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Tartrazine clears live cells while preserving viability at high refractive indices and osmolality
本研究は、タララジンを用いることで、細胞の生存性を損なわずに最大 1.41 の屈折率まで高密度接着細胞を透明化できることを示し、生体光学クリアリングの新たな可能性を提示した。
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biophysics
419 件の論文
生命の謎を物理の法則で解き明かすのが生物物理学です。細胞の動きからタンパク質の形まで、目に見えない微观の世界を数式や実験で可視化し、生きている現象そのものを理解しようとする分野です。
Gist.Science は、この分野の最新研究成果を bioRxiv から収集し、すべてを網羅的に処理しています。専門用語の壁を越えるため、各論文の平易な要約と、技術的な詳細なまとめの両方を提供し、誰でも最新の知見に触れられるようにしています。
以下に、bioRxiv から新たに公開された生物物理学の論文一覧を掲載します。最新の発見をぜひご確認ください。
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Individuality and information content of infrared molecular profiles: insights from a large longitudinal health-profiling study
本研究は、大規模な縦断的コホートを用いた解析により、血液の赤外分光プロファイルが臨床検査データよりも高い個人識別精度（情報量）を示し、両者を組み合わせることで個別化医療における補完的な価値がさらに高まることを明らかにしました。
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β-motifs and molecular flux promote amyloid nucleation at condensate interfaces
この論文は、新しいシミュレーション手法「FD-MD」を用いて、凝縮体の界面が配列コード化された構造モチーフと非平衡な分子流の協調作用により、アミロイド核形成を促進し、その成長形態や凝縮体の老化経路を制御することを示しています。
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A Heart Disease-Associated TSPO Variant Alters Transmembrane Helix Dynamics
NMR 分光法を用いた研究により、心疾患に関連する TSPO 変異体（A14V）が、細胞質領域と膜貫通コアの間の柔軟な境界を構成する N 末端領域の動的な不均一性を減少させ、VDAC 相互作用界面への膜貫通ヘリックスの安定化をもたらすことが明らかになりました。
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Conformation-Dependent Donor Selectivity in the Xanthan Gum Glycosyltransferase GumK Revealed by AI-Based Docking
本研究は、AI 支援ドッキング手法を用いて、キサンタンガム合成酵素 GumK のドナー特異性が、単一の剛体結合様式ではなく、結合ポケットの構造可塑性と基質化学の相互作用によって制御されていることを明らかにした。
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FragLite mapping to identify the BRD4 recruitment site of P-TEFb
本研究では、FragLite 法を用いてサイクリン T2 の結合部位をマッピングし、既知のパートナーを同定するとともに、BRD4 の新たな結合部位を特定し、その界面を解明することで P-TEFb を選択的に標的とする新規プローブや調節剤の開発を支援しました。
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Improved cryo-EM reconstruction of sub-50 kDa complexes using 2D template matching
本論文は、高解像度構造を事前情報として 2 次元テンプレートマッチングを適用する手法を開発し、従来の単粒子クライオ電子顕微鏡法では困難だった 50 kDa 未満の小型タンパク質複合体（約 43 kDa のタンパクキナーゼなど）の構造解像度向上と再構築を実現したことを報告しています。
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Rapid and reliable quantification of cytosolic mRNA escape (RNASCAPE)
本論文は、EGFP 発現データと LNP パラメータのみを用いて深層学習により細胞質への mRNA エスケープ効率を高精度に推定するフレームワーク「RNASCAPE」を開発し、リポナノ粒子製剤の設計と評価を革新する手法を提案しています。
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Integrating computational chemistry and machine learning to predict KRAS mutation-induced resistance
本論文は、分子動力学シミュレーションから得られた構造・エネルギー特徴量と機械学習を統合したフレームワークを開発し、KRAS G12C 変異に対する二次変異（Y96C/S/D など）による薬剤耐性を 90% 以上の精度で予測可能であることを示した。
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Extending the MARTINI 3 Coarse-Grained Forcefield to Polypeptoids
本研究では、天然ペプチドとは異なる骨格構造を持つペプトイドのメソスケールシミュレーションを可能にするため、MARTINI 3 力場と互換性のある初の粗視化モデルを開発し、19 種類の残基を網羅したパラメータを martinize2 ツールに統合することで、ペプトイドの自己集合やナノ構造形成の効率的な解析と次世代機能性材料の設計を支援しました。