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🧬 biology

Integrative single-cell and bulk transcriptomic analysis with Shennong machine learning reveals the landscape of calmodulin associated prognostic genes in breast cancer

Questo studio integra analisi trascrizionali single-cell e bulk con l'apprendimento automatico di Shennong per identificare una firma prognostica della calmodulinina a otto geni nel carcinoma mammario, rivelando la sua associazione con la dinamica delle cellule epiteliali, specifici percorsi di segnalazione e potenziali bersagli terapeutici.

Jian Chen, Wenhui Lai, Can Yang2026-06-30
🧬 biology

Transcriptomic insights into gametogenesis and steroidogenic enzyme gene regulation in Australasian snapper (Chrysophrys auratus) gonads during the reproductive cycle

Questo studio presenta la prima analisi trascrittomica dell'intero trascrittoma delle gonadi di snapper australasiatico durante il loro ciclo riproduttivo, rivelando modelli di espressione genica specifici per sesso negli enzimi steroidei e nei processi di sviluppo, migliorando simultaneamente l'annotazione del genoma della specie per supportare la futura ricerca sull'acquacoltura e sulla riproduzione.

Samuel J. Modern, Matthew J. Wylie, Igor Ruza, Craig Radford, Maren Wellenreuther2026-06-30
🧬 biology

Implication of Aster-mediated transport and endocytosis in intestinal absorption and human bioavailability of fat-soluble vitamins

Questo studio dimostra che il trasporto non vescicolare mediato da Aster e le vie endocitiche sono critici per l'assorbimento intestinale e la biodisponibilità umana delle vitamine liposolubili D ed E, mentre la vitamina A utilizza una via indipendente da Aster.

Emmanuelle Reboul, Angélique Berthomé, Donato Vairo, Marine Chotard, Charles Desmarchelier, Mark Zumaraga, Patrick Borel (…)2026-06-30
🧬 biology

Submillimeter postmortem and in vivo diffusion and susceptibility magnetic resonance imaging to characterize cortical micro-and meso-structures

Questo studio dimostra che le metriche di risonanza magnetica di diffusione e di suscettibilità postmortem e in vivo a risoluzione submillimetrica esibiscono una moderata corrispondenza nel caratterizzare le micro- e meso-strutture corticali umane, fornendo un riferimento anatomico completo per collegare l'imaging postmortem ad alta fedeltà con le applicazioni di neuroimaging in vivo.

Yuto Uchida, Hyeong-Geol Shin, Laura Gomez-Isaza, Juan Troncoso, Adnan Bibic, Julianna Gerold, Dongsuk Sung, Yohan Jun (…)2026-06-30
🧬 biology

The influence of Enterocytozoon hepatopenaei infection on lipid and immune pathways in Litopenaeus vannamei

Questo studio utilizza analisi trasc tomiche e metabolomiche integrate per rivelare che l'infezione da *Enterocytozoon hepatopenaei* in *Litopenaeus vannamei* induce il ritardo della crescita attraverso la soppressione ribosomiale e manipola il metabolismo lipidico e la segnalazione immunitaria, potenzialmente dirottando le risorse di sintesi delle membrane dell'ospite per la formazione delle spore.

Xuan Zhang, Boyao Chen, Changkao Mu, Suming Zhou, Dong Qian, Ping Zhuang, Jiong Chen, Rongrong Ma2026-06-30
🧬 biology

Genomic Characterization of a Multidrug-Resistant Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae Strain from a Dog Shelter with Prolonged Co-Amoxiclav Use

Questo studio caratterizza un ceppo multiresistente di *Klebsiella quasipneumoniae* subsp. *similipneumoniae* isolato da un rifugio per cani in Malesia con una storia di uso prolungato di amoxicillina/acido clavulanico, rivelando un profilo microbico distinto tra i campioni fecali e quelli di drenaggio e sottolineando le lacune critiche nella gestione antimicrobica nel contesto One Health.

Zhen Yun Siew, Winnie Teh, Isaac Seow, Hong Soon Chin, Siew Tung Wong, Kalaiwaney Muniandy, Nur Amalina Binti Zaharudin (…)2026-06-30
🧬 biology

Long-term exposure to fluoride and tebuconazole alters gill, skin and gut microbiomes in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

L'esposizione cronica a concentrazioni ambientalmente rilevanti di fluoro e tebuconazolo altera la diversità alfa e beta, le reti di co-occorrenza e la composizione tassonomica dei microbiomi di branchie, pelle e intestino nella trota iridea, portando a un arricchimento di batteri patogeni e antibiotto-resistenti che può compromettere la salute dell'ospite e la stabilità dell'ecosistema più ampio.

Marine Suchet, Pauline Pannetier, Morgane Danion, Thomas Braunbeck, Préscillia Alves Gomes, Jérôme Cachot, Laure Bellec2026-06-30
🧬 biology

Feasibility of RNA Sequencing from Human Skin Microbiopsies in Actinic Keratosis and Basal Cell Carcinoma: A Paired Pilot Comparison with Shave Biopsy

Questo studio pilota dimostra che le microbiopsie cutanee minimamente invasive possono generare profili di sequenziamento dell'RNA di alta qualità e concordanti con quelli delle biopsie a rasamento convenzionali per cheratosi attinica e carcinoma basocellulare, stabilendo la fattibilità di questo approccio per la ricerca molecolare e sottolineando la necessità di studi più ampi e standardizzati per confermarne l'utilità clinica.

Miko Yamada, Vidiya Dev, Tarl Prow2026-06-30
🧬 biology

Deciphering lysosomal autophagy-linked differential gene signatures in Alzheimer’s disease: Multicohort bioinformatics analysis leveraging Gene Expression Omnibus datasets

Questo studio bioinformatico multicohorte identifica 44 geni differenzialmente espressi legati alla autofagia lisosomiale nella malattia di Alzheimer, evidenziando sette geni cruciali che formano un modello diagnostico robusto e suggerendo il loro potenziale come bersagli terapeutici attraverso il loro coinvolgimento nelle vie autofagia-lisosoma e nelle interazioni tra cellule immunitarie.

ying Peng2026-06-30