Rapid Whole Genome Sequencing Versus Conventional Culture for Optimizing Antibiotic Therapy in Perforation Peritonitis: A Prospective Observational Study
यह भावी अवलोकनात्मक अध्ययन प्रदर्शित करता है कि तीव्र होल जीनोम सीक्वेंसिंग, बेहतर रोगजनक पहचान प्रदान करके, अधिक पॉलीमाइक्रोबियल संक्रमणों की पहचान करके और टर्नअराउंड समय को महत्वपूर्ण रूप से कम करके, उच्च-प्रतिरोध सेटिंग में छिद्रित पेरिटोनिटिस (परफोरशन पेरिटोनाइटिस) के निदान में पारंपरिक कल्चर की तुलना में बेहतर प्रदर्शन करती है, जिससे शीघ्र एंटीबायोटिक अनुकूलन और बेहतर सर्जिकल परिणाम सक्षम होते हैं।
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जब आंत की दीवार फट जाती है, तो शरीर एक शांत, आंतरिक संकट का सामना करता है। पेट के भीतर का वह बाँझ स्थान, जिसे कीटाणुओं से मुक्त होना चाहिए, अचानक पाचन तरल पदार्थों और उन बैक्टीरिया से भर जाता है जो आंत के भीतर रहते हैं। यह स्थिति, जिसे 'परफोरेशन पेरिटोनिटिस' (perforation peritonitis) कहा जाता है, एक हिंसक प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया को जन्म देती है जो तेजी से सेप्सिस में बदल सकती है, जहाँ शरीर की अपनी रक्षा प्रणाली अपने ही अंगों को नुकसान पहुँचाने लगती है। जीवित रहने के लिए, एक मरीज को छेद को ठीक करने के लिए सर्जरी और हमला करने वाले बैक्टीरिया को मारने के लिए एंटीबायोटिक्स की आवश्यकता होती है। हालाँकि, इसमें शामिल बैक्टीरिया शायद ही कभी केवल एक प्रकार के होते हैं; वे कई अलग-अलग प्रजातियों का एक अराजक मिश्रण होते हैं, जिनमें से कुछ एरोबिक (aerobic) होते हैं और कुछ बिना ऑक्सीजन के पनपते हैं। डॉक्टरों के लिए सबसे बड़ी बाधा समय है। इन कीटाणुओं की पहचान करने का मानक तरीका लैब में उन्हें उगाने की प्रक्रिया है, जिसमें कई दिन लग जाते हैं। उस प्रतीक्षा के दौरान, डॉक्टरों को अनुमान लगाना पड़ता है कि कौन से एंटीबायोटिक्स काम करेंगे, और अक्सर वे ब्रॉड-स्पेक्ट्रम (broad-spectrum) दवाओं को चुनते हैं जो कई प्रकार के बैक्टीरिया को मार देती हैं लेकिन साथ ही उन 'सुपरबग्स' के उदय को भी बढ़ावा देती हैं जो उपचार के प्रति प्रतिरोधी होते हैं। फैलते संक्रमण की इस दौड़ में, अनिश्चितता के वे कुछ दिन जीवन और मृत्यु के बीच का अंतर पैदा कर सकते हैं।
उत्तर प्रदेश, भारत के एक शिक्षण अस्पताल में किए गए एक भावी अध्ययन (prospective study) में, शोधकर्ताओं ने उस दौड़ को जीतने का एक नया तरीका परीक्षण करने का लक्ष्य रखा। उन्होंने बैक्टीरिया को लैब में उगाने के पारंपरिक तरीके की तुलना 'रैपिड होल जीनोम सीक्वेंसिंग' (rapid whole genome sequencing) नामक एक आधुनिक तकनीक से की। यह नई विधि बैक्टीरिया के बढ़ने का इंतजार नहीं करती है; इसके बजाय, यह सीधे रोगी के तरल नमूने से मौजूद प्रत्येक जीव के जेनेटिक कोड (genetic code) को पढ़ लेती है। अध्ययन में उन सत्तर मरीजों का अनुसरण किया गया जिनका फटी हुई आंत के लिए ऑपरेशन हुआ था। प्रत्येक मरीज के लिए, सर्जनों ने पेट से तरल पदार्थ एकत्र किया और उसे दो नमूनों में विभाजित किया। एक नमूना कल्चर के लिए मानक लैब में गया, जबकि दूसरा जेनेटिक सामग्री को पढ़ने के लिए एक सीक्वेंसर (sequencer) के पास गया। लक्ष्य यह देखना था कि कौन सी विधि बैक्टीरिया की पहचान अधिक तेज़ी और सटीकता से कर सकती है, और क्या इस गति ने डॉक्टरों को सही दवा जल्दी चुनने में मदद की।
