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🧬 biologia

Alpha- and Gamma-Synuclein Proteins Define Complementary Metabolic and Invasive Programs in Melanoma Development, Progression, and Prognosis

Questo studio rivela che l'alfa- e la gamma-sinucleina definiscono stati maligni complementari e anti-correlati nel melanoma, in cui l'alfa-sinucleina guida un programma metabolico legato alla funzione mitocondriale e la gamma-sinucleina promuove un programma invasivo attraverso la segnalazione integrina-FAK-MAPK, con l'alta espressione di gamma-sinucleina che funge da biomarcatore prognostico per esiti infausti.

Mauricio Menacho Marquez, Florencia Malizia, Lucía Zanotti, Mirco Mian, Pablo Martínez Ponce, Macarena Mamberto, Aylén A (…)2026-10-29
🧬 biologia

Different ways to disappear: transparency extends camouflage beyond background matching in heterogeneous environments

Questo studio dimostra che nella camaleonte gamberetto (*Hippolyte varians*), gli individui di colore solido agiscono come specialisti del camuffamento con un'alta sopravvivenza su sfondi corrispondenti, mentre gli individui trasparenti funzionano come generalisti con una sopravvivenza costante ma limitata dai compromessi in ambienti eterogenei, suggerendo che la variabilità ambientale supporti la coesistenza di queste strategie alternative.

Rafael Duarte, George Hancock, Gustavo Dias, Martin Stevens2026-10-29
🧬 biologia

Bacterial Species Classification from Full-Plate Culture Images Using Deep Learning: A Comparative Study of CNNs and Vision Transformers

Questo studio dimostra che i Vision Transformer (ViT-B/16) perfezionati superano le tradizionali architetture CNN come ResNet50 e DenseNet121 nel classificare accuratamente 19 specie batteriche direttamente da immagini di colture su piastra intera, raggiungendo un'accuratezza media del 99,05% sotto un protocollo sperimentale unificato.

Abdulsalam Abdulsattar Abdulazez, Hussein Salim Abed, Aythem Khairi Kareem, Mustafa Nadhim OWAID, Ahmed Adil Nafea2026-10-29
🧬 biologia

Resource availability reshapes clonal recovery and trait coordination across fragment configurations of Salvinia natans

Questo studio dimostra che nella felce galleggiante *Salvinia natans*, il vantaggio di crescita della frammentazione moderata rispetto alla frammentazione leggera o severa è contingente all'alta disponibilità di risorse, mentre diverse configurazioni di frammenti guidano modelli distinti di coordinazione dei tratti e organizzazione della rete in risposta a variabili condizioni di luce e nutrienti.

Hong Su, Yu Bai, Wenhui Zheng, Xihua Liu, Puming Li, Meng Zhang2026-10-29
🧬 biologia

Interfacial origin of label-free potentiodynamic fingerprints during bacterial growth in blood culture

Questo studio dimostra che le impronte digitali potenziodinamiche prive di etichetta generate durante la crescita batterica nelle emocolture derivano principalmente da interazioni dinamiche tra batteri e interfaccia elettrodo, come l'adesione e l'attività metabolica locale, piuttosto che da cambiamenti metabolici globali o dalla sola acidificazione.

Thibaut Babin, Stephan Pissot, Laura Bernard, Pierre R. Marcoux, Maxime Gougis, Pascal Mailley2026-10-29
🧬 biologia

Uncertainty-aware benchmarking reveals ambiguous transcripts in mRNA–lncRNA classification

Questo studio introduce un framework di benchmarking consapevole dell'incertezza che rivela una significativa discordanza inter-strumento nella classificazione di lncRNA e mRNA, dimostrando che l'incorporazione di caratteristiche derivate dalle ripetizioni e dell'analisi della struttura secondaria aiuta a identificare i trascritti ambigui e guida lo sviluppo di classificatori più robusti.

Daniel Garcia-Ruano, Mikaël Georges, Saswat K. Mohanty, Rahma Baaziz, Kateryna D. Makova, Macha Nikolski, Domitille Chal (…)2026-10-29
🧬 biologia

Antitumor Effects of Quercetin and Luteolin in MeWo Melanoma Cells: Potential Association with GPER Signaling

La quercetina e il luteolina esercitano effetti antitumorali sulle cellule di melanoma MeWo inducendo l'apoptosi, arrestando il ciclo cellulare e inibendo la migrazione attraverso la modulazione delle vie di segnalazione di GPER, come dimostrato dall'alterazione dell'espressione di P-ERK, c-Myc e P-Akt che viene invertita dall'antagonista di GPER G15.

shtaywy Abdalla, shaimaa Hussein, Noor Tarawneh, Nidaa Ababneh, Abdullah Awidi2026-10-29
🧬 biologia

Explainable Protein Language Model Embeddings for Rapid Antibiotic Resistance Gene Classification

Questo articolo introduce ResiScan, un framework di apprendimento automatico spiegabile che sfrutta gli embedding proteici ESM2 e la regressione logistica per classificare in modo rapido e accurato i geni della resistenza agli antibiotici in cinque classi principali, raggiungendo un'accuratezza del 99,25% e fornendo al contempo approfondimenti interpretabili attraverso l'analisi SHAP e un'interfaccia web accessibile.

M. Deepthi, S. Muthukumar, D. Vijayakumar2026-10-29
🧬 biologia

Genome-wide association study in Arabidopsis reveals IAN genes regulate pollen heatwave tolerance

Questo studio identifica un cluster di geni legati al legame con i nucleotidi associati all'immunità (IAN) come regolatori negativi della tolleranza delle piante di *Arabidopsis* alle ondate di calore del polline attraverso un nuovo saggio di fenotipizzazione basato sull'apprendimento automatico e uno studio di associazione genome-wide, suggerendoli come potenziali target per la selezione di colture resilienti al clima.

Max Frencken, Daan M. van den Brink, Jeroen van den Hurk, Lotte van der Krabben, Elise A.R. Serin, Ivo Rieu2026-10-29
🧬 biologia

A five-gene risk model based on carnitine-related genes for predicting prognosis in ovarian cancer

Questo studio ha sviluppato un modello prognostico di rischio a cinque geni basato su geni correlati alla carnitina (ALPL, RAB38, SLC4A8, ZMAT4 e IGLON5) per stratificare le pazienti con tumore dell'ovaio in gruppi ad alto e basso rischio, rivelando associazioni significative con gli esiti di sopravvivenza, l'infiltrazione immunitaria e la sensibilità ai farmaci.

Lan Liu, Xinfang Liu, Ping Luo, Xinyan Fu, Yanhui Ding, Fanfan Li, Yue Wu, Yongcang Zhang2026-10-29