🧬 Category

q-bio

1625 articoli

🧬 biology

paRDal: Bioinformatics Framework for a Parallel RNA and DNA NGS Analysis in Hereditary Cancer Diagnostics

Il documento presenta paRDal, un framework bioinformatico containerizzato che integra dati NGS appaiati di DNA germinale e RNA per migliorare la diagnostica del cancro ereditario attraverso il rilevamento di anomalie dello splicing e dell'espressione, migliorando così l'interpretazione delle varianti e la resa diagnostica attraverso un flusso di lavoro intuitivo e basato sull'evidenza.

Kateřina Matějková, Petr Nehasil, Petra Kleiblová, Taťána Ptáčková, Marta Černá, Pavel Just, Ondřej Vít, Petra Zemánková (…)2026-07-09
🧬 biology

Biodiversity as the source of heterospecific social information: the effect on territory selection in the marsh warbler

Sebbene un esperimento su larga scala avesse inizialmente suggerito che le informazioni sociali eterospecifiche influenzino la selezione del territorio da parte del capinere maggiore, un'analisi rigorosa che tiene conto delle distribuzioni spaziali preesistenti ha rivelato che la loro abbondanza è guidata principalmente dalla struttura dell'habitat e dalla ricchezza di specie locale piuttosto che dagli stimoli acustici manipolati.

Sylwia Pustkowiak, Zbigniew Kwieciński, Piotr Skórka2026-07-09
🧬 biology

Fungal–Fungal Interactions Drive Metabolic Reprogramming in Root-Associated Endophytes of Salvia abrotanoides

Questo studio dimostra che le interazioni fungo-fungo tra gli endofiti associati alle radici di *Salvia abrotanoides* guidano la riprogrammazione metabolica, portando alla regolazione differenziale dei composti di segnalazione e all'attivazione di vie biosintetiche silenti che producono nuovi metaboliti secondari.

Yeganeh Teimoori-Boghsani, Ali Ganjeali, Gabriele Berg, Tomislav Cernava, Javad Asili, Fatemeh Masoudi-Khorasani, Nasrin (…)2026-07-09
🧬 biology

Diversity of microbiome associated with the didemnid ascidian Lissoclinum patella in North Sulawesi, Indonesia

Questo studio utilizza il sequenziamento dell'RNA ribosomiale 16S a lunghezza intera per rivelare che il microbioma batterico dell'ascidia *Lissoclinum patella* nel Sulawesi settentrionale presenta strutture di comunità distinte per sito e profondità, con la popolazione dell'isola di Talise, più superficiale, che ospita i consorzi batterici più ricchi e diversificati dominati da *Hoeflea*, rispetto alle comunità meno diversificate nelle acque più profonde e urbanizzate.

Inneke Fenny Melke Rumengan, Robert A. Bara, Deiske Adeline Sumilat, Trezya Nilam Sari Pangemanan, Irene Shelyn Poluan (…)2026-07-09
🧬 biology

Response Surface Optimization of PEG-Mediated Precipitation for Efficient Recovery of ClearColi™ Outer Membrane Vesicles

Questo studio dimostra che la precipitazione con polietilenglicole (PEG) ottimizzata tramite la Metodologia della Superficie di Risposta offre un'alternativa scalabile ed economica all'ultracentrifugazione per il recupero ad alta resa e strutturalmente intatte di Vescicole della Membrana Esterna da ClearColi™, ottenendo un recupero proteico superiore del 63,4% preservando al contempo l'integrità delle vescicole.

shiva bayat, Seyed Latif Mousavi Gargari, Shahram Nazarian2026-07-09
🧬 biology

Local structure-activity landscape roughness detects the activity-cliff failure mode that standard QSAR reliability methods miss

Questo articolo introduce una misura per composto della rugosità del panorama locale struttura-attività che rileva con successo le modalità di fallimento degli activity-cliff trascurate dai metodi standard di affidabilità QSAR, consentendo la costruzione di predittori conformi calibrati che mantengono una copertura valida anche nelle regioni in cui i modelli tradizionali falliscono.

Krishna Harish2026-07-09
🧬 biology

OTrack: A High-Throughput Organoid Detection and Tracking Framework Using Neighborhood-Guided Descriptors

OTrack è un framework che non richiede addestramento e che raggiunge un tracciamento robusto e ad alto rendimento di organoidi attraverso lunghi intervalli di imaging, sfruttando distribuzioni spaziali di vicinato stabili anziché fare affidamento su caratteristiche morfologiche che cambiano nel tempo.

Binlin Chen, Jian Wang, Jiaqi He, Yuan Li, Jianfa Zhou, Linjie Guo, Haofeng Li, Liang Yang, Bohui Chen2026-07-09
🧬 biology

Prevalence, Virulence Gene Profiles, and Multidrug Resistance of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli in Farmed Carp (Labeo rohita) from Punjab, Pakistan: Implications for Food Safety and One Health

Questo studio rivela una prevalenza significativa di *E. coli* produttore di tossina Shiga multiresistente ai farmaci e portatore di geni di virulenza in carpe d'allevamento e nell'acqua del Punjab, in Pakistan, evidenziando urgenti rischi per la sicurezza alimentare e la necessità di un migliore controllo dell'uso degli antimicrobici nell'industria dell'acquacoltura della regione.

Talib Hussain, Fayyaz Rasool, Sarjito Sarjito, Shahid Mahmood, Aninditia Sabdaningsih, Agus Trianto, Shahid Sherzada2026-07-09