Profile-HMM validation reveals annotation-derived inflation of apparent two-domain NucS occurrence and taxonomically concentrated NucS/MutS-MutL coexistence across 23,435 prokaryotic reference genomes
Questo studio dimostra che affidarsi esclusivamente alle annotazioni genomiche gonfia significativamente le stime dell'occorrenza di NucS a due domini e della coesistenza di NucS/MutS-MutL tra i procarioti, mentre la validazione con modelli di Markov nascosti di profilo rivela che tale coesistenza è rara e tassonomicamente concentrata principalmente in Halobacteria e Deinococcota.