🧬 biologia

Influence of Inorganic Particle Incorporation on Biofilm Mechanical Stability

Questo studio dimostra che l'incorporazione di particelle inorganiche nei biofilm ne potenzia significativamente la resistenza meccanica e la stabilità viscoelastica attraverso le interazioni tra particelle e EPS, rivelando che i modelli di biofilm tradizionali privi di particelle sottostimano sistematicamente la resilienza meccanica dei reali strati di fouling.

Shifa Mohamed Razzaq Shaikh, Khaled A. Mahmoud, Peter Desmond2026-08-31
🧬 biologia

Beavers on the selection-drift seesaw: imprints of the past and present-day processes on the MHC genes variability in the Eurasian beaver

Questo studio dimostra che la variabilità del gene MHC del castoro eurasiatico è stata plasmata da una selezione storica positiva e bilanciante, severamente ridotta da un collo di bottiglia della popolazione nel XX secolo, e solo parzialmente ripristinata attraverso la recente espansione senza prove di una selezione attuale.

Jan Náhlovský, Marco Heurich, Steven K. Windels, Frank N. Rosell, Christian A. Robstad, Alexander P. Saveljev, Aleš Vore (…)2026-08-31
🧬 biologia

Long-Term Seagrass Decline and Spatial Reorganization of Blue Crabs in the Indian River Lagoon

La perdita di lungo termine delle praterie di fanerogame marine nell'Indian River Lagoon, causata dall'arricchimento di nutrienti e da eventi climatici, ha provocato un significativo declino dell'abbondanza e della dimensione del granchio blu, innescando al contempo una riorganizzazione spaziale delle popolazioni verso la parte meridionale della laguna, evidenziando la dipendenza critica dei granchi blu da habitat di nursery vegetati continui.

Jackson L. Evans, Hyun Jung Cho2026-08-31
🧬 biologia

Evaluating Computational Tools for CRISPR-Cas9 Design: A Case Study on the TP53 Gene

Questo studio valuta tre popolari strumenti di progettazione di gRNA CRISPR-Cas9 (CHOPCHOP, Benchling e IDT) che prendono di mira il gene TP53, rivelando discrepanze significative tra i loro candidati principali a causa di distinti algoritmi di punteggio e sottolineando la necessità di una convalida incrociata multi-piattaforma per un efficace design di knockout genico.

Mara Ioana Manolescu, Bogdan Emil Manolescu2026-08-31
🧬 biologia

Proteomic profiling of formalin-fixed paraffin-embedded specimens reveals candidate intraoperative diagnostic biomarkers for Hirschsprung disease

Questo studio ha utilizzato il profilo proteomico di tessuti inclusi in paraffina e fissati in formalina per identificare quattro nuovi biomarcatori candidati (CTNNA2, EPDR1, NACAD e NCAM2) che sono espressi specificamente nelle regioni gangliari, offrendo strumenti promettenti per la diagnosi intraoperatoria della malattia di Hirschsprung.

Shigemitsu Kojima, Ayako Yamazaki, Masahito Yoshihara, Ryo Konno, Kenichiro Konishi, Shinya Takazawa, Akira Nishi, Jun F (…)2026-08-31
🧬 biologia

Context-aware LLM extraction and controlled-vocabulary normalization of GEO transcriptomic sample metadata

Questo articolo presenta una pipeline di modelli linguistici di grandi dimensioni distribuibile localmente che estrae e normalizza metadati trascrizionali GEO non strutturati in etichette strutturate con vocabolario controllato per tessuto, condizione e trattamento, raggiungendo un'elevata accuratezza e superando significativamente i metodi di corrispondenza deterministici.

Mateusz Szczepaniak, Jonathan Wren2026-08-31
🧬 biologia

Associations between bacteriome and chemical pollutants in indoor dust from Czech households

Questo studio analizza la polvere domestica di 88 nuclei familiari cechi per rivelare associazioni significative tra specifici generi batterici, come *Methylobacterium-Methylorubrum* e *Sphingomonas*, e vari inquinanti chimici quali IPA e PBDE, suggerendo che le interazioni tra contaminanti biologici e chimici possano alterare i rischi per la salute indoor, nonostante la necessità di ulteriori ricerche meccanicistiche per stabilire la causalità.

Klvanova Eva, Jan Böhm, Paula Marcinekova, Lisa Melymuk, Petr Kukacka, Petr Senk, Jakub Martinik, Petra Pribylova, Simon (…)2026-08-31
🧬 biologia

Comprehensive Comparative Evaluation and Consensus Strategy for CRISPR/Cas9 gRNA Design Targeting the TaDREB1 Gene in Bread Wheat (Triticum aestivum)

Questo studio stabilisce una solida strategia di consenso per la progettazione di gRNA CRISPR/Cas9 nel frumento tenero confrontando cinque strumenti di predizione mirati al gene TaDREB1 per identificare una sequenza guida altamente affidabile e mettere in evidenza i limiti critici negli attuali output algoritmici.

Tarek Osama Mohamed Amin, Ghufran Siddiq2026-08-31
🧬 biologia

A Computationally De-Risked CD47 Inhibitor for Glioblastoma

Questo studio presenta una pipeline di scoperta di farmaci guidata dal calcolo computazionale che ha identificato e ingegnerizzato una nuova proteina di cefalopode secreta, non-Fc, denominata AOA_UR2_F7P_M16C, come un potente inibitore di CD47 deimmunizzato con un alto potenziale per il trattamento del glioblastoma, evitando al contempo la tossicità ematologica e l'immunogenicità delle precedenti terapie anticorpali.

Timothy Payton2026-08-31