) को एकीकृत करता है, जिससे जीनोमिक चिकित्सा के नैदानिक अनुप्रयोग में महत्वपूर्ण प्रगति होती है।

Tejura, M., Chen, Y., McEwen, A. E., Stewart, R., Sverchkov, Y., Laval, F., Woo, I., Zeiberg, D., Shen, R., Fayer, S., S (…)2026-02-23
🧬 genomics

SHAP-Guided CpG Selection with Ensemble Learning for Epigenetic Age Prediction

यह अध्ययन एक पुनरुत्पादनीय, व्याख्यात्मक पाइपलाइन प्रस्तुत करता है जो उच्च-सटीक, क्रॉस-टिश्यू एपिजेनेटिक आयु भविष्यवाणी प्राप्त करने के लिए SHAP-निर्देशित CpG चयन को डीप लर्निंग और ट्री-आधारित मॉडलों के स्टैक्ड एन्सेम्बल के साथ जोड़ता है, जो मजबूत जैविक एनोटेशन द्वारा समर्थित है।

Kaulagi, S., Chavan, H.2026-02-23
🧬 genomics

Australian giant kelp genome assemblies show distinct Southern Hemisphere genetics

यह अध्ययन ऑस्ट्रेलियाई विशाल केल्प (*Macrocystis pyrifera*) के लिए दो उच्च-गुणवत्ता वाले, क्षेत्रीय रूप से प्रतिनिधि संदर्भ जीनोम असेंबली प्रस्तुत करता है, जो उत्तरी गोलार्ध की आबादी से महत्वपूर्ण आनुवंशिक और कार्यात्मक विचलन को प्रकट करता है और अवशेष दक्षिणी गोलार्ध के वनों के संरक्षण और बहाली के लिए आवश्यक संसाधन प्रदान करता है।

Scharfenstein, H. J., Carroll, A., Iha, C., Schwoerbel, J., Jordan, R., Willis, A.2026-02-21