Accurate interdomain contacts in mixed folded proteins from NMR-guided coarse-grained simulations
NMR 化学シフトデータから導出された背骨二面角項を粗粒度分子動力学シミュレーションに導入することで、折りたたみドメインと内在性無秩序領域からなるタンパク質の構造精度を向上させ、ドメイン間接触を正確に予測できることを示しました。
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biophysics
613 件の論文
生命の謎を物理の法則で解き明かすのが生物物理学です。細胞の動きからタンパク質の形まで、目に見えない微观の世界を数式や実験で可視化し、生きている現象そのものを理解しようとする分野です。
Gist.Science は、この分野の最新研究成果を bioRxiv から収集し、すべてを網羅的に処理しています。専門用語の壁を越えるため、各論文の平易な要約と、技術的な詳細なまとめの両方を提供し、誰でも最新の知見に触れられるようにしています。
以下に、bioRxiv から新たに公開された生物物理学の論文一覧を掲載します。最新の発見をぜひご確認ください。
Diurnal regulation of flagellar length and swimming speed in the red-tide raphidophyte Chattonella marina
赤潮を形成する有害藻類 Chattonella marina は、昼間は鞭毛の長さと打撃頻度が増加して遊泳速度が速くなる一方、夜間は短縮・低速化し、この日周変動は細胞内輸送（IFT）様機構によって制御されていることが明らかになった。
Chronotype asymmetry arises from stochastic sleep homeostasis under circadian entrainment
本研究は、睡眠ホメオスタシスの確率的変動が概日リズムの不安定な境界付近で作用することで、個体レベルでは概日周期と睡眠相の正の相関を保ちつつも、集団レベルでは概日周期の分布とは対照的に睡眠相の分布が右に歪む現象を生み出すことを示し、睡眠相から内因性の概日周期を単純に推測することの限界を指摘している。
Dynamics of single cell-cell junctions as an indicator of cell state switch
本研究では、ATP 駆動の非平衡系として細胞間接着をモデル化し、E- 型と N- 型のカドヘリンの機械的感度の差異が、がん転移において重要なハイブリッド E/M 状態の存在と多様性を生み出すメカニズムを解明しました。
Magnetic sensitivity of cryptochrome 4a in domesticated quail with migratory origins
本論文は、渡り性の野生種から家畜化されたニワトリの一種であるニワトリ（キジ）のクリプトクロム 4a（CRY4a）が、渡り鳥であるヨーロッパコマドリと同様の磁気特性を示すことを分光学的に実証し、渡り鳥の磁気受容メカニズム解明のための有望な実験モデルであることを明らかにしたものである。
Actomyosin active torques determine body plan handedness in C. elegans
本論文は、C. elegans における F-アクチン可視化に広く用いられる Lifeact::mKate2 の過剰発現が、皮質内のアクチン・ミオシン能動トルクの方向性を逆転させ、結果として個体レベルの左右非対称性（体軸の方向性）を反転させることを示し、能動トルクが左右軸の決定において指示的な役割を果たしていることを明らかにした。
Heterogeneity in cilia patterning enables multiple flow functions within a single cell
本論文は、パラメシウムにおいて、繊毛の密度や拍動周波数などの空間的・時間的なパターンの多様性が、摂食と遊泳という異なる機能を同時に実現する流体流れを生み出すことを、拡張顕微鏡法と高速度撮影を用いて実証したものである。
A rapid, low-cost approach to solid immersion lens fabrication for enhanced resolution in optical microscopy
この論文は、市販の紫外線硬化樹脂を用いた迅速かつ低コストな製造法により、高価なガラス製固体浸透レンズと同等の解像度向上効果を実現し、光学顕微鏡の性能向上と光学教育へのアクセスを可能にしたことを報告しています。
BEEP Learning: Multi-View Image Decomposition for Massively Multiplexed Biological Fluorescence Microscopy
本論文は、蛍光色素の発光スペクトル、励起変動、および光退色ダイナミクスという複数の識別特徴を統合した機械学習フレームワーク「BEEP Learning」を提案し、従来の手法よりもはるかに多くの対象物を高精度に区別・分解する画期的な蛍光イメージング手法を開発したことを報告しています。
Subdomains of Endophilin-NBAR Can Synergistically Drive Membrane Remodeling and Facilitate Controlled Membrane Scission
粗粒度分子動力学シミュレーションを用いた本研究は、エンドフィリンの NBAR 領域が負のガウス曲率を感知・生成し、そのサブドメイン間の相乗効果によって膜の再構築と制御された切断を駆動することを明らかにしました。