🧬 biologia

Single-Cell Multiplex Immune Biomarker Prediction from Histopathology Across Cancer Types and Clinical Endpoints

Questo studio introduce CellPlexer, un framework di deep learning che inferisce gli stati dei biomarcatori a singola cellula da immagini istopatologiche di routine H&E per predire accuratamente gli esiti clinici e le mutazioni molecolari attraverso molteplici tipi di cancro, offrendo un'alternativa scalabile e non distruttiva al costoso profilo spaziale multiplex.

Usman Afzaal, Usama Sajjad, Abdul Akbar, Tianyang Wang, Elshad Hasanov, Sachin Jhawar, Wei Chen, Zaibo Li, Muhammad Khal (…)2026-10-05
🧬 biologia

Deep Ensemble Learning with Graph Attention Mechanisms for Molecular Classification of HIV Inhibitors

Questo studio dimostra che un approccio ibrido che combina l'apprendimento automatico basato su impronte digitali, le Graph Attention Networks e gli ensemble di stacking affronta efficacemente lo squilibrio delle classi per migliorare la classificazione degli inibitori dell'HIV, evidenziando il valore complementare di diverse rappresentazioni molecolari per una scoperta di farmaci interpretabile.

Abdul Ahad, Md Mahabube Alahi Atik, Mirza Farhan Shahriar, Md Rahik Redwan, Kazi Tanvir Akter2026-10-05
🧬 biologia

Quantitative super-resolution imaging with deep learning segmentation reveals early mitochondrial network remodeling and altered mitochondria-lysosome interactions in Pompe disease muscle

Combinando l'imaging a super-risoluzione con la segmentazione tramite deep learning, questo studio rivela che la malattia di Pompe induce un rimodellamento precoce della rete mitocondriale specifico per il tipo di fibra e aumenti progressivi, dipendenti dalla regione, dei contatti mitocondrio-lisosoma nel muscolo scheletrico, fornendo un quadro quantitativo per monitorare la patofisiologia e valutare le terapie.

Ibrahim Hassani, Johan Deniaud, Chantal Thorin, Tony Fiore, Laurence Dubreil, Karl Rouger, Marie-Anne Colle2026-10-05
🧬 biologia

Knobs-into-Holes Engineering Enables Assembly of Bispecific Anti-HER2/Anti-HER3 Antibodies in Transient Plant Expression System

Questo studio dimostra che la strategia di ingegneria Knobs-into-Holes, combinata con la co-infiltrazione transitoria in *Nicotiana benthamiana*, consente la produzione efficiente di anticorpi bispecifici eterodimerici funzionali che prendono di mira sia HER2 che HER3.

Keunbeom Youk, Hyunjoo Hwang, MinKue Kim, Yerin Kim, Waranyoo Phoolcharoen, Prabhat Shrestha, Simmyung Yook, Jeong Hwan (…)2026-10-05
🧬 biologia

Life-time radio tracking of periodical cicadas detects minimal dispersal from emergence sites

Il tracciamento radio per l'intera durata della vita rivela che le cicale periodiche esibiscono una dispersione minima dai loro siti di emergenza natali, suggerendo che le loro distribuzioni di prole stabili e non sovrapponibili siano mantenute da una naturale mancanza di movimento piuttosto che da meccanismi di isolamento ambientale o comportamentale attivo.

Martin Wikelski, Martin Bihrle-Johnson, Henry Horn, B. Rosemary Grant, Peter R. Grant, Chris Simon2026-10-05
🧬 biologia

Quantitative gene-level inference of tumor transcription from plasma epigenomes

Questo studio introduce APEX, un framework di apprendimento automatico che sfrutta le caratteristiche epigenomiche del plasma, inclusi i pattern di modifica istonica e la periodicità della frammentazione del DNA, per inferire accuratamente la trascrizione genica singola tumorale a livello genomico attraverso diversi tipi di cancro, consentendo così il monitoraggio di bersagli terapeutici e biomarcatori senza i limiti degli approcci esistenti ad alta frazione o di espressione bulk.

Matthew Freedman, Gunsagar Gulati, Damien Vasseur, Rashad Nawfal, Shahabeddin Sotudian, Karl Semaan, Marc Eid, Ji-Heui S (…)2026-10-05
🧬 biologia

Bifidobacterium longum Bianquejun 19 Suppresses Helicobacter pylori Motility and Colonization by Disrupting Energy Metabolism

Questo studio dimostra che *Bifidobacterium longum* Bianquejun 19 sopprime la crescita, la motilità e la colonizzazione di *Helicobacter pylori* interrompendo il metabolismo del carbonio centrale e la funzione della catena respiratoria, riducendo conseguentemente l'infiammazione gastrica e la deposizione di collagene nei topi infetti.

Yajie Zhang, Lijuan Kang, Yinqing Li, Liang Zhao, Yuanhong Xie, Hongxin Zhang, Ran Wang, Junhua Jin2026-10-05
🧬 biologia

No PCR or serologic evidence of exposure of Alaskan sled dogs to Bartonella spp. bacteria

Uno studio su 75 cani da slittaia dell'Alaska non ha riscontrato prove di esposizione a *Bartonella* spp. tramite PCR o sierologia, suggerendo che i batteri siano attualmente assenti in questa popolazione nonostante la necessità di un monitoraggio continuo a causa dei potenziali spostamenti nella distribuzione guidati dal clima.

Cristina M Hansen, Tatianna Krueger, Rivers Leverett, Joanne E McCrea2026-10-05
🧬 biologia

Automated estimation of gadoid and flatfish abundance in stereo-BRUV footage using YOLO object detection

Questo studio presenta una pipeline automatizzata basata su YOLO che rileva con successo gadoid e pesci piatti in filmati stereo-BRUV provenienti da parchi eolici del Mare del Nord, introducendo una metrica personalizzata per convalidare la sua capacità di stimare efficientemente l'abbondanza ittica e dimostrando che la combinazione di due punti di vista delle telecamere migliora la sensibilità delle stime di popolazione rispetto ai singoli punti di vista.

Mario Lambrette, Anthony W. J. Bicknell, Samuel Gierhart, Matthew J. Witt2026-10-05
🧬 biologia

Tuning the Cell-Microchip Interface to Control the Cellular Interaction of Silicon Oxide Microdevices

Questo studio dimostra che la modifica sistematica della chimica superficiale dei microchip di ossido di silicio per controllare la carica e la bagnabilità modula significativamente l'efficienza di internalizzazione cellulare attraverso meccanismi dipendenti dalla riorganizzazione dell'actina, mantenendo al contempo un'elevata citocompatibilità, stabilendo così una piattaforma robusta per l'ottimizzazione del rilascio intracellulare.

Pascual López-Algarra, Saman Bagherpour, Marta Duch, Juan Pablo Agusil, José Antonio Plaza, Sergio Martínez-Ruiz, Josefa (…)2026-10-05