Polymicrobial extracellular vesicles reduce the innate immune response of human cystic fibrosis bronchial epithelial cells
この研究は、嚢胞性線維症（CF）患者の肺で見られる多菌種由来の細胞外小胞が、CF 気道上皮細胞の自然免疫応答を抑制し、炎症を悪化させるだけでなく、有効な治療薬である Trikafta の効果も阻害することを明らかにした。
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microbiology
792 件の論文
Fast and reliable association discovery in large-scale microbiome studies and meta-analyses using PALM
本論文は、大規模なマイクロバイオーム研究やメタ分析において、偽陽性の制御や検出力の向上、計算効率の改善を実現する高速かつ信頼性の高い関連性発見フレームワーク「PALM」を提案し、その有効性をシミュレーションと実データを用いて実証したものである。
Antifungal and Bioactive Potential of Pleurotus ostreatus Cultivated on Agro-Waste Substrates with Molecular Identification and Functional Characterization
この論文は、ナイジェリアの農業廃棄物基質で栽培されたヒラタケ（Pleurotus ostreatus）の分子同定を行い、その抽出物がカンジダ・アルビカンやアスペルギルス・フミガタスなどの臨床的病原体に対して顕著な抗真菌活性と抗酸化能を示すことを明らかにし、基質の種類が生物活性に重要な影響を与えることを示唆しています。
Polyphosphate acts as an architectural regulator of carbon fixation and nucleoid structure in cyanobacteria
この論文は、シアノバクテリアにおいてポリリン酸がストレス応答の貯蔵物質であるだけでなく、核様体の構造維持と炭素固定器官（カルボキシソーム）の空間的配列を統合的に制御する建築調節因子として機能し、光合成の適応に不可欠であることを明らかにした。
Modification-aware AI enables terminal chemical modifications for peptide design and discovers potent antimicrobials
本研究は、N 末端および C 末端の化学修飾を明示的に設計する生成 AI フレームワーク「Termini」を開発し、実験的に 120 個のペプチドの 92.5% が抗菌活性を示すなど、高いヒット率と体内での有効性を確認することで、次世代抗菌ペプチドの創出に大きな可能性を示しました。
Biological Synthesis of Silver Nanoparticles with Aqueous Extract of Azadirachta indica Leaf and Its Antimicrobial Activity on Uropathogenic MDR and ESBL Producing Escherichia coli.
この研究は、ニーム（Azadirachta indica）葉抽出液を用いて生物合成された銀ナノ粒子が、多剤耐性および ESBL 産生性大腸菌に対して強力な抗菌活性を示し、同時にヒト腎細胞に対しては低い毒性を示すことを明らかにした。
Gut Microbiota Mediates the Association between Diet Quality and Ectopic Adiposity: The Multiethnic Cohort Adiposity Phenotype Study
この研究は、多民族コホートを対象とした解析により、MIND 食の質の向上が腸内細菌叢（特に Lachnospiraceae UCG.001 や Lachnoclostridium 属など）を介して内臓脂肪や肝臓脂肪の蓄積を減少させ、MASLD のリスクを低下させることを示しました。
The IL-1 Family Controls Acute Mucosal Fungal Infection and Mucosal-Systemic Dissemination.
