A scalable genomic framework for programmable strain tagging in a diverse bacterial genus

本研究は、CRISPR 関連トランスポゾンシステムを植物関連細菌*Sphingomonas*属に適用し、新規なトランスポゾンマッピング法「tagIMseq」を用いてオフターゲット挿入をスクリーニングすることで、多様な菌株を正確にタグ付けし、高スループットな合成群集の構築を可能にするスケーラブルなゲノムフレームワークを確立したものである。

Mehmetoglu Boz, E., Barajas, H. R., Yu, T.-T. + 6 more2026-04-04🦠 microbiology

Systematic Validation of AlphaFold-Predicted Interactomes with LUCIA

本研究では、従来のクローニングやタンパク質発現を不要とする高速な生化学的スクリーニングプラットフォーム「LUCIA」を開発し、ヘルペスウイルスの AlphaFold 予測相互作用網を実験的に検証することで、信頼性の高い相互作用を特定する閾値を確立するとともに、ウイルス複製に不可欠な新規タンパク質間相互作用の機能を実証しました。

Zhang, T., Kraft, J., Soh, T. K. + 3 more2026-04-04🦠 microbiology

Type IV pilus length determines virulence by regulating a hidden subpopulation of non-contributing filaments

本論文は、緑膿菌における IV 型繊毛の長さが、環境基質や宿主細胞と相互作用できない「非寄与」繊毛の隠れたサブ集団を制御することで、運動性やバイオフィルム形成などの病原性を決定し、従来の再収縮力中心の理解とは異なり、繊毛の伸長ダイナミクスが病原性のボトルネックとなることを明らかにしたものである。

Modi, Z. K., Reed, J., Yusuf, A. O. + 4 more2026-04-04🦠 microbiology

Population-level genome sequencing reveals distinct Mycobacterium tuberculosis intrahost mutational trajectories in simian immunodeficiency virus co-infected and antiretroviral treated non-human primates

この研究は、SIV 感染および抗レトロウイルス療法を受けた非ヒト霊長類の多組織から得られた M. tuberculosis 集団の全ゲノム解析を通じて、宿主免疫状態に応じた変異軌跡の差異や脂質代謝関連遺伝子における共通変異パターンを解明し、SIV-Mtb 共感染および ART 抑制下における細菌の分散と適応メカニズムを明らかにしたものである。

Chao, M. C., Chase, M. R., Wakabayashi, S. + 11 more2026-04-04🦠 microbiology

Control of cell division by an Acinetobacter baumannii protein with a novel nucleotidyl-cyclase-like fold

本研究は、多剤耐性菌 Acinetobacter baumannii の細胞分裂とフルオロキノロン耐性を制御する必須タンパク質 AdvA が、アデニル酸/グアニル酸シクラーゼに類似した新規フォールドを持ち、その C 末端領域を介して分裂装置(ディヴィソーム)の構築と活性化を調節することを明らかにした。

Farinha, A., Soo, M. W., Minasov, G. + 9 more2026-04-04🦠 microbiology

DETECTION OF BIOSYNTHETIC GENE CLUSTERS FROM METAGENOME OF NATURAL HONEY COLLECTED IN VIETNAM

ベトナムの西北山岳地域で採取されたミツバチ(Apis cerana)の蜂蜜メタゲノム解析により、既知のデータベースと 83% 以上が一致しない新規なバイオ合成遺伝子クラスターが多数発見され、特に Atlantibacter hermannii に由来するアゾール含有 RiPP が強力な抗菌活性を持つ可能性が示唆された。

Nguyen, H.-N., Kim, O. T. P., Tran, T. T.2026-04-04🦠 microbiology

Repurposing anti-phage defenses to differentially arrest the viral lifecycle reveals the regulatory logic of a parasitic satellite

本研究は、Vibrio cholerae の PLE が ICP1 噬菌体のゲノム複製ではなく転写カスケードの進行段階に依存して活性化されることを、BREX や DarTG といった防御システムを分子の障壁として利用することで明らかにし、PLE が噬菌体の発育マイルストーンに紐付く複数のシグナルによる「段階的ライセンス戦略」を用いて堅牢な活性化を実現していることを示しました。

Bagdatli, S. T., Seed, K.2026-04-04🦠 microbiology

A 16S rRNA gene-based analysis of microbial communities in compost-bedded pack barns from dairy farms in Argentina.

この論文は、アルゼンチンのコルドバ州にある 2 つの酪農場のコンポスト・ベッドド・パック(CBP)システムにおいて、16S rRNA 遺伝子シーケンシングを用いて微生物群集構造を特徴づけ、管理条件の違いが細菌群集の組成に与える影響を明らかにしたものである。

Monge, J. L., Peralta, C., Palma, L.2026-04-04🦠 microbiology

Breaking the:"one nucleus, one whole genome" rule: Neurospora crassa separates its haploid chromosomes into different nuclei

本論文は、従来「1 個の核に 1 つの完全なハプロイドゲノムが存在する」と考えられていたモデル生物・Neurospora crassa においても、ハプロイド染色体が複数の核に不均等に分配される現象が確認されたことを報告し、この「1 核 1 ゲノム」の法則が病原菌に限らず広範な真菌類に当てはまらない可能性を示唆しています。

Tan, J., Xu, Y., Yang, P. + 4 more2026-04-03🦠 microbiology

Proteomic stress response by a novel methanogen enriched from the Great Salt Lake

グレートソルトレイクから単離された新規メタン生成古細菌「Candidatus Methanohalophilus hillemani」は、塩分や酸素ストレスに対してエネルギー保存や浸透圧耐性タンパク質の発現を増加させない一方で、硫酸還元菌の存在下では微量金属の取り込みや免疫機能を優先し、環境ストレス下でもメタン生成に寄与していることを示した。

Christian, W. C., Jay, Z., Tolic, N. + 5 more2026-04-03🦠 microbiology

Draft Genome Sequence of Bacillus pergaminensis sp. nov. strain Bva_UNVM-123: A Promising Candidate for Bioremediation.

アルゼンチンの農土から単離された新規菌種*Bacillus pergaminensis* sp. nov.(菌株 Bva_UNVM-123)のゲノム配列が解読され、重金属や抗生物質への耐性遺伝子を有し、安全性も確認されたことから、バイオレメディエーションへの有望な候補であることが示されました。

Peralta, C., Sauka, D. H., Felipe, V. + 2 more2026-04-03🦠 microbiology

Identification of Human Transferrin Receptor as an Entry Co-receptor for Parvovirus B19 Infection of Human Erythroid Progenitor Cells

本研究は、パルボウイルス B19 が赤血球前駆細胞へ感染する際、AXL 受容体による付着の後にヒトトランスフェリン受容体 1(hTfR)が共受容体としてウイルスの VP1u 領域と直接結合し、細胞内への取り込みを促進することを明らかにした。

McFarlin, S., Ning, K., Zhang, X. + 6 more2026-04-03🦠 microbiology

Pseudomonas aeruginosa balances cytotoxicity and motility to counter phagocytosis by macrophages

この論文は、慢性感染症において緑膿菌が運動性を低下させてマクロファージによる貪食を回避する「凍結」戦略と、急性感染症において T3SS を活性化してマクロファージを殺傷する「戦闘」戦略という、2 つの異なる免疫逃避メカニズムを明らかにしたものである。

Distler, T., Tsai, C.-N., Weimann, A. + 4 more2026-04-03🦠 microbiology