परिणामों ने जेनेटिक दृष्टिकोण के पक्ष में स्पष्ट लाभ दिखाया। सीक्वेंसिंग विधि ने प्रत्येक मरीज में विशिष्ट बैक्टीरिया की पहचान की, जबकि पारंपरिक कल्चर विधि ने लगभग अठारह प्रतिशत मामलों में संक्रमण को पूरी तरह से मिस कर दिया। यह अंतर जटिल संक्रमणों के मामले में और भी अधिक था जिनमें बैक्टीरिया के कई प्रकार शामिल थे। सीक्वेंसिंग टूल ने लगभग सत्तर प्रतिशत मरीजों में विभिन्न कीटाणुओं के मिश्रण को पाया, जबकि कल्चर विधि केवल आधे मरीजों में ही इस मिश्रण को देख पाई। कई मामलों में, कल्चर टेस्ट ने सुझाव दिया कि केवल एक प्रकार का बैक्टीरिया मौजूद था, लेकिन जेनेटिक टेस्ट ने एक छिपे हुए दूसरे या तीसरे हमलावर का खुलासा किया। गति का अंतर भी उतना ही चौंकाने वाला था। जेनेटिक टेस्ट ने औसमी औसत तैंतीस घंटों में बैक्टीरिया की प्रजाति-स्तर की पहचान और एंटीमाइक्रोबियल रेजिस्टेंस जीन का पता लगाने सहित एक पूर्ण रिपोर्ट प्रदान की। पारंपरिक कल्चर विधि को समान जानकारी देने में तीन दिन से अधिक, यानी औसमी सतह सतह इकहत्तर (77) घंटे लगे।
इस देरी के मरीजों के लिए वास्तविक परिणाम हुए। जब शोधकर्ताओं ने उपचार योजनाओं का पुनरावलोकन किया, तो उन्होंने पाया कि चालीस प्रतिशत से भी कम मरीजों को शुरुआत से ही सही एंटीबायोटिक मिला था। क्योंकि डॉक्टर बिना पुष्ट निदान के काम कर रहे थे, इसलिए उन्हें अक्सर बाद में दवा बदलनी पड़ी। वास्तव में, लगभग दो-तिहाई मरीजों को सीक्वेंसिंग के परिणाम आने के बाद अपने एंटीबायोटिक उपचार में बदलाव करने की आवश्यकता पड़ी, और उन सभी बदलावों में थेरेपी का स्तर बढ़ाया गया (escalation of therapy)। अध्ययन ने इन नैदानिक देरी को शारीरिक परिणामों से भी जोड़ा। जिन मरीजों में सर्जरी स्थल पर संक्रमण विकसित हुआ, वे लगभग विशेष रूप से वे थे जिनमें बैक्टीरिया का एक जटिल मिश्रण था जिसे शुरुआती परीक्षणों ने पकड़ नहीं पाया था। इसके अलावा, जो मरीज तुरंत सही एंटीबायोटिक प्राप्त नहीं कर सके, उनमें सर्जिकल साइट इन्फेक्शन (surgical site infection) विकसित होने की संभावना बहुत अधिक थी। हालांकि समूह में कुल मृत्यु दर सोलह प्रतिशत थी, लेकिन जो लोग सेप्टिक शॉक (septic shock) में चले गए थे, उनके मरने का जोखिम बहुत अधिक था।
अध्ययन निष्कर्ष निकालता है कि संक्रमण के जेनेटिक कोड को पढ़ना, बैक्टीरिया को एक डिश में उगाने के इंतजार से कहीं बेहतर विकल्प है। यह सूक्ष्मजीवों के खतरे की एक पूर्ण तस्वीर बहुत तेज़ी से प्रदान करता है, जिससे डॉक्टर अनुमान लगाने के बजाय मौजूद विशिष्ट कीटाणुओं को लक्षित कर सकते हैं। एक ऐसी सेटिंग में जहाँ एंटीबायोटिक प्रतिरोध एक बढ़ती समस्या है, यह गति अधिक सटीक उपचार की अनुमति देती है, जो संभावित रूप से ब्रॉड-स्पेक्ट्रम दवाओं की आवश्यकता को कम करती है और रिकवरी की संभावनाओं में सुधार करती है। शोधकर्ता सुझाव देते हैं कि इस तकनीक को नियमित अस्पताल कार्यप्रवाह में लाना जीवन के लिए खतरा पैदा करने वाली इन आपात स्थितियों को अधिक प्रभावी ढंग से प्रबंधित करने में मदद कर सकता है, विशेष रूप से उन क्षेत्रों में जहाँ प्रतिरोधी बैक्टीरिया का बोझ अधिक है।
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