A Coma Pattern-Based Autofocusing Method Resolves Bacterial Cold Shock Response at Single-Cell Level

Il paper presenta LUNA, un innovativo metodo di autofocusing basato sul pattern di coma che risolve il problema della deriva del fuoco durante gli shock termici, permettendo per la prima volta l'osservazione a livello di singola cellula della risposta allo shock da freddo nei batteri e rivelando un processo di adattamento in tre fasi con crescita continua.

Li, S., Ma, Z., Yu, Y. + 5 more2026-03-23🦠 microbiology

Occurrence of Carbapenem-resistant Enterobacterales in swine wastewater in Shandong Province, China

Questo studio evidenzia la presenza diffusa di *Enterobacterales* resistenti ai carbapenemi, in particolare ceppi di *E. coli* portatori del gene *blaNDM*, nelle acque reflue suinicole dello Shandong, Cina, rivelando un'alta diversità genetica, una resistenza multipla ai farmaci e la necessità di un monitoraggio continuo per proteggere la salute pubblica e ambientale.

Chu, Y., Miao, Y., Huang, L. + 6 more2026-03-23🦠 microbiology

From genomic decay to functional advantage: Traits of a persistent, thermally beneficial coral probiotic

Questo studio dimostra che il ceppo probiotico corallino MC10-B4, selezionato in base a segni di dipendenza evolutiva dall'ospite, conferisce una maggiore tolleranza allo stress termico rispetto a ceppi simpatrici grazie a un adattamento funzionale unico che privilegia la colonizzazione persistente e la formazione di biofilm rispetto ai tradizionali meccanismi di acquisizione dei nutrienti.

Xie, M., Xu, C., Xiang, N. + 15 more2026-03-23🦠 microbiology

Universal rapid RNA-based quantification of toxigenic Alexandrium species (Dinophyceae) using quantitative recombinase polymerase amplification

Questo studio presenta un nuovo saggio molecolare rapido e portatile basato su amplificazione isotermica dell'RNA (qRT-RPA) che rileva e quantifica in meno di 15 minuti le specie di *Alexandrium* tossiche tramite il gene *sxtA4*, offrendo un efficace sistema di allerta precoce per le fioriture algali nocive.

Markopoulos, I., Papadopoulou, I., Chantzaras, C. + 4 more2026-03-23🦠 microbiology

The induction of systemic resistance to barley powdery mildew by rhizosphere bacterial communities does not disrupt the structure or function of native microbial communities

Lo studio dimostra che comunità microbiche sintetiche (SynComs) isolate dalla rizosfera possono indurre resistenza sistemica nella contro la peronospora dell'orzo agendo come agenti di priming senza alterare significativamente la struttura o la funzione delle comunità microbiche native.

Rigerte, L., Sommer, A., Vlot, A. C. + 4 more2026-03-23🦠 microbiology

Virulence and antimicrobial resistance features among clades of Escherichia coli ST131 strains causing community-acquired urinary tract infection in Rio de Janeiro, Brazil

Questo studio ha caratterizzato i profili di virulenza e resistenza antimicrobica di 133 ceppi di *E. coli* ST131 isolati da infezioni del tratto urinario a Rio de Janeiro, rivelando che il sottoclade C2 è altamente resistente e virulento, mentre il sottoclade C1 è il principale produttore di biofilm, suggerendo che i ceppi del clade C guidano la diffusione e la persistenza di questo clone nella regione.

Barcellos, I. S., Sousa, T. C. C., de Castro, E. M. + 5 more2026-03-23🦠 microbiology

Interferon-β Coordinates Epithelial Immune Networks and Fibrotic Responses During Chlamydia muridarum Infection

Questo studio dimostra che l'interferone-β è un regolatore centrale delle reti immunitarie epiteliali durante l'infezione da *Chlamydia muridarum*, poiché la sua assenza provoca uno squilibrio nella segnalazione infiammatoria e una disregolazione dei geni associati alla fibrosi, suggerendo che la compromissione di questo pathway possa favorire la patologia infiammatoria e fibrotica nel tratto riproduttivo femminile.

