Rapid and Reliable Structural Modeling of Adaptive Immune Receptors Using an Optimized AlphaFold3 workflow
本論文は、MSA 構成と推論フェーズ数を最適化することで、抗体や T 細胞受容体の構造予測を従来の AlphaFold3 より約 45 倍高速化しつつ高精度を維持するワークフローを開発し、免疫学研究における高スループットな構造モデリングを可能にしたことを報告しています。
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本論文は、MSA 構成と推論フェーズ数を最適化することで、抗体や T 細胞受容体の構造予測を従来の AlphaFold3 より約 45 倍高速化しつつ高精度を維持するワークフローを開発し、免疫学研究における高スループットな構造モデリングを可能にしたことを報告しています。
この研究は、単一細胞 RNA シーケンシングを用いて、パーキンソン病の予兆期において腸と中枢神経系を結ぶ記憶 T 細胞クローンが存在し、腸由来のαシヌクレインを模倣したミクログリア様マクロファージが JAK-STAT や TNF シグナルを介した炎症を引き起こすことで、パーキンソン病の発症に至るメカニズムを解明したことを報告しています。
本研究は、肥満モデルマウスにおいて骨髄系細胞の HDAC7 が肝臓の炎症と全身のグルコース調節異常を駆動し、進行性慢性肝疾患の特徴と関連することを示しています。
本研究は、抗 CTLA-4/抗 PD-1 療法が T 細胞と抗原提示細胞の三分子複合体を核として形成する「免疫促進性細胞近隣(IP-CN)」を時間的・空間的に成熟させ、腫瘍周辺での T 細胞増殖と腫瘍細胞への細胞傷害性 T 細胞の作用を区画化することで、腫瘍免疫を駆動するメカニズムを解明したものである。
本研究は、3 励起光源スペクトルフローサイトメーター向けに最適化された 27 色のパネルを開発し、マウスの多様な組織におけるリンパ球・骨髄系細胞ならびに非免疫細胞の包括的な同時プロファイリングを可能にし、免疫動態の解明や新規細胞集団の同定に寄与するものである。
本論文は、フランシセラ・ツラレニス菌が抗酸化防御系(OxyR)を介して宿主細胞の酸化還元環境を制御し、これにより Aim2 インフラマソームの活性化を抑制するメカニズムを解明したものである。
本論文は、多角的な解析手法を用いて、結核菌(Mtb)が肺のミトコンドリア免疫代謝を抑制することで病原性を促進し、逆にミトコンドリア代謝の維持が感染防御に不可欠であることを明らかにしたものである。
抗 HIV 免疫毒素と抗体薬物複合体は、標的細胞を殺す際に共通する点と異なる点の両方を持ち、細胞死のメカニズムが臨床的有効性に影響を与える可能性を示唆する研究結果が得られました。
この研究は、マウスモデルを用いた時系列トランスクリプトーム解析により、腸内感染に対する全身性の急性期タンパク質応答の持続時間を調節する上で、肝臓が感染の早期に自己制限的な炎症シグナルを発生させる重要な役割を果たしていることを明らかにしました。
本研究は、HeLa 細胞で発現させたデングウイルス 1 型 VLP がマウスにおいて強力な抗体応答を誘導することを示し、同 VLP が有望なワクチン候補および血清診断ツールとなり得ることを明らかにした。
この論文は、SARS-CoV-2 の RNA とヌクレオカプシドタンパク質が抗 N 抗体と形成する免疫複合体が、Fc 受容体および TLR8 を介して単球の炎症性サイトカイン産生を誘導し、血管内皮機能障害を引き起こすことで、重症 COVID-19 の病態に関与している可能性を示しています。
この論文は、粘膜組織における自然殺傷(NK)細胞が、ウイルス感染の制御だけでなく、IL-18 や IL-33 の刺激によりアムフィレグリンを産生して組織修復を直接促進するという、免疫防御と組織保護の二重機能を担っていることを明らかにしたものである。
本論文は、CRISPR-Cas9 技術を用いて UCAR-T 細胞の NKG2D 受容体リガンド(ULBP2/5/6)を欠損させることで、宿主の NK 細胞による攻撃を回避し、その生着性と抗腫瘍効果を向上させる新たな戦略を確立したことを報告しています。
本研究は、中和能を持たない抗体であっても、Fc 領域の糖鎖構造を制御することで ADCC や ADCVI などのエフェクター機能を強化し、SARS-CoV-2 感染の抑制に寄与できることを実証し、中和抗体および非中和抗体の両方における Fc 糖鎖工学の重要性を明らかにした。
本研究では、Imaris ソフトウェアを用いた 3 次元画像解析パイプラインを確立し、M. tuberculosis 曝露非ヒト霊長類の PET/CT スキャンから肺および胸郭リンパ節の炎症部位を脊椎マーカーによるアライメントと自動セグメンテーションで高精度に追跡・定量化し、従来の手法と高い相関を示すとともに、病変の体積や形状、VR 形式でのエクスポートなど、感染経過や治療効果との相関解析を可能にする新たなアプローチを提案しています。
本研究は、微生物への曝露による「訓練」や遺伝子操作(5-リポキシゲナーゼの強化)によって好中球の集積パターン(スワーミング)を再プログラムし、感染の転帰を改善できることを、ゼブラフィッシュを用いたライブイメージングと数理モデルにより実証したものである。
本論文は、腸内細菌叢が IL-1 信号を介して ACVR1R206H 変異による異所性骨化症(FOP)の発症を調節することを明らかにし、腸内細菌叢を標的とした新たな治療戦略の可能性を示したものである。
本論文は、MHC クラス I/II 重複エピトープが mTORC1 経路の抑制を介して NF-κB を活性化し、単球由来樹状細胞を cDC1 様細胞へ分化させる新たなメカニズムを解明し、がん免疫療法の開発への応用可能性を示唆している。
本研究は、マスト細胞特異的な G 蛋白共役受容体 Mrgpra6 が、線虫感染に対する宿主の防御反応を媒介する基盤的な役割を担っていることを明らかにしました。
樹突状細胞ワクチンの有効性を高めるためには、腫瘍部位での持続的な TNFα分泌が CD8+ T 細胞の細胞傷害性を誘導するために不可欠であり、これにより T 細胞活性化の段階的モデルが確立された。