この研究は、IL-1 ファミリーが抗菌ペプチドや IL-17、好中球応答を制御することで粘膜真菌感染の防御と全身への播種防止に不可欠であり、特に好中球減少症患者においてそのシグナル欠損が致命的な全身感染を引き起こすことを明らかにした。
LGTM: Gaussian Process Modulated Neural Topic Modeling for Longitudinal Microbiome
この論文は、高次元・組成性・不規則サンプリング・時間的依存性といった縦断マイクロバイオームデータの分析課題を解決し、生物学的に解釈可能な微生物サブコミュニティ（トピック）の発見と、それらの時間的・環境的変動の定量化を可能にする確率モデル「LGTM」を提案するものです。
Reduced precipitation alters microbial availability and redistribution of rhizosphere carbon
地中海性草原における降水減少実験の結果、土壌水分の低下が根圏炭素の移動を制限して微生物生息地を分断し、その結果として根圏微生物による炭素の取り込みと生態的相互作用が強化されることが示されました。
A conserved peptidase governs glucose homeostasis in Bacteroides
ヒト腸内共生菌バクテロイデスにおいて、保存されたM16型ペプチダーゼがグルコース濃度依存的に転写調節因子Curを制御し、宿主の過剰なグルコース摂取が腸内細菌の定着能力を阻害する新たなメカニズムを明らかにしました。
A structure-guided pipeline yields peptide inhibitors that disarm fungal peptidase-driven virulence and resistance
本研究では、クリプトコッカス・ネオフォルマンスの病原性ペプチダーゼを標的とした構造ガイド型パイプラインを開発し、宿主細胞への毒性や殺菌作用を伴わずに病原性を無力化し、既存抗真菌剤との相乗効果を示す新規ペプチド阻害剤を設計・実証しました。
Continental-scale multi-omics reveals a distinct microbial-viral biome in sandy beach ecosystems structured by tidal zonation
中国沿岸の広域にわたるメタオミクス解析により、潮汐帯による環境勾配が微生物とウイルスの多様性及び代謝戦略を決定づける、これまで認識されていなかった独自の微生物・ウイルスバイオームが砂浜に存在し、その大部分が新規種であることが明らかにされました。
Development of host-mimicking legume-based media for robust induction of sporulation in soybean-associated Cercospora species
本論文は、大豆関連の Cercospora 属菌の胞子形成を安定して誘導し、実験的標準化を可能にするため、大豆やエンドウなどの宿主植物由来の培養基を開発し、その有効性を従来の人工培地と比較して実証したものである。
A pooled screening approach reveals bacterial chemoreceptors for short-chain carboxylic acids
本論文は、プール型スクリーニング法を開発し、Pseudomonas 属細菌において短鎖カルボン酸を感知する新たな化学受容体群を同定するとともに、その結合ポケットの構造的特徴がリガンド認識の基盤となっていることを明らかにしたものである。
A Syntenic Pangenome of Gardnerella Reveals Novel Plasmids and Phage, Taxonomic Boundaries, and Species-Level Stratification of Metabolic and Virulence Potential
本論文は、392 株のガーデネラ属分離株のゲノム解析に基づき、21 の系統（11 種・15 亜種）を特定し、新たな命名体系とシテンティック・パンゲノム解析を通じて代謝・病原性能力の種特異的差異や、この属で初めて発見されたプラスミド・ファージを明らかにすることで、細菌性腟炎（BV）の診断や治療に向けた統一的な枠組みを提示したものである。
Azospirillum brasilense and tomato exudate or cytidine increases phytopathogen resistance and modulates phyllosphere/rhizosphere
本論文は、トマトの根圏分泌物またはシチジンと Azospirillum brasilense Sp7 の併用が、病原菌 Pseudomonas syringae に対するトマトの耐病性を大幅に向上させ、葉圏および根圏の微生物叢組成を調節することを示している。
Rumen transfaunation between low- and high-methane-yielding dairy cows reveals asymmetric microbiome reconstitution patterns: a pilot study
ノルウェー赤牛の低・高メタン産生個体間でのルーメン内容物完全交換実験により、メタン産生形質が維持され、低産生個体は元の微生物叢を再構築する一方、高産生個体はドナー由来の微生物叢を保持する非対称な再構成パターンが示されたが、サンプル数が少ないためさらなる検証が必要である。
Synbiotic Yogurt with Lactobacillus plantarum and Stevia rebaudiana: Physicochemical, Microbiological, and Functional Evaluation
本論文は、Lactobacillus plantarum とステビア抽出物を添加したシナバイオティックヨーグルトの開発を通じて、その物性、微生物学的特性、抗酸化能および官能評価が向上し、栄養価が高く受容性の高い機能性乳製品となり得ることを示したものである。
Functional Divergence and Conservation in the QueC Protein Family (PF06508): From tRNA Modification to Anti-Phage Defense
本論文は、Sequence Similarity Network とゲノム近傍解析を組み合わせることで、QueC 超家族（PF06508）が tRNA 修飾や補因子生合成といった従来の機能に加え、QatC や Cap9 といった多様な抗ファージ防御システムへと進化的に再編成・多様化してきたことを明らかにし、その機能的分岐と保存の包括的な枠組みを提示したものである。