724 件の論文
微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。
Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。
以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。
本論文は、疎な縦断的メタボロミクスデータは数値的に推定可能な動態量をもたらし得る一方で、特にグローバルな安定性トポロジーに対しては、それらの科学的な識別性を確保できないことが多いということを示し、それによって、疎な観測結果を潜在的な代謝動態の証拠として過剰に解釈することを避けるために、より密なサンプリング設計を必要とする識別性の階層を確立している。
本論文は、プロトタイプ学習を利用してインフルエンザA型ウイルスの宿主適応を連続的なプロセスとして定量化するディープラーニングモデルであるInfluProtoを紹介しており、これにより高精度な種間伝播予測を実現し、パンデミック監視のための価値あるツールを提供している。
本研究は、CB1受容体を介したエンドカンナビノイド・シグナル伝達が結腸粘膜の代謝および酸素恒常性を乱し、それによって腸内細菌科細菌の酸素依存的な増殖を刺激し、腸管炎症を悪化させることを示している。
本研究は、女性における再発性尿路感染症が、微生物多様性の減少、ラクトバチルス属の喪失、および治療状況に関わらず持続する多剤耐性かつ病原性を有する尿路病原体の優勢を特徴とする、安定した菌交代現象状態によって特徴付けられることを明らかにしている。
本論文は、柔軟なシュードタイピングを通じたウイルスエンベロープタンパク質およびその非遺伝的多様性の高バイオセーフティな単一粒子フロービオメトリー解析を可能にするために、蛍光タンパク質をHIV-1 Gagポリプロテインに組み込んだ第三世代レンチウイルスベクターシステムを提示するものである。
本研究は、健康な女性の膣内微生物叢から分離されたLacticaseibacillus paracasei SRGが、強力なプロバイオティクス特性を示し、その細胞不含上清中に、泌尿器系病原体を効果的に抑制する耐熱性およびプロテアーゼ耐性を有するpH依存的な抗菌代謝物を産生することを示しており、尿路感染症の管理における新規プロバイオティクス候補としての可能性を強調している。
本研究は、系統学的な近縁性にもかかわらず、線虫食性真菌である *Esteya floridanum* と *E. vermicola* が、接種1時間後の松材線虫 *Bursaphelenchus xylophilus* において、異なったゼノバイオティクスおよび炭素代謝経路のダウンレギュレーションを伴う、異なるタンパク質分解およびリソソーム活性化パターンを特徴とする、独自の初期転写応答を誘発することを明らかにしている。
本研究は、独立成分分析（ICA）を大規模な大腸菌（*Escherichia coli*）のTraDIS-Xpressフィットネス・データの集成に適用することで、複雑な遺伝子型と表現型の関係を明確な機能および発現モジュール（fxModules）へと分解し、注釈に依存しない手法による既知の耐性メカニズムの正確な特定、および多様なストレス条件下における新規の遺伝子連関の発見を可能にするものである。
本研究は、完全な状態のグラム陰性細菌内におけるDNA-PAINTイメジャー・ドッキングペアを系統的に最適化するためのRNA-FISHに基づくスクリーニングプラットフォームを確立し、細菌構造およびRNAクラスターの高精度かつ多重的な3次元超解像イメージングを可能にするものである。
HELIUS多民族コホートの6年間にわたる縦断的研究は、腸内細菌叢の組成にいくらかの時間的な変化が見られる一方で、共通の都市環境内においても、微生物組成および機能能の両方における顕著な民族間の差異が持続しており、これらの格差の半減期はおよそ20年と予測されることを明らかにしている。