🧬 Category

q-bio

6547 articoli

📄 altro

Rank or Value? An Empirical Analysis of Single-Cell Transformer Tokenization under Sequencing-Depth Loss

Questo studio empirico dimostra che, nel sequenziamento dell'RNA a singola cellula, la suddivisione in bin di valori di espressione fissi supera la codifica del rango della mediana del corpus per la classificazione cellulare in condizioni di perdita di profondità di sequenziamento, rivelando che l'invarianza rispetto alla moltiplicazione della dimensione della libreria non garantisce la robustezza rispetto alla perdita stocastica di molecole.

Liu Chen2026-07-24
📄 altro

Does Candidate-Space Restriction Destabilize Cross-Tissue Gene Regulatory Network Benchmark Rankings? An Empirical Analysis of Analytic Flexibility in Computational Biology

Questa analisi empirica dimostra che la restrizione degli spazi dei candidati nei benchmark delle reti di regolazione genica destabilizza significativamente le classifiche dei metodi tra i diversi tessuti, indicando che le scelte nella definizione dei candidati possono alterare le conclusioni comparative e dovrebbero essere riportate insieme ai risultati piuttosto che essere trattate come neutrali.

Liu Chen2026-07-24
📄 altro

Bacteria getting wired: The porin-cytochrome complex Om(abc)B kickstarts extracellular electron transfer and nanowire formation

Questo studio rivela che *Geobacter sulfurreducens* utilizza una strategia di trasferimento elettronico extracellulare sequenziale in due fasi in cui il complesso porina-citocromo Om(abc)B consente prima la sintesi energivora dei nanofili OmcS, permettendo alle cellule di passare da una modalità wireless a una modalità cablata che espande drasticamente il loro accesso al Fe(III) per la replicazione.

Nikhil Malvankar, Joseph Erwin, Kejue Jia, Cong Shen, Vanessa Saldivar, Aldo Salazar Morales, Vasilije Pentalic, Fadel S (…)2026-07-24
📄 altro

Integrative genomic and network analyses map horizontal gene transfer dynamics in Pantoea agglomerans

Attraverso analisi genomiche e di rete integrative di 165 genomi, questo studio rivela che *Pantoea agglomerans* possiede un pangenoma aperto guidato dal trasferimento genico orizzontale, mediato principalmente da plasmidi e influenzato dal raggruppamento delle nicchie ecologiche con *Pantoea vagans* come donatore chiave.

Muhammad Sulman, Antonet M. Svircev, James T. Tambong, Walid Ellouze2026-07-24
📄 altro

Bacteroides acidifaciens derived pentadecanoic acid alleviates MAFLD by sensitizing senescent macrophages to ferroptosis via JNK-JUN-NCOA4 pathway

Questo studio dimostra che l'acido pentadecanoico, un metabolita derivato da *Bacteroides acidifaciens*, allevia la MAFLD sensibilizzando i macrofagi senescenti alla ferroptosi attraverso l'attivazione della via di segnalazione JNK-JUN-NCOA4, promuovendone così la clearance e riducendo la steatosi epatica.

Rui Kong, Huiyu Wang, Nan Wang, Chunli Zhou, Yuqing Zhou2026-07-24
📄 altro

Fast-Paced Breathwork as a Workplace Microbreak Preserves Attentional Orienting and Neural Task Engagement

Questo studio dimostra che una micro pausa di 15 minuti di respirazione rapida aiuta i lavoratori della conoscenza impiegati a mantenere l'orientamento dell'attenzione e l'impegno neurale nel compito, a differenza di un podcast di controllo, prevenendo l'aumento post-pausa della cattura dell'attenzione e della potenza alfa indicativi di disimpegno.

Nele Dael, Austin Lokey, H. Steven Scholte, Alyson Meister2026-07-24
📄 altro

Integrative genomic and transcriptomic analyses identify functionally relevant causal genes for exercise in a large animal model

Questo studio integra dati genomici e trascrittomici di cavalli Thoroughbred per identificare geni e varianti causali specifici alla base dei tratti di performance atletica, distinguendo tra fattori genetici ereditari e risposte molecolari acquisite all'esercizio e all'allenamento.

Mian Feng, Thomas J. Hall, John F. O’Grady, Kseniia Maksimova, Michael Salter-Townshend, John A. Browne, David E. MacHug (…)2026-07-24
📄 altro

Agar oligosaccharides mitigate lipopolysaccharide-induced apoptosis and inflammatory damage in rumen epithelial cells via the tlr4-myd88-nf-κb signaling pathway

Questo studio dimostra che gli oligosaccaridi dell'agar (AOS) mitigano l'apoptosi e il danno infiammatorio indotti dal lipopolisaccaride nelle cellule epiteliali del rumine ovino inibendo la via di segnalazione TLR4-MyD88-NF-κB, suggerendo gli AOS come un potenziale additivo alimentare verde per alleviare le malattie metaboliche dei ruminanti.

Aihong Lao, Xiaolin He, Jian Ma, Chunmei Du, Fuquan Yin, Yanli Lu2026-07-24
📄 altro

Myeloid Immune Remodeling Associated With Citrullination-Related Candidate Markers in Sepsis From a Single-Cell Perspective

Questo studio utilizza analisi trascrizomiche single-cell e bulk per dimostrare che i biomarcatori candidati correlati alla citrullinazione (LTF, MMP9, MMP8, IL10, LCN2 e S100A12) sono localizzati principalmente nelle cellule mieloidi e fungono da indicatori dell'attivazione dei neutrofili e del rimodellamento regolatorio di monociti/macrofagi nella sepsi.

Jingjie Wang, Xiang Li, Jingyan Wang, Xiangyou Yu, Hanyu Zhao, Di Nie, Chunbo Yang, Zhihua Li, Yi Wang2026-07-24
📄 altro

Antimicrobial activity and Time Kill analysis of Nigerian Ethnobotanical plants on oral microbes implicated in dental caries

Questo studio valida scientificamente l'efficacia antimicrobica di piante etnobotaniche nigeriane contro i principali microbi orali, dimostrando che gli estratti metanolici, in particolare quelli di neem e bitter kola, inibiscono efficacemente la crescita microbica e offrono un potenziale per la prevenzione della carie dentale.

Onyinyechi Cecilia Amobi-Alor, Godwill Azeh Engwa, Felix Ifeanyi Nwafor, Chukwuemeka Ikechukwu Eze, Nicholas Benjamin Aj (…)2026-07-24