Tunable Phase and Fields iSCAT for High-Sensitivity detection of Single Proteins
Questo articolo presenta una tecnica di microscopia a scattering interferometrico (iSCAT) sintonizzabile che consente il controllo indipendente e continuo delle ampiezze e delle fasi di campo per aumentare significativamente il contrasto, consentendo la rilevazione senza marcatori di singole proteine con masse molecolari anche di soli 5,7 kDa.
Articolo originale sotto licenza CC BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). Questa è una spiegazione generata dall'IA dell'articolo qui sotto. Non è stata scritta né approvata dagli autori. Per precisione tecnica, consulta l'articolo originale. Leggi il disclaimer completo
Il mondo invisibile e la ricerca di una singola proteina
Immaginate di cercare di sentire un singolo sussurro nel mezzo di uno stadio fragoroso. Questa è la sfida che gli scienziati affrontano quando cercano di vedere i più piccoli mattoni della vita, come le singole proteine, usando la luce. Per decenni, il modo migliore per vedere queste cose minuscole è stato dipingerle con coloranti fluorescenti brillanti, come attaccare un adesivo al neon su un granello di polvere. Ma questi adesivi hanno dei problemi: possono svanire (un processo chiamato fotodecolorazione o photobleaching), possono cambiare il comportamento della proteina e brillano solo per un breve periodo. Così, gli scienziati sono stati alla ricerca di un modo per vedere queste proteine senza usare alcun adesivo, usando solo il modo in cui interagiscono naturalmente con la luce.
Lo strumento principale per questo lavoro investigativo "senza etichette" è una tecnica chiamata iSCAT (Interferometric Scattering Microscopy). Pensate alla iSCAT come a una camera dell'eco ad alta tecnologia. Si proietta un laser su una superficie e la maggior parte della luce rimbalza direttamente indietro (l'eco). Se una minuscola particella, come una proteina, si trova lì, essa diffonde una piccola parte di quella luce. La magia avviene quando l' "eco" e il "sussurro diffuso" si incontrano e si scontrano tra loro. Se si allineano perfettamente, creano un segnale forte; se sono fuori fase, si annullano a vicenda. Il problema è che l' "eco" è solitamente molto più forte del "sussurro", rendendo difficile sentire il sussurro, e il controllo del tempo (la fase) dell'impatto è difficile da gestire. Questo articolo affronta esattamente questo problema: come abbassare il volume dell'eco e regolare il tempo in modo da poter finalmente sentire il sussurro di una singola, minuscola proteina.
Sintonizzare il microscopio per sentire il sussurro
I ricercatori, guidati da Ori Cheshnovsky e dal suo team dell'Università di Tel Aviv, hanno costruito una nuova versione di questo microscopio che chiamano TPF-iSCAT (Tunable Phase and Fields iSCAT). Potete pensare alla loro invenzione come a un maestro ingegnere del suono per la luce. In una configurazione standard, l' "eco" (la luce riflessa dal vetrino di vetro) è fisso e travolgente. Il team si è reso conto che potevano separare fisicamente l' "eco" dal "sussurro" (la luce diffusa dalla proteina) perché viaggiano in percorsi leggermente diversi.
Hanno utilizzato un pezzo di vetro speciale a forma di anello chiamato lamina a mezz'onda anulare per torcere la polarizzazione della luce diffusa lasciando invece invariata la luce riflessa. Successivamente, facendo scorrere un polarizzatore (come un paio di occhiali da sole per la luce) e un dispositivo a cristalli liquidi (che agisce come un interruttore per la regolazione della luminosità per il tempo delle onde luminose), hanno potuto controllare indipendentemente due cose: quanto sia forte l'eco di fondo e esattamente quando le due onde luminose si incontrano.
Immaginate di cercare di bilanciare un'altalena. Nel vecchio metodo, il lato pesante (la riflessione di fondo) era bloccato in posizione, rendendo impossibile sollevare il lato leggero (il segnale della proteina). Con la TPF-iSCAT, gli scienziati possono far scendere il lato pesante finché non corrisponde quasi al lato leggero, e poi regolare finemente il tempo in modo che si scontrino nel modo più drammatico possibile. Ciò crea un contrasto enorme, facendo risaltare chiaramente la minuscola particella rispetto allo sfondo.
I risultati: catturare le proteine più piccole
Utilizzando questo sistema sintonizzabile, il team ha dimostrato di poter rilevare singole proteine con masse così basse come 5,7 kDa (kilodalton). Per dare un termine di paragone, sono riusciti a individuare l'Insulina Bovina, una proteina molto piccola, insieme a proteine più grandi come la Proteina Fluorescente Verde (26 kDa) e l'Albumina di Siero Bovino (66 kDa).
L'articolo mostra che il segnale ottenuto è direttamente collegato alla dimensione della proteina. Quando hanno tracciato la "forza" del segnale rispetto alla massa della proteina, si è formata una linea retta, dimostrando che il metodo è affidabile e quantitativo. Hanno anche scoperto che, sebbene la forza del segnale cambiasse con la dimensione, la "fase" (il tempo dell'onda) rimaneva sorprendentemente stabile per ogni tipo di materiale, il che aiuta a confermare ciò che stanno osservando.
I ricercatori sono stati attenti a notare che, sebbene abbiano ottenuto questo risultato con l'hardware fisico, esiste ancora un limite di velocità. Il dispositivo a cristalli liquidi che hanno usato per sintonizzare il tempo è un po' lento nel cambiare, il che limita la velocità con cui possono scattare le foto. Suggeriscono che in futuro, sostituendolo con un modulatore elettronico più veloce, si potrebbe spingere il limite di rilevamento ancora più in basso, potenzialmente catturando proteine più piccole di 5,7 kDa.
Perché questo è importante
Questo lavoro è significativo perché spinge i limiti fisici di ciò che possiamo vedere senza utilizzare alcuna etichetta. I metodi precedenti, che si affidavano a complessi algoritmi informatici e intelligenza artificiale, potevano rilevare proteine fino a circa 9 kDa solo dopo un pesante processamento. Il sistema TPF-iSCAT, tuttavia, crea un segnale chiaro e di alta qualità proprio al momento della cattura, permettendo loro di vedere direttamente la molecola di insulina da 5,7 kDa.
Il team conclude che questo approccio offre un modo robusto e ad alta fedeltà per studiare il "proteoma a bassa massa" — il vasto mondo di minuscole proteine che prima erano troppo difficili da vedere. Fornendo agli scienziati uno strumento in grado di sintonizzare i campi luminosi alla perfezione, questo articolo apre la porta all'osservazione dei processi biologici in tempo reale, senza l'interferenza di etichette fluorescenti e con una sensibilità che prima era considerata impossibile.
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