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🧬 biology

Exploring ubiquitination-related biomarkers in osteoarthritis based on single-cell and transcriptomic data

Questo studio integra dati trascrittomici single-cell e bulk per identificare cinque biomarcatori legati all'ubiquitinazione (MYC, TLR7, CX3CR1, PER1 e GADD45B) coinvolti nella patogenesi dell'osteoartrite, rivelando il loro arricchimento nella via del TNF-alfa/NF-kappaB, l'associazione con specifiche popolazioni di cellule immunitarie e l'espressione elevata nei fibroblasti sinoviali, offrendo così nuovi bersagli terapeutici per la malattia.

Tian Lan, Huan Dai, DeGuang Li, ChongYu Zhao, XiaoYu Mu, Li Li, Chao Wang2026-07-30
🧬 biology

Transformed Callus of Panax vietnamensis: Promising In Vitro Platform for Majonoside R2 Production alongside Hairy Roots

Questo studio dimostra che il callo trasformato di *Panax vietnamensis* indotto da *Agrobacterium rhizogenes* funge da alternativa stabile, priva di ormoni e altamente produttiva alle radici pilifere per la produzione in vitro sostenibile della rara saponina majonoside R2, in particolare quando potenziata dall'elicitazione con MeJA.

HUYEN TRAN, THI QUY TRAN, HongIk Yoon, Hei Chan Lee2026-07-30
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Polarity-Registered Nuclear Mapping Reveals Discrete Topological Classes of Chromosome Organization

Questo studio introduce un sistema di coordinate nucleari registrato sulla polarità che normalizza la geometria nucleare per rivelare classi topologiche discrete e riproducibili dell'organizzazione cromosomica nelle cellule staminali mesenchimali umane, dimostrando che i vincoli meccanici e di polarità guidano comportamenti spaziali asimmetrici e specifici per l'omologo.

Paolo Netti, Luca Messina, Carlo Natale2026-07-30
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BMP9 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression By Accelerating Cell Cycle through CKS1B Lactylation

Questo studio rivela che l'elevata espressione di BMP9 guida la progressione del carcinoma epatocellulare promuovendo la lattilazione di CKS1B, la quale potenzia l'interazione di CKS1B con CDK1–3 e facilita la degradazione di p27 per accelerare la progressione del ciclo cellulare.

Hong Tang, Han Chen, Jianhao li, Ying-Yi Li, Mingming Zhang, Jiayi Wang, Xia Zhu, Weixiu Li, Junpeng Zhou, Xiangnan Teng (…)2026-07-30
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FuncDECODE Resolves Cell-Type-Specific Functional Heterogeneity across Biological States and Spatial Contexts

FuncDECODE è un framework computazionale che sfrutta riferimenti a singola cellula per deconvolvere dati di bulk e di trascrittomica spaziale misti, consentendo così l'identificazione del rimodellamento dei programmi funzionali specifici per tipo cellulare attraverso diversi stati biologici, contesti patologici e architetture tissutali spaziali.

Yadong Wang, Renjie Liu, Tianyi Zhao2026-07-30
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Malaria parasites coordinate host cell remodeling through the AP2-HCR DNA-binding protein

Questo studio identifica PfAP2-HCR come un fattore di trascrizione ApiAP2 essenziale in *Plasmodium falciparum* che orchestra il rimodellamento della cellula ospite regolando direttamente l'espressione di proteine esportate chiave, garantendo così la sopravvivenza, lo sviluppo e la trasmissione del parassita attraverso sia le fasi ematiche asessuate che quelle sessuate.

Arnab Pain, Amit Subudhi, Dhiviya Vedagiri, Sara Mfarrej, Reem Abu-Shamma, Rohit Satyam, Rahul Salunke, Di Liu, Maya Aya (…)2026-07-30
🧬 biology

Ultra-efficient High Resolution 3D Reconstruction of Spatial Omics Data with Neural Transcriptomic Field

Il documento introduce Neural Transcriptomic Field (NTF), un framework di deep learning che sfrutta le rappresentazioni neurali implicite per ottenere una ricostruzione 3D ultra-rapida, scalabile e ad alta fedeltà dei dati di omica spaziale da fette 2D sparse, consentendo la generazione rapida di atlanti tissutali completi con capacità intrinseche di denoising e super-risoluzione.

Zhangsheng Yu, Yuqiao Gong, Xin Yuan, Ruitian Gao, Jinmiao Chen2026-07-30
🧬 biology

Sex-specific differences in FGF signaling balance adipogenesis and osteogenesis in the adult and aging skeletal system

Questo studio rivela che le differenze di sesso nella segnalazione FGF, caratterizzate da livelli più elevati di FGF1 nelle femmine e da una maggiore espressione del recettore esca FGFRL1 nei maschi, regolano in modo differenziale l'equilibrio tra adipogenesi e osteogenesi, contribuendo così al dimorfismo sessuale scheletrico e offrendo un potenziale bersaglio terapeutico per la perdita ossea correlata all'età.

Ralf Adams, Backialakshmi Dharmalingam, Kishor Sivaraj, Hyun-Woo Jeong, Astrid Nottebaum, Alex Zadro, Van Vuong Dinh, Su (…)2026-07-30
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Diagnosing Simulation and Hardware Barriers to Cross-Size Transfer in Equivariant Quantum Reinforcement Learning

Questo articolo dimostra che, sebbene le politiche di apprendimento per rinforzo quantistico equivarianti addestrate su piccole istanze di ottimizzazione combinatoria possano superare l'addestramento con dimensioni corrispondenti nel trasferimento zero-shot verso istanze più grandi in regimi idealizzati, le loro prestazioni sull'hardware reale sono gravemente degradate dalla troncatura della simulazione, dai limiti di prestazione condizionali e dalle limitazioni del rumore di campionamento, stabilendo infine uno standard diagnostico rigoroso per le future rivendicazioni di vantaggio quantistico.

Monit Sharma, Hoong Chuin Lau2026-07-30