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🧬 biologia

Trypanosoma congolense Variant Surface Glycoprotein gene expression occurs in the absence of monoallelic transcription control

Questo studio rivela che, a differenza del strettamente correlato *Trypanosoma brucei* che esprime rigorosamente un singolo gene della Glicoproteina di Superficie Variante (VSG) alla volta, il *Trypanosoma congolense* manca del controllo della trascrizione monoallelica e invece co-esprime dinamicamente fino a circa 40 diversi VSG per cellula, sfidando l'assunto di un meccanismo comune per la variazione antigenica tra i trypanosomi africani.

Richard McCulloch, Jane Munday, Marija Krasilnikova, Catarina Marques, Stephen Larcombe, Pieter Monsieurs, Guy Oldrieve (…)2026-10-08
🧬 biologia

Culturomic recovery of the banana (Musa spp.) core microbiome creates a biobank for functional microbiome engineering

Questo studio stabilisce un biobanco coltivato del microbioma del cuore della banana attraverso la culturomica ad alto rendimento, consentendo la caratterizzazione funzionale di isolati che dimostrano tratti benefici per la pianta e un significativo potenziale per il controllo del devastante patogeno Fusarium.

Olwen M. Paterson, Jiarui Sun, Hazel R. Lapis-Gaza, Anthony B. Pattison, Rebecca Lyons, Paul G. Dennis2026-10-08
🧬 biologia

A Scalable Framework for Species-Resolved Human Gut Microbiome Profiling Using Full-Length 16S rRNA Sequencing

Questo studio dimostra che un flusso di lavoro scalabile di sequenziamento PacBio HiFi Kinnex dell'RNA ribosomiale 16S a lunghezza intera migliora significativamente la risoluzione tassonomica a livello di specie nel profilo del microbioma intestinale umano rispetto agli approcci standard V3-V4, raggiungendo l'assegnazione a livello di specie del 98% e rivelando un'estesa microdiversità all'interno di generi clinicamente rilevanti.

Parth Sarin, Paras Sehgal, Vasudev Paveri, Sakshi Rai, Ashriti Chettri, Rahul C. Bhoyar, Shahzad Mirza, Rajesh Karyakart (…)2026-10-08
🧬 biologia

DrugMiR: A Multi-Source Heterogeneous Graph Neural Network with Adaptive Feature-Embedding Fusion for Predicting miRNA-Mediated Drug Resistance and Sensitivity

DrugMiR è una rete neurale a grafo eterogenea multi-fonte che sfrutta la fusione adattiva dell'embedding delle caratteristiche e un'architettura a doppia testa sensibile alla direzione per prevedere accuratamente la resistenza e la sensibilità ai farmaci mediate dai miRNA, eccellendo in particolare in scenari induttivi con annotazioni biologiche incomplete fornendo al contempo approfondimenti interpretabili a livello genico.

Ye Cao, Ning Ai, Haoliang Yuan, Yong Liang2026-10-08
🧬 biologia

CG-QRNN: A Conditional Gated Quantum Recurrent Neural Network with Recurrent Temporal Attention

Il documento propone la Conditional Gated Quantum Recurrent Neural Network con Recurrent Temporal Attention (CG-QRNN), un'architettura innovativa che utilizza misurazioni a metà circuito per un gating efficiente dal punto di vista delle risorse e un meccanismo di attenzione temporale per catturare dipendenze a lungo raggio, ottenendo prestazioni e stabilità significativamente migliorate sui benchmark delle equazioni differenziali ordinarie rispetto ai metodi esistenti.

Haibin Wang, Tianjiao Li, Wenjie Liu, Qingshan Wu2026-10-08
🧬 biologia

Duration-dependent AVP/OT imbalance in the PVN→DRN circuit and DRN transcriptomic remodeling dissociate social preference from social recognition in chronically isolated male mice

Questo studio rivela che l'isolamento sociale cronico induce squilibri dipendenti dalla durata nei neuroni AVP/OT del PVN e un distinto rimodellamento trascrizionale nel DRN, che interrompono in modo differenziato la preferenza sociale e il riconoscimento attraverso il circuito PVN→DRN.

Fadao Tai, Jing Liu, Yuting Bai, Xiaohui Dang, Weizheng Zhang, Rui Fu, Miao Lin, Jialong Li, Liangteng Nie, Shimeng Cao (…)2026-10-08
🧬 biologia

A rapid single-nucleotide polymorphism genotyping method for mice using direct polymerase chain reaction of diluted crude lysates with HiDi DNA polymerase

Questo studio stabilisce un flusso di lavoro di genotipizzazione rapido, di due ore, per topi che combina lisati HotSHOT grezzi diluiti 100 volte con HiDi DNA polimerasi per ottenere un affidabile discrimine PCR allele-specifico di SNP senza la necessità di purificazione del DNA o sequenziamento Sanger.

Takahiro Watanabe, Yuki Miyagoshi, Yuka Nakamura, Yasuhito Ishigaki, Hirofumi Nishizono2026-10-08
🧬 biologia

Sex-dependent protection by neonatal 2’-fucosyllactose against gut dysbiosis, barrier dysfunction and food allergy in GDM offspring

L'integrazione neonatale di 2'-fucosillattosio mitiga la disbiosi intestinale, la disfunzione della barriera e la suscettibilità alle allergie alimentari indotte dal diabete gestazionale nella prole di topo attraverso il ripristino immunitario mediato dal microbiota, con un'efficacia terapeutica significativamente maggiore osservata nei maschi rispetto alle femmine.

Shenyan Ma, Feng Xu, Lin Zhou, R. Paul Ross, Catherine Stanton, Jianxin Zhao, Wei Chen, Bo Yang2026-10-08
🧬 biologia

Alleviation of Oxidative Stress Upregulates Protective Autophagy to Mediate PTX3-Induced Anoikis Resistance and Metastasis in HNSCC

Questo studio dimostra che nel carcinoma squamoso della testa e del collo, l'autofagia protettiva indotta dallo stress ossidativo aumenta la PTX3 glicosilata attraverso la via EGFR-ATG5/12 per potenziare l'espressione di survivina, guidando così la resistenza all'anoikis e la metastasi.

Ben-Kuen Chen, Ting-Wei Chang, Wan-Chen Huang, Shih-Hung Chan, Jhih-Peng Tsai, Jing-Ting Chiou, Hsiao-Yu Chang, Ying-Zhu (…)2026-10-08
🧬 biologia

Spatial Transcriptomics of Schizophrenia Insular Cortex Reveals Blood-Brain Barrier Hyperglycolysis and Increased Parenchymal Mitochondrial Respiration

Questo studio utilizza la trascrittomica spaziale su tessuto della corteccia insulare post-mortem per rivelare che la schizofrenia è caratterizzata da una disregolazione metabolica specifica per regione, che presenta iperglicolisi della barriera emato-encefalica e un aumento della respirazione mitocondriale parenchimale, il che contrasta con le riduzioni precedentemente riportate nelle analisi del bulk della corteccia prefrontale dorsolaterale.

Karin Huizer, Thao Tran, Vera van Dis, P. Roberto Bakker, Marc Claesen, Ies Nijman, Robin Geene, Nico J. M. van Beveren (…)2026-10-08