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🧬 biologia

Screening Protein Conformational Responses by Molecular Friction Sensing

Questo articolo introduce il Molecular Friction Sensing (MFS), una tecnica compatibile con lo screening che utilizza nanolever di DNA origami per rilevare cambiamenti conformazionali proteici indotti da ligandi con sensibilità sub-Angström, aggiungendo così una dimensione strutturale cruciale alla scoperta di farmaci che rivela come l'affinità di legame e la cinetica da sole non possano predire gli esiti strutturali.

Ulrich Rant, Pablo Porragas Paseiro, Lukas Aufinger, Alfred Kick, Tereza Jahodova, Veronica Hamer, Wouter Engelen2026-10-19
🧬 biologia

In which cases does it make sense to classify a trace into one population, and what are the alternatives?

Questo studio valuta i metodi di classificazione per l'analisi dell'ascendenza biogeografica utilizzando 104 AIM, dimostrando che un classificatore Naive Bayes recente (RNB) distingue efficacemente tra individui in-reference, ammessi e fuori-reference, affrontando così i limiti dell'assegnazione degli ignoti a una singola popolazione di riferimento.

Julika Schmitz, Jana Naue, Lukas Hoffmann, Zoe Lange, Suchanek Ferdinand, Sabine Lutz-Bonengel, Holger Dette, Peter Pfaf (…)2026-10-19
🧬 biologia

Tricarboxylic Acid Cycle Genes sucA and sucC Confer Salt-Alkaline Tolerance in Enterobacter kobei by Enhancing Energy Metabolism and Carbon Source Utilization

Questo studio dimostra che i geni del ciclo dell'acido tricarbossilico *sucA* e *sucC* in *Enterobacter kobei* P3 conferiscono tolleranza al sale e all'alcalinità potenziando il metabolismo energetico e l'utilizzo delle fonti di carbonio, offrendo una promettente strategia genetica per l'ingegnerizzazione di microbi resilienti agli stress per la biorimediazione.

Yanhong Wang, Jiahui Chen, Beibei Xu, Amro Abdelazez, Heba Abdel-motaal, YiTong Feng, Yaru Zhu, Wenzhao Wang, Jingxuan P (…)2026-10-19
🧬 biologia

Joint spatial and gene fine-mapping reveals convergent neuroanatomical niches but limited overlap among associated genes in psychiatric disorders

Lo studio introduce SDESE, un nuovo framework che integra la trascrittomica spaziale con il fine-mapping genetico per rivelare che, sebbene cinque disturbi psichiatrici comuni convergano su nicchie neuroanatomiche condivise nella corteccia prefrontale, essi sono guidati da set di geni ampiamente distinti ma funzionalmente convergenti.

Miaoxin Li, Ying Luo, Chao Xue, Meng Liu, Liubin Zhang, Wenjie Peng, Lihang Ye, Wu Wei, Lin Jiang2026-10-19
🧬 biologia

Effects of Squat Jumps versus Drop Jumps on Neuromuscular Fatigue in Women: Integrating Submaximal Testing and Complexity Analyses with Conventional Approaches

Questo studio dimostra che, sebbene sia i salti con squat che i drop jump inducano fatica neuromuscolare nelle donne, il ciclo stiramento-accorciamento dei drop jump causa deficit periferici significativamente maggiori e riduce l'adattabilità della forza, un fenomeno che viene rilevato con maggiore sensibilità attraverso contrazioni submassimali e analisi della complessità rispetto alle sole valutazioni massimali convenzionali.

Jonathan Galvão Tenório Cavalcante, Lucas Pereira Peixoto, Martim Bottaro, Carole Cometti, João Luiz Quagliotti Durigan (…)2026-10-19
🧬 biologia

A gene-level batch effect quantification method based on condition-aware correction and adaptive thresholding

Questo articolo introduce i "Group Technical Effects" sensibili alle condizioni, un nuovo framework che migliora la quantificazione degli effetti batch a livello genico nei dati single-cell disaccoppiando gli effetti delle condizioni biologiche dal rumore tecnico attraverso una strategia di penalizzazione basata sul punteggio della condizione e un metodo di sogliatura adattiva.

Wen Li, Xiao Chang2026-10-19
🧬 biologia

Machine learning and single-cell transcriptomics identify key lncRNAs associated with malignant transformation and immune infiltration in colorectal cancer

Questo studio utilizza il machine learning e la trascrittomica a singola cellula per identificare una firma di sette lncRNA che distingue efficacemente i tessuti normali, l'adenoma e il tumore nel cancro del colon-retto e correla con l'infiltrazione immunitaria, sebbene tali marcatori fungano da biomarcatori di stadiazione piuttosto che da indicatori prognostici indipendenti per la sopravvivenza.

Han Gong, LiBo Liu, Chao Mi, BoLun Yan, FuYang Gao, HuaYu Zhang2026-10-19
🧬 biologia

Developmental progression toward embryogenic competence in Theobroma cacao L.: an integrated cytohistological and molecular analysis

Questo studio integra analisi citohistologiche e molecolari per identificare che l'accumulo di fenoli e l'espressione precoce di geni specifici (BBM, ABI3, AGL15 e IAA20) fungono da marcatori affidabili per la competenza embrionica in *Theobroma cacao*, offrendo criteri per migliorare l'embriogenesi somatica nei genotipi recalcitranti.

Liliana Victoria Monsalve Zapata, Tatiana Osorio-Montoya, Liliana Alexandra Pila Quinga, Aura Ines Urrea Trujillo, Laura (…)2026-10-19
🧬 biologia

RNase E-dependent guide generation and activation of the SPARMA defense system

Questo studio rivela che il sistema di difesa procariotico SPARMA si affida alla RNasi E dell'ospite per la biogenesi dell'RNA guida e utilizza un meccanismo dipendente dalla concentrazione in cui il legame con il bersaglio innesca la dimerizzazione e la formazione di filamenti per attivare i domini effettori di tipo Mrr per la degradazione collaterale del DNA e l'infezione abortiva.

Daan Swarts, Théophile Niault, Balwina Koopal, Donata Dakineviciene, Jinte Jespers, Dai-ke Zhang, Simon Lindhoud, Ane Sa (…)2026-10-19