Kumar, R., Cordova-Mendez, I. C., Burgess, D. + 3 more2026-03-23🦠 microbiology

Three immunoregulatory signatures define non-productive HIV infection in CD4+ T memory stem cells

Questo studio identifica una firma trascrittomica immunoregolatoria distinta, caratterizzata dall'upregolazione di geni come CCL22 e IDO1, nelle cellule T memoria staminali CD4+ infettate in modo non produttivo dal virus HIV, suggerendo che tale fenotipo favorisca l'evasione immunitaria e la persistenza del reservoir virale.

Butta, G. M., Alburquerque, B., Kearns, C. + 12 more2026-03-21🦠 microbiology

A novel peptide modulator of a two-component system revealed by the specific activation of a small RNA in Enterobacteriaceae

Lo studio identifica un nuovo meccanismo di retrocontrollo nel sistema a due componenti RstB-RstA di *Enterobacteriaceae*, in cui l'operone asr-ydgU, attivato dal sistema stesso, modula la sua attività attraverso l'azione opposta della piccola proteina YdgU (rinominata SamT), che inibisce il sistema, e della proteina Asr, che lo potenzia, portando infine all'attivazione specifica dell'sRNA OmrB.

Mathis de Fromont, J., Brosse, A., Quenette, F. + 1 more2026-03-21🦠 microbiology

Redox distribution of Asgard archaea and co-occurring taxa in microbial mats from an early Proterozoic ecosystem analog

Lo studio analizza la distribuzione redox degli Asgard archaea in tappeti microbici del lago Catherine (Etiopia), rivelando che questi organismi prosperano in zone di riduzione dei solfati attraverso interazioni sintroiche con batteri solfato-riduttori, fornendo un analogo delle condizioni ambientali che favorirono l'origine degli eucarioti nel Proterozoico inferiore.

Gutierrez-Preciado, A., Struillou, A., Liang, L. + 8 more2026-03-21🦠 microbiology

Dispersal, adaptation and persistence of H5N1 in the sub-Antarctic and Antarctica

Lo studio analizza 104 sequenze genomiche per tracciare la rapida diffusione e l'evoluzione del virus HPAIV H5N1 nel 2023 tra le isole sub-antartiche e l'Antartide, evidenziando come la trasmissione a lunga distanza sia guidata principalmente da grandi uccelli marini e come il virus abbia acquisito mutazioni adattative con impatti devastanti sulle popolazioni di foche, pinguini e albatros.

Clessin, A., Brusselmans, M., Hong, S. L. + 43 more2026-03-21🦠 microbiology

Alignment-Free Guided Design of a Pan-Orthoflavivirus RT-qPCR Assay

Questo studio presenta un nuovo metodo di progettazione di un assay RT-qPCR pan-ortoflavivirus basato su un approccio allineamento-free e analisi k-mer, che ha permesso di identificare un bersaglio conservato nel gene NS5 e sviluppare un test diagnostico ad alta sensibilità e specificità per la sorveglianza di virus come dengue, Zika e encefalite giapponese.

Sayasit, K., Chaimayo, C., Nuwong, W. + 4 more2026-03-20🦠 microbiology

Performance of shotgun metagenomic sequencing for detection of fungi and parasites across clinical sample types: a multicenter retrospective study.

Uno studio retrospettivo multicentrico ha dimostrato che il sequenziamento metagenomico shotgun (SMg) è uno strumento diagnostico efficace per rilevare funghi e parassiti in diversi tipi di campioni clinici, fornendo soglie di lettura ottimali specifiche per il tipo di campione che ne supportano l'implementazione standardizzata rispetto ai metodi diagnostici convenzionali.

Ghelfenstein-Ferreira, T., Angebault, C., Demontant, V. + 4 more2026-03-20🦠 microbiology