Chlorotoxin does not target matrix metalloproteinase-2in glioblastoma
分子シミュレーションは、クロロトキシンおよびその断片がMMP-2の非触媒領域に良好に結合し、膠芽腫細胞の移動を抑制することを示唆しているものの、それらはMMP-2の酵素活性を直接阻害するわけではなく、このことは、クロロトキシンがおそらく膠芽腫における代替的なメカニズムを標的にしていることを示している。
365 件の論文
生命の謎を物理の法則で解き明かすのが生物物理学です。細胞の動きからタンパク質の形まで、目に見えない微观の世界を数式や実験で可視化し、生きている現象そのものを理解しようとする分野です。
Gist.Science は、この分野の最新研究成果を bioRxiv から収集し、すべてを網羅的に処理しています。専門用語の壁を越えるため、各論文の平易な要約と、技術的な詳細なまとめの両方を提供し、誰でも最新の知見に触れられるようにしています。
以下に、bioRxiv から新たに公開された生物物理学の論文一覧を掲載します。最新の発見をぜひご確認ください。
分子シミュレーションは、クロロトキシンおよびその断片がMMP-2の非触媒領域に良好に結合し、膠芽腫細胞の移動を抑制することを示唆しているものの、それらはMMP-2の酵素活性を直接阻害するわけではなく、このことは、クロロトキシンがおそらく膠芽腫における代替的なメカニズムを標的にしていることを示している。
本研究は、嵩高い外来性プローブを必要とすることなく、クライオ電子断層撮影を用いて混雑した細胞環境内における特定のタンパク質を直接的かつ一義的に同定することを可能にするため、定義された剛直な幾何学的構造を持つ、完全遺伝子符号化された低分子量タンパク質タグを用いた「形状を信号とする」戦略を導入するものである。
本研究は、高分解能X線結晶構造解析から導出されたマルチコンフォーマー・アンサンブルモデルが、タンパク質と溶媒の両方の配座エントロピーを共同で考慮することにより、タンパク質-リガンド結合エントロピーを正確に予測できることを示しており、それによって構造に基づく創薬における明示的なエントロピーの考慮を可能にするものである。
「Quantifying lipids in human cells using Raman spectroscopy」と題された本稿は、さらなる精査を要する不正確さが特定されたことにより著者らによって撤回されており、引用しないよう要請されています。
本論文は、ノイズを加えた構造および多重配列アラインメントを用いた学習を通じて、NSR(ネイティブ配列復元)性能を犠牲にしつつ優れた配列生成とエネルギーランドスケープ予測を実現するPottsMPNNを導入することにより、タンパク質設計モデルの主要な指標としてのNSRへの依存に異議を唱えるものである。