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🧬 biology

Evaluating porcine antisense oligonucleotide RNA-seq for cross- species virtual-knockout benchmarking

Questo studio valuta i dati di RNA-seq di oligonucleotidi antisenso su suino per determinare la validità del benchmarking di knockout virtuale tra specie diverse, concludendo che, sebbene la valutazione dell'intero trascrittoma sia inaffidabile a causa delle discrepanze degli stimatori, la valutazione della classifica dei geni leader è riproducibile e offre un bersaglio difendibile per estendere i modelli di perturbazione derivati dall'uomo al bestiame.

Xiaotong Zhao, Hua Chang, Zhuoyu Zhao, Xun Xiang2026-09-10
🧬 biology

Geographic Variation in the Urinary Microbiota of Patients with Urolithiasis

Questo studio transnazionale rivela che, sebbene la ricchezza microbica urinaria sia simile, la composizione complessiva della comunità e le abbondanze tassonomiche specifiche nei pazienti con urolitiasi differiscono significativamente tra Taiwan e la Corea del Sud, suggerendo che i fattori geografici e ambientali plasmino profili distinti del microbiota urinario associati alla patologia litica.

Hsiang Ying Lee, Chun Kai Chang, Wen-Jeng Wu, Deng‐Chyang Wu, Sung Yong Cho2026-09-10
🧬 biology

Adaptation and psychometric evaluation of the BANKS-SP biobanking survey in longstanding dengue virus cohorts in Colombia and Nicaragua

Questo studio adatta e valuta le proprietà psicometriche del sondaggio sul biobanking BANKS-SP in coorti di dengue colombiane e nicaraguensi, riscontrando che, mentre la Scala dell'Autoefficacia ha fornito prestazioni adeguate, la Scala degli Atteggiamenti richiede una revisione e entrambi i siti hanno mostrato lacune significative nella conoscenza della governance dei biospecimen e dei quadri giuridici.

Lauren Maxwell, Mahir Bhatt, Harold Suazo Laguna, Jackeline Bravo Chamorro, María Consuelo Miranda Montoya, Luz Leegstra (…)2026-09-10
🧬 biology

Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells Alleviate Osteoblast Differentiation Disorder Induced by Oxidative Stress by Inhibiting Ferroptosis Through the miR-218-5p/CBX3 Axis

Questo studio dimostra che le cellule staminali mesenchimali del cordone ombelicale (UC-MSC) alleviano i disturbi del differenziamento degli osteoblasti indotti dallo stress ossidativo e inibiscono la ferroptosi aumentando l'espressione di miR-218-5p, che bersaglia e sopprime CBX3, ripristinando così la funzione osteogenica attraverso l'asse di segnalazione miR-218-5p/CBX3.

Lintong Li, Yunda Huang, Yuan Ma, Jiaxin Liu, Yu Chang2026-09-10
🧬 biology

Noncanonical catalytic-relay geometry and PET-oligomer accommodation in a CheB-like α/β-hydrolase from Pseudomonas marincola

Questo studio dimostra che, sebbene una idrolasi di tipo CheB-like di *Pseudomonas marincola* possieda un motivo Ser–His–Asp, la sua geometria catalitica non canonica e i limitati indicatori di docking degli oligomeri indicano che non è preorganizzata per una degradazione efficiente del PET, evidenziando che la sola conservazione del motivo non garantisce la funzione enzimatica.

Mahira Shaikh2026-09-10
🧬 biology

A novel topology-guided adaptive strategy for automated nuclear-cytoplasmic H-Score quantification in immunohistochemistry

Questo articolo introduce un plugin per ImageJ/Fiji open-source e training-free che combina il rilevamento nucleare StarDist con una strategia di segmentazione basata su Voronoi guidata dalla topologia e una calibrazione adattiva per ottenere una quantificazione automatizzata altamente accurata e riproducibile degli H-score nucleari e citoplasmatici attraverso diversi dataset di immunoistochimica.

Weiyu Wang, Mengting Lin, Fuxian Zou, Zhenzhen Yang, Mingqing Huang, Changxian Chen2026-09-10
🧬 biology

Reduced Representation Nanopore Sequencing: A Cost-Effective Workflow for Accurate and High-Throughput Targeted DNA Methylation Profiling

Lo studio introduce la sequenziatura Nanopore a Rappresentazione Ridotta (RRNS), un flusso di lavoro economico che combina l'arricchimento mirato basato su MspI con la sequenziatura diretta Nanopore per consentire un profilo di metilazione del DNA ad alto rendimento e accurato, superando al contempo i limiti della conversione con bisolfito e gli elevati costi del sequenziamento dell'intero genoma.

Keisho Hasegawa, Daigo Okada, Kengo Suzuki, Marumi Ishikawa, Akinori Tsuruma, Masaki Kimura, Yoshimasa Saito2026-09-10
🧬 biology

Gene Expression Signatures and Hub Genes in Cervical Cancer: A Bioinformatics-Based Roadmap to Early Diagnosis and Targeted Therapy

Questo studio bioinformatico analizza i profili di espressione genica del tumore della cervice uterina per identificare 155 geni differenzialmente espressi e sei geni hub (CRNN, SPINK5, GBP6, IFI44, CDKN2A e CXCR4), proponendoli come potenziali biomarcatori per la diagnosi precoce e la terapia mirata al fine di migliorare gli esiti clinici dei pazienti.

Yahya Ibrahim Hassan, Murtala Muhammad Jibril, Umar Ahmad2026-09-10