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🧬 biologia

Simulated Annealing Identifies Five Shared Drivers of T Cell Exhaustion Across Four Human Cancers

Applicando un nuovo framework di annealing simulato ai dati di sequenziamento dell'RNA a singola cella da quattro tumori umani, questo studio identifica cinque driver conservati dell'esaurimento dei linfociti T e venti nuovi geni candidati, rivelando al contempo firme di esaurimento tessuto-specifiche che mettono in discussione il ruolo universale di marcatori precedentemente riportati come NR4A1.

alireza ebadi2026-09-16✓ Author reviewed ⓘ
🧬 biologia

Invasive lobular carcinoma is characterized by IL33-high differentiated endothelium and IL33 receptor-positive mast-cell enrichment

Questo studio rivela che il carcinoma lobulare invasivo è distinto da un microambiente vascolare-immunitario unico caratterizzato da un endotelio differenziato ad alta espressione di IL33, una ridotta gemmazione angiogenica e un arricchimento di mastociti che esprimono IL1RL1, i quali collettivamente lo differenziano dal carcinoma duttale invasivo.

Jules Cohen2026-09-16
🧬 biologia

ViroNEXT: A multilayer hybrid system for high-precision detection of known and divergent viruses in metagenomics

ViroNEXT è una pipeline ibrida multilivello, completamente automatizzata e open-source, che combina approcci basati su riferimento e di machine learning per ottenere un rilevamento ad alta precisione di virus sia noti che altamente divergenti nei dati metagenomici, riducendo significativamente le classificazioni di falsi positivi.

Markus Santhosh Braun, Gibran Horemheb Rubio Quintanares, Martin Machyna, Janice Durschang, Csaba Miskey, Xiang-Jun Lu (…)2026-09-16
🧬 biologia

Hybrid Deep Learning–Based Computer Vision Framework for Brain Organoid and Embryoid Body Segmentation

Questo articolo presenta un framework di visione artificiale basato su un apprendimento profondo ibrido che combina il filtraggio mediano, l'equalizzazione dell'istogramma e l'algoritmo Watershed per ottenere una segmentazione e un'estrazione delle caratteristiche superiori per le immagini di organoidi cerebrali e corpi embrionari.

S. Thangapriya, K. R. Ananthapadmanaban, M. Kannan2026-09-16
🧬 biologia

Adaptive Quantum Approximate Optimization for Genomic Classification

Questo articolo introduce un Adaptive Quantum Approximate Optimization Algorithm (QAOA) che utilizza la selezione degli operatori guidata dal gradiente per costruire dinamicamente circuiti specifici per il problema, dimostrando precisione, specificità ed efficienza hardware superiori rispetto alle varianti a architettura fissa per la classificazione di sequenze genomiche sotto vincoli di rumore NISQ realistici.

Sthefanie Jofer Gomes Passo, Vishal H. Kothavade, John J. Prevost2026-09-15
🧬 biologia

Probing Deep Prefrontal Cortex Mechanisms of Memory Control Using Theta Band Temporal Interference Stimulation

Questo studio esplorativo dimostra che la stimolazione a interferenza temporale transcranica (tTIS) può colpire in modo non invasivo i circuiti prefrontali profondi per modulare differenzialmente i meccanismi di controllo della memoria, con la stimolazione focale della dACC che potenzialmente potenzia l'oblio indotto dal recupero e la stimolazione prefrontale dispersa che accelera il decadimento delle memorie facilitate, convalidando così la tTIS come uno strumento promettente per investigare i contributi del cervello profondo alla memoria umana.

Ahsan Khan, Long-Fung Mak, Chun Hang Eden Ti, Margaret Y. Y. Lam, Marie C. M. Chow, Jirapong Saelor, Yupeng Liu, Sadia S (…)2026-09-15
🧬 biologia

Alternative Polyadenylation Landscape Highlights its Critical Roles in Fine-tuning Cadmium Stress Response in Rice

Questo studio utilizza dati di RNA-seq per rivelare che la poliadenilazione alternativa funge da meccanismo regolatorio critico e dose-dipendente nel riso sotto stress da cadmio, orchestrando cambiamenti nell'espressione genica tessuto-specifici e temporali nella fotosintesi, nella risposta allo stress e nella sintesi proteica attraverso la modulazione della selezione del sito poly(A) e della stabilità del trascritto mediata da miRNA.

Zhengfeng Zhang, Tao He, Sichen Luo, Benze Xiao2026-09-15
🧬 biologia

Distinct structural mechanisms drive gain-of-function activation of TMEM16E in gnathodiaphyseal dysplasia

Questo studio rivela che le mutazioni di guadagno di funzione G503E e R582I associate alla displasia gnatodiafisaria attivano TMEM1E attraverso meccanismi strutturali distinti — interrompendo l'interfaccia TM3–TM4 e rimodellando una rete di loop extracellulari, rispettivamente — nonostante i loro simili fenotipi funzionali.

Alessio Accardi, Eleonora Di Zanni, Omar Alvarenga, Nicole Rychlik, Zhang Feng, Elizabeth Kim, George Khelashvili2026-09-15
🧬 biologia

Analysis of the transmission of Staphylococcus aureus drug resistance and genetic diversity in the ‘animal-environment/food-human’ dairy production chain

Questo studio, basato sul concetto di "One Health", ha analizzato 2.236 campioni della filiera lattiero-casearia cinese per rivelare che lo *Staphylococcus aureus*, in particolare i cloni ST59 multiresistenti, ha origine principalmente dal portatore bovino e si diffonde attraverso attrezzature per la mungitura contaminate e una scarsa igiene degli operatori, ponendo un significativo rischio di trasmissione per i consumatori.

Fangyuan Hu, Juan Wang, Yaopeng Liu, Xiuli Zuo, Sijun Zhao, Cuiping Song, Xiumei Huang, Lin Wang, Zhina Qu2026-09-15