The Black Death Anomaly: A Non-Abelian Field Theory of Epidemiological Safe Zones

Questo lavoro risolve le anomalie storiche della Peste Nera, come le vaste zone sicure, modellando la dinamica epidemica attraverso una teoria di campo di gauge non-abeliana che dimostra come l'interferenza distruttiva delle onde di mutazione generi topologicamente nodi macroscopici stabili, spiegando matematicamente la sopravvivenza di regioni come Polonia e Boemia.

Jose de Jesus Bernal-Alvarado, David DelepineWed, 11 Ma🧬 q-bio

Toda-like Hamiltonian as a probe for quantized prey-predator dynamics

Questo studio analizza le caratteristiche dello spazio delle fasi di un hamiltoniano di tipo Toda, applicato come modello quantizzato per la dinamica preda-predatore, dimostrando che, oltre alla stabilità classica, il sistema presenta anche una stabilità quantistica che lo rende un quadro teorico predittivo per la descrizione di sistemi biologici microscopici competitivi.

Alex E. Bernardini, Orfeu BertolamiWed, 11 Ma⚛️ quant-ph

Misspecification of the generation time distribution and its impact on Rt estimates in structured populations

Questo studio dimostra che la mancata considerazione della variabilità della distribuzione dei tempi di generazione tra diversi gruppi demografici può portare a stime errate del numero di riproduzione Rt, sottolineando la necessità di raccogliere dati epidemici dettagliati e di adottare modelli strutturati per migliorare l'accuratezza delle risposte di sanità pubblica.

Ioana Bouros, Robin Thompson, David Gavaghan, Ben LamberWed, 11 Ma🧬 q-bio

Controllable Sequence Editing for Biological and Clinical Trajectories

Il paper presenta CLEF, un modello di generazione condizionale che supera i limiti delle metodologie esistenti consentendo l'editing controllato e mirato di traiettorie sequenziali biologiche e cliniche, modificando specifiche variabili a partire da un momento temporale definito per generare scenari controfattuali realistici.

Michelle M. Li, Kevin Li, Yasha Ektefaie, Ying Jin, Yepeng Huang, Shvat Messica, Tianxi Cai, Marinka ZitnikTue, 10 Ma🤖 cs.LG

A Class of Unrooted Phylogenetic Networks Inspired by the Properties of Rooted Tree-Child Networks

Questo articolo introduce le nuove classi di reti filogenetiche non radicate chiamate "q-cuttable", dimostrandone il riconoscimento in tempo polinomiale e la capacità di rendere risolvibile in tempo polinomiale il problema NP-difficile del "Tree Containment" per q≥3, superando così le limitazioni computazionali delle reti orientabili in alberi-child.

Leo van Iersel, Mark Jones, Simone Linz, Norbert ZehTue, 10 Ma🔢 math

Modeling the spillover risk of highly pathogenic avian influenza from wild birds to cattle in Denmark: A data-driven risk assessment framework

Questo studio presenta un quadro di valutazione del rischio basato sui dati per stimare la probabilità settimanale di spillover dell'influenza aviaria altamente patogena H5N1 dagli uccelli selvatici al bestiame bovino in Danimarca, identificando aree e periodi ad alto rischio per potenziare la sorveglianza e la preparazione.

You Chang, Jose L. Gonzales, Erik Rattenborg, Mart C. M. de Jong, Beate ConradyThu, 12 Ma🧬 q-bio

SDSR: A Spectral Divide-and-Conquer Approach for Species Tree Reconstruction

Il paper introduce SDSR, un approccio scalabile basato sulla teoria spettrale dei grafi che ricostruisce efficientemente gli alberi delle specie dividendo i dati in sottoinsiemi, garantendo tempi di esecuzione fino a 10 volte più rapidi rispetto ai metodi tradizionali senza compromettere l'accuratezza.

