🧬 biologia

Study on the mechanism of type 2 diabetes mellitus on tendon repair based on bioinformatics analysis combined with machine learning models

Questo studio integra la randomizzazione mendeliana, la bioinformatica e l'apprendimento automatico per stabilire un legame causale tra il diabete di tipo 2 e l'alterazione della riparazione tendinea, identificando MYL2, MYL3 e TTN come geni hub chiave che probabilmente interrompono la guarigione attraverso la disfunzione del citoscheletro e le alterazioni immunitarie mediate dai macrofagi.

Shulong Sun, Hua Li, Guanghui Li, Yan Li, Liubing Yang, Yujing Cao, Ji Li2026-08-31
🧬 biologia

3D µEFPocket for Multimodal Communications with Brain Organoids

Questo articolo introduce il µEFPocket, un'interfaccia biologica microfluidica conforme e ultrasottile fabbricata in parylene C che consente la stimolazione simultanea, ad alta risoluzione spatiotemporale, chimica ed elettrica insieme alla registrazione ottica ed elettrica in organoidi cerebrali umani, superando così le sfide della complessità 3D per facilitare saggi funzionali multimodali e studi a circuito chiuso.

Yihang Wang, Miguel Cuevas, Zhihan Zhang, Gooyoon Chung, Jingze Zhang, Yilan Yin, Qianzhi Luo, Will Lipman, Josh Henders (…)2026-08-31
🧬 biologia

Exploration of Evolutionary Dynamics and Genomic Architecture in Acinetobacter baumannii

Questo studio integra analisi del pan-genoma, filogenomiche e composizionali per rivelare che il lignaggio ST2 di *Acinetobacter baumannii*, dominante a livello globale, si affida a un'architettura genomica aperta in cui i geni della resistenza antimicrobica acquisiti orizzontalmente sono mantenuti stabilmente all'interno di isole genomiche, sottolineando la critica necessità di una sorveglianza genomica completa attraverso cromosomi, plasmidi e fag *** *Note: In Italian, "fagi" (plural of phage) is often used, but "fagi" or "batteriofagi" is the standard term. I have provided the direct translation.* **Corrected single sentence version:** Questo studio integra analisi del pan-genoma, filogenomiche e composizionali per rivelare che il lignaggio ST2 di *Acinetobacter baumannii*, dominante a livello globale, si affida a un'architettura genomica aperta in cui i geni della resistenza antimicrobica acquisiti orizzontalmente sono mantenuti stabilmente all'interno di isole genomiche, sottolineando la critica necessità di una sorveglianza genomica completa attraverso cromosomi, plasmidi e fagi.

Rhythm Sharma, Dinesh Lakhanpal2026-08-31
🧬 biologia

Long-read RNA-seq resolves isoform-level and context-specific regulatory architecture of complex traits in cattle

Questo studio sfrutta dati di RNA-seq a lettura lunga su scala di popolazione e dati multi-omici da 432 vacche da latte per costruire un atlante trascrizionale bovino completo, rivelando migliaia di nuove isoforme e varianti regolatorie contestuali che migliorano significativamente la risoluzione della genetica dei tratti complessi e colmano il vuoto della "regolazione mancante" lasciato dai metodi tradizionali a lettura breve.

Lingzhao Fang, Weijie Zheng, Qi Zhang, Jinfeng He, Xiaoning Zhu, Mian Gong, Houcheng Li, Lin Liu, Jianbin Li, Zhu Ma, Bo (…)2026-08-31
🧬 biologia

Valorization of Shrimp Shell Waste: Crude Protease-Assisted Astaxanthin Extraction Using Bacillus cereus XT-1 and Functional Gene Analysis

Questo studio dimostra che *Bacillus cereus* XT-1, che sovraregola il gene *nprC* per produrre una chiave proteasi neutra da 35 kDa, funge da agente biologico efficiente e sostenibile per l'estrazione di astaxantina ad alta resa e stabile dai residui di gusci di gambero con un'attività antiossidante potenziata.

Xiaoxi Zeng, Lan Yu, Cheng Zhang, Keting Lei, Xuan Li, Yongjian Shao, Lingzhi Chen, Yang Fang, Jie Liu, Liang Ma2026-08-30
🧬 biologia

Symbiodiniaceae shifts in the corals Acropora cf. solitaryensis and A. aff. divaricata at the climate-driven poleward margin

Questo studio dimostra che, mentre le popolazioni in espansione di *Acropora cf. solitaryensis* e *A. aff. divaricata* al loro margine verso il polo guidato dal clima mantengono un'elevata diversità genetica dell'ospite e connettività, esse esibiscono assemblaggi distinti di Symbiodiniaceae caratterizzati da uno spostamento dai simbionti della radiazione C3 alla radiazione C1, probabilmente guidato da temperature dell'acqua di mare più basse.

Nina Yasuda, Akifumi Shimura, Masumi Kamata, Hiroki Taninaka, Kenji Takata, Takashi Nakamura, Akira Iguchi, Takehisa Yam (…)2026-08-30
🧬 biologia

Sexual evolution in plants: genetic network co-option and reproductive innovation

Questa recensione propone un quadro evolutivo integrativo che dimostra come la riproduzione sessuata delle piante, originatasi nelle alghe verdi ancestrali oltre un miliardo di anni fa, si sia diversificata attraverso le linee terrestri mediante l'iterativa cooptazione, duplicazione e riconfigurazione di moduli genetici conservati, quali i fattori di trascrizione MADS-box e i sistemi ormonali.

Vladimir Brukhin2026-08-30
🧬 biologia

A Two-step Feature Selection Framework for Computationally Efficient Machine Learning on Genome-wide SNP Data

Questo articolo propone un framework di selezione delle caratteristiche in due fasi che combina il filtraggio rigido basato sulla varianza con XGBoost per ridurre 61 milioni di SNP a un sottoinsieme computazionalmente trattabile, consentendo una previsione efficiente dell'origine geografica basata sull'apprendimento automatico su dataset genomici su larga scala senza requisiti di risorse proibitivi.

Jinhyun Kim, Seungjun Lee, Daewon Lee, Seo Woo Song, Cheolheon Park, Huiran Yeom2026-08-30