🧬 Category

q-bio

6191 articoli

🧬 biologia

Does RNA-seq Add Prognostic Value Beyond Clinical Variables Under Site-Held-Out Validation in TCGA-KIRC?

In una coorte TCGA-KIRC, un modesto guadagno prognostico derivante dall'aggiunta di dati RNA-seq alle variabili cliniche non è stato attenuato quando interi siti di provenienza del tessuto sono stati esclusi durante la validazione, suggerendo che la variazione correlata al sito non spieghi completamente i miglioramenti delle prestazioni riportati, sebbene i risultati siano limitati dal design a coorte singola e dalle scelte di modellazione specifiche dello studio.

Vikhram S2026-10-07
🧬 biologia

Transcriptomic Prediction of Bone Metastasis in Breast Cancer: A Methodological Investigation Revealing Limited Generalizability of Machine Learning Models

Questo studio dimostra che i modelli di apprendimento automatico addestrati su dati trascrittomici non riescono a generalizzare su set di test indipendenti per la previsione delle metastasi ossee del carcinoma mammario, evidenziando l'importanza critica di protocolli di valutazione rigorosi e privi di leakage rispetto ai risultati ottimistici della validazione incrociata.

Shunxin Yao2026-10-07
🧬 biologia

Patient-level coronary artery disease classification from cardiac MRI using out-of-fold heart segmentation and same-slice region controls

Questo studio dimostra che le rappresentazioni out-of-fold della regione di interesse cardiaca derivate da RM cardiaca superano significativamente l'immagine completa e i controlli extra-cardiaci nella classificazione della malattia coronarica a livello di paziente, sebbene i risultati rimangano una prova di concetto metodologica limitata da una coorte ridotta e dai vincoli del dataset.

David Vlad Marghidan2026-10-07
🧬 biologia

Comparative genome and protein analysis of Deinococcus radiodurans on heavy metal and radiation resistance

Questo studio impiega un approccio di genomica comparativa integrata, che include il sequenziamento dell'rRNA 16S, l'analisi filogenetica e l'identità nucleotidica media (ANI), per caratterizzare il genoma e il proteoma di *Deinococcus radiodurans* R1 DSM 20539T, rivelando la sua stretta relazione filogenetica con *D. wulumuqiensis* R12T e identificando i geni associati alla resistenza ai metalli pesanti e alle radiazioni.

Minde Hailu, Seid Mohammed2026-10-07
🧬 biologia

Kat6a functions to protect lower jaw patterning during cellular stress

Questo studio rivela che gli stress cellulari come l'etanolo esacerbano i difetti della mascella inferiore nei mutanti ed eterozigoti *kat6a*, interrompendo selettivamente l'espressione di *mef2ca* nel primo arco faringeo, svelando così un legame critico tra i meccanismi di patternizzazione anteroposteriore e dorsoventrale durante lo sviluppo craniofacciale.

Johann Eberhart, Ritika Ghosal, Mary Swartz, Joanna Liu, Anushree Patel2026-10-06
🧬 biologia

Mental health problems in pregnancy link maternal history of childhood maltreatment to altered newborn amygdala connectivity

Questo studio dimostra che i problemi di salute mentale materna in fase prenatale, in particolare i disturbi del sonno e il disagio specifico della gravidanza, mediano il legame tra la storia di maltrattamenti infantili della madre e l'alterata connettività amigdala-prefrontale nei neonati, con distinti modelli specifici per sesso osservati.

Vanessa Babineau, Seonjoo Lee, Zhijun Zhang, Zheshu Jiang, Elizabeth Werner, Jay Ginrich, Jonathan Posner, Bradley Peter (…)2026-10-06
🧬 biologia

Gastric cancer-specific neuroinflammation-related genes with prognostic significance: scRNA-seq with bulk RNA-seq data and experimental validation

Questo studio integra dati di sequenziamento dell'RNA bulk e single-cell con la validazione sperimentale per identificare una firma a cinque geni correlata alla neuroinfiammazione (GRIA3, NGF, SLC17A7, TGFB2 e TGFB3) che funge da robusto biomarcatore prognostico per il tumore gastrico, collegando questi geni al rimodellamento del microambiente tumorale, all'infiltrazione immunitaria e agli esiti clinici.

Xuemei Tao, Yuqing Zhou, Shunying YU, Xiaoyi Kuai, Chunli Zhou, Huiyu Wang2026-10-06
🧬 biologia

CD4+ T cell–T cell interactions preserve clonal diversity to recognize antigen variants

Questo studio dimostra che le interazioni tra cellule T CD4+ antigene-specifiche, mediate dall'inibizione della proliferazione dipendente da SOCS1, preservano la diversità clonale e gli intervalli di avidità ampi per potenziare l'adattabilità del sistema immunitario alla variazione antigenica.

Olivier Lantz, Hugo Roux, Vadim Karnaukhov, Sol-Yanel Nunez, rafael Paiva, Morgane Ducastel, Aurelie Darbois, Anastasia (…)2026-10-06
🧬 biologia

Allometry of intraspecific combat: Observations in extant terrestrial mammals and implications for sauropod dinosaurs

Analizzando i comportamenti di combattimento in 34 specie di mammiferi terrestri, questo studio dimostra che i vincoli allometrici sulla massa corporea limitano le tecniche di combattimento negli animali di grandi dimensioni, suggerendo che i dinosauri sauropodi probabilmente facevano affidamento su spinte a corpo intero e lotta con il collo piuttosto che su calci bipedi o cariche basate sul momentum.

Sebastian Ziehm, Andreas Christian2026-10-06