Ortal Reshef (Hebrew University of Jerusalem), Ofer Glassman (Weizmann Institute of Science), Or Zuk (Hebrew University of Jerusalem), Yariv Aizenbud (Tel Aviv University), Boaz Nadler (Weizmann Institute of Science), Ariel Jaffe (Hebrew University of Jerusalem)Thu, 12 Ma🧬 q-bio

Conditionally Site-Independent Neural Evolution of Antibody Sequences

Il paper presenta CoSiNE, un modello di evoluzione neurale basato su catene di Markov a tempo continuo che supera i limiti degli approcci esistenti integrando la dinamica evolutiva per catturare le interazioni epistatiche e migliorare la previsione degli effetti delle varianti e l'ottimizzazione dell'affinità degli anticorpi.

Stephen Zhewen Lu, Aakarsh Vermani, Kohei Sanno, Jiarui Lu, Frederick A Matsen, Milind Jagota, Yun S. SongMon, 09 Ma🤖 cs.LG

Risk mapping novel respiratory pathogens with large-scale dynamic contact networks

Questo studio sviluppa un modello basato su agenti che integra dati demografici e di mobilità olandesi per simulare la dinamica di trasmissione di nuovi patogeni respiratori su reti di contatto dinamiche, dimostrando come le caratteristiche geografiche e demografiche influenzino la diffusione epidemica e permettendo di valutare l'efficacia di strategie di intervento come l'isolamento e le restrizioni di viaggio.

Matthijs Romeijnders, Michiel van Boven, Debabrata PanjaMon, 09 Ma🔬 physics

Can deleterious mutations surf deterministic population waves? A functional law of large numbers for a spatial model of Muller's ratchet

Questo studio dimostra che, in un modello spaziale della ruota di Muller, il processo stocastico converge verso un sistema di equazioni differenziali alle derivate parziali che permette di determinare rigorosamente la velocità di diffusione della popolazione e di confermare la possibilità che le mutazioni deleterie "surfino" le onde demografiche.

João Luiz de Oliveira Madeira, Marcel Ortgiese, Sarah PeningtonMon, 09 Ma🔢 math

Extracting useful information about reversible evolutionary processes from irreversible evolutionary accumulation models

Questo studio dimostra che, sebbene i modelli di accumulo evolutivo assumano l'irreversibilità delle caratteristiche, possono comunque fornire stime affidabili sull'ordine temporale di acquisizione e sulla struttura dinamica dei percorsi evolutivi anche in scenari reali reversibili, pur presentando limiti nella stima dell'incertezza e delle interazioni.

Iain G. JohnstonFri, 13 Ma🧬 q-bio

abx_amr_simulator: A simulation environment for antibiotic prescribing policy optimization under antimicrobial resistance

Il paper introduce *abx_amr_simulator*, un ambiente di simulazione Python basato su API Gymnasium che permette di ottimizzare le politiche di prescrizione antibiotica e studiare la dinamica della resistenza antimicrobica attraverso agenti di apprendimento per rinforzo in scenari clinici caratterizzati da incertezza e osservazioni parziali.

Joyce Lee, Seth BlumbergFri, 13 Ma🧬 q-bio

A mean-field theory for heterogeneous random growth with redistribution

Questo studio teorico analizza la competizione tra crescita moltiplicativa casuale e ridistribuzione in sistemi su larga scala, rivelando che mentre una migrazione sufficiente previene la localizzazione estrema in condizioni statiche, l'aggiunta di rumore temporale induce una fase parzialmente localizzata che attenua ma non elimina la concentrazione, con implicazioni per la disuguaglianza di ricchezza e la crescita della popolazione.

Maximilien Bernard, Jean-Philippe Bouchaud, Pierre Le Doussal2026-03-11💰 q-fin

A hybrid discrete-continuum modelling approach for the interactions of the immune system with oncolytic viral infections

Il lavoro presenta un approccio di modellazione ibrido discreto-continuo che, derivando un limite continuo da un modello stocastico basato su agenti per le interazioni tra virus oncolitici e sistema immunitario, evidenzia come una risposta immunitaria troppo rapida possa ridurre l'efficacia della terapia e sottolineando la necessità di modulare tale risposta in base alle caratteristiche del tumore e del paziente.

David Morselli, Marcello E. Delitala, Adrianne L. Jenner + 1 more2026-03-10🧬 q-bio