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Plant architecture reveals contrasting developmental strategies in two threatened West African timber species (Khaya senegalensisand Pterocarpus erinaceus): implications for conservation and sustainable forest management

Questo studio fornisce la prima caratterizzazione architettonica completa delle specie legnose minacciate dell'Africa occidentale *Khaya senegalensis* e *Pterocarpus erinaceus*, rivelando i loro distinti modelli di sviluppo e le risposte plastiche ai gradienti ambientali per stabilire una base scientifica per l'ottimizzazione della loro conservazione, riforestazione e gestione sostenibile.

Beda Innocent ADJI, Doffou Sélastique Akaffou, Kouadio Henri Kouassi, Marc Jaeger, Sylvie Annabel Sabatier, Jérôme Dumin (…)2026-07-24
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EEG-to-Report: An Annotation and Feature–Text Framework for Training Language Models on Clinical EEG

Il documento presenta EEG-to-Report, un framework basato su browser che snellisce l'annotazione clinica dell'EEG integrando l'acquisizione di dati multi-formato, la visualizzazione interattiva e l'estrazione automatizzata di caratteristiche per generare coppie strutturate caratteristica-testo per l'addestramento di modelli linguistici multimodali e la stesura di rapporti clinici automatizzati.

The Tran2026-07-24
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A Consensus Multifeature Deviation Index for Specific Detection of Locomotor Perturbation From Individualized-Baseline Wearable Inertial Signals

Questo articolo introduce il Gait Perturbation Burden (GPB), un indice multifeature di consenso non supervisionato che sfrutta baselines inerziali indossabili individualizzate per rilevare specificamente le perturbazioni locomotorie con un numero significativamente ridotto di falsi positivi durante la deambulazione normale rispetto ai metodi a singola caratteristica o basati solo sull'ampiezza.

Alex Kubiak, Farzad Haji Boloori, Jared Nichols2026-07-24
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Phylogeny-associated codon evolution and conditional boundary dinucleotide structure in Platycerium plastomes

Questo studio dimostra che l'uso dei codoni sinonimi nei plastomi di *Platycerium* conserva segnali filogenetici attraverso le linee geografiche, rivelando al contempo un deficit conservato ed evolutivamente significativo di dinucleotidi CpG ai confini dei codoni che persiste nonostante rigorosi controlli sulla composizione della sequenza e sul conteggio dei codoni.

Jun-Wei Yang, Cheng-Hsun Lee, Hsuan-Wei Huang, Wei-Mei Hsieh, Su-Lan Hsu2026-07-24
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Human Precursor microRNA Terminal Loop Regions Exhibit Distinct Sequence Characteristics and Motif Enrichment

Questo studio fornisce la prima caratterizzazione completa delle regioni del loop terminale dei pre-miRNA umani, rivelando architetture di sequenza distinte definite da specifiche distribuzioni di lunghezza, bias nucleotidici posizionali e motivi arricchiti che possono influenzare la biogenesi dei miRNA e le interazioni proteiche.

Amit Cohen, Mario Alberto Burgos-Aceves, Yoav Smith2026-07-24✓ Author reviewed ⓘ
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Do Single-Cell Models Learn Real Biology? An Empirical Analysis of Physical Interaction Signal in Pretrained scGPT Gene Embeddings

Questo studio empirico dimostra che gli embedding dei geni pre-addestrati del modello scGPT codificano intrinsecamente strutture di interazione proteina-proteina fisiche, come evidenziato dalla significativamente maggiore similarità del coseno tra coppie di geni interagenti rispetto ai controlli non interagenti appaiati attraverso molteplici database.

Liu Chen2026-07-24
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Mechanistic Interpretability of Biological Foundation Models: An Empirical Analysis of scGPT Gene-Embedding Geometry

Questo articolo dimostra empiricamente che lo spazio di embedding statico dei gene-token del modello foundation scGPT codifica informazioni rilevabili, sebbene moderate, su note interazioni proteina-proteina fisiche, come evidenziato da similarità del coseno e metriche di predizione delle interazioni significativamente più elevate per le coppie di geni interagenti rispetto ai controlli non interagenti.

Liu Chen2026-07-24
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What Knowledge Can Be Extracted from Single-Cell Data? An Empirical Analysis of Donor-Robust Cell-Type Annotation

Un'analisi empirica di dati di sequenziamento dell'RNA a singola cellula del pancreas umano dimostra che, per i tipi cellulari abbondanti e canonici, i modelli di annotazione del tipo cellulare si generalizzano in modo robusto tra i donatori con solo modesti cali di prestazioni quando valutati tramite la tecnica leave-one-donor-out rispetto alla suddivisione casuale, sottolineando la necessità di dichiarare esplicitamente l'ambito della popolazione e quello tecnico quando si rivendica una conoscenza estratta da dati a singola cellula.

Liu Chen2026-07-24
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When Do Single-Cell Foundation Models Beat PCA? A Simulation-Based Empirical Analysis of Label Scarcity and Perturbation Generalization

Questo studio basato su simulazioni dimostra che i modelli di fondazione single-cell superano significativamente le pipeline classiche di PCA nei compiti di annotazione con scarsità di etichette (1–5 cellule etichettate per classe), ma offrono poco o nessun vantaggio rispetto ai semplici baseline lineari quando sono disponibili etichette sufficienti o quando si prevede la risposta a nuove perturbazioni.

Liu Chen2026-07-24