🧬 biology

ResNet50 Features for Colon Histopathology: What Transfer Learning Actually Delivers

Questo articolo valuta l'efficacia delle caratteristiche di ResNet50 congelate per l'istopatologia del colon, riscontrando che, sebbene il transfer learning produca un'accuratezza di rilevamento quasi perfetta e un clustering biologicamente plausibile, non elimina la critica necessità di normalizzazione della colorazione, validazione esterna e spiegabilità per affrontare potenziali perdite di dati e bias.

Samjhana Shakya2026-07-29
🧬 biology

Epigenetic Age Estimates in Blood Shift by Decades with Cell Population: A Within-Donor Variance Partition Across Two Platforms and Two Study Designs

Questo studio dimostra che le stime dell'età epigenetica nel sangue variano di decenni a seconda della specifica popolazione cellulare analizzata, una variazione sufficientemente ampia da dominare i segnali biologici e confondere i confronti tra studi, stabilendo così la composizione cellulare come una variabile metodologica critica che richiede una segnalazione standardizzata.

Frederic Scheer2026-07-29
🧬 biology

AI Driven Analysis of Canola Rhizosphere Microbiome: Diversity, Core Microbiome, and Machine Learning Classification

Questo studio analizza il microbioma della rizosfera della colza utilizzando il sequenziamento dell'RNA ribosomiale 16S di 8.701 campioni per caratterizzarne la diversità e identificare un microbioma centrale, sviluppando infine un classificatore Random Forest altamente accurato basato sulle caratteristiche ASV per predire lo stato di salute della pianta.

Zariab Ahmed, Amina Shoukat Amina Shoukat, Saqib Hussain Hadri, Abdullah Tariq Abdullah Tariq2026-07-29
🧬 biology

Reorganization of lateral orbitofrontal neuronal ensembles underlies pain-related impairment of delayed gratification

Questo studio dimostra che il dolore infiammatorio cronico compromette la gratificazione ritardata nei ratti riorganizzando gli ensemble funzionali dei neuroni della corteccia orbitofrontale laterale, piuttosto che riducendo semplicemente la loro attività complessiva, interrompendo così la codifica di popolazione delle associazioni tempo-ricompensa.

Mariana Cerqueira-Nunes, Clara Monteiro, Vasco Galhardo, Helder Cardoso-Cruz2026-07-29
🧬 biology

Identification and analysis of immune-related risk genes associated with sepsis through RNA sequencing and single-cell localization techniques

Questo studio identifica e valida S100A8, S100A9 e S100A12 come geni di rischio legati all'immunità significativamente sovraespressi nei pazienti con sepsi, dimostrando la loro espressione predominante nei macrofagi e il potenziale coinvolgimento nella via di segnalazione PI3K-Akt attraverso l'integrazione di sequenziamento dell'RNA, bioinformatica, meta-analisi e verifica sperimentale.

Hongying Cao, Wei Chen, Peng Tang, Yingchun Hu, Youyu Lan2026-07-29
🧬 biology

Quantum Valence Constants and Structural Stability in DNA: The 10-5-6-5 Numerical Isomorphism as a Biological Ledger

Questo articolo propone un quadro teorico chiamato "Biotologia Quantitativa" che sostiene che una specifica sequenza numerica (10-5-6-5), derivata dalle costanti del legame di valenza e dall'analisi degli orbitali quantistici, rappresenti una costante matematica divina essenziale per la stabilità termodinamica e l'integrità strutturale del DNA.

Carlos Alberto Zuniga Gonzalez2026-07-29
🧬 biology

Phylogenomic and multi-omics analysis of Agarivorans sp. D1326 uncovers an agarolytic pathway involving rare GH118 β‑agarase

Questo studio caratterizza il batterio marino *Agarivorans* sp. D1326 attraverso analisi filogenomiche e multi-omiche per elucidare una rete agarolitica completa guidata da una rara GH118 β-agarasi e da percorsi enzimatici extracellulari e intracellulari coordinati per una degradazione efficiente dell'agar.

Tao Li, Cong Liu, Chengwei Wu, Boyu Zhang, Ziwei Wang, Yueyue Zhao, Wenbin Gu, Zilin Liu, Fanling Meng, Jingjing Shanggu (…)2026-07-29
🧬 biology

Bloominess defines an ecological axis of sporadic dominance that shapes antimicrobial resistance dynamics in the microbiome

Questo studio introduce la "bloominess", una nuova metrica che quantifica la dominanza sporadica nei microbiomi, per dimostrare che il comportamento ecologico dei taxa — specificamente la loro tendenza a espansioni estreme occasionali — è un fattore critico nel plasmare le dinamiche della resistenza antimicrobica oltre il mero contenuto genico.

Melanie Hay, Bhoomika Joshi, Khushbu Rana, Ankit Hinsu, Rameshchandra Pandit, Kelyn Seow, Androniki Psifidi, Richard Sta (…)2026-07-28