Hawaiian Geothermal Fumaroles Contain Diverse and Novel Viruses
この論文は、ハワイの火山性噴気孔から採取されたメタゲノムデータを用いて、未記載のウイルス分類群や微生物適応に関与する代謝遺伝子を同定し、極限環境におけるウイルス生態系の新たな知見を提供するものである。
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microbiology
797 件の論文
Intragenic Transcription from Defective HIV Proviruses Triggers Interferon Responses in Myeloid Cells
不完全な HIV プロウイルスから生じる異常な RNA が、MDA5 依存的な細胞内免疫経路を活性化してインターフェロン応答を誘導し、HIV 感染者における慢性炎症や併発症の主要な原因となっていることが示されました。
Orchestration of Staphylococcus aureus EV biogenesis by nutrient availability through quorum sensing
本論文は、高スループットなトランスポゾン変異体ライブラリ解析を用いて、Staphylococcus aureus において栄養状態が Quorum Sensing システム（agr）を介して細胞外小胞（EV）の生成を制御することを明らかにしました。
Soil bacterium Massilia secretes metabolites that promote Leptospira growth
本研究は、土壌細菌 Massilia 属が分泌するリシン生合成中間体 4MOP が病原性レプトスピラの増殖を促進することを明らかにし、環境微生物との代謝的相互作用がレプトスピラの環境内生存に重要であることを示しました。
Understanding the impact of sodium sulfide on the invasive growth of wine yeast
本論文は、窒素制限条件下で硫化ナトリウムがワイン酵母の浸潤成長を促進する可能性を示唆しつつも、遺伝的要因や培養条件がその影響を大きく左右することを明らかにした探索的研究である。
Metagenomic Evidence for Horizontal Gene Transfer and Functional Convergence in the Oral Microbiome of Cohabiting Dogs and Owners
本論文は、メタゲノム解析を用いて犬と同居する飼い主の口腔微生物叢を調査した結果、種レベルの変化は限定的であるものの、抗生物質耐性遺伝子の水平伝播や機能的収束が確認され、同居による微生物交換が人間の口腔環境の遺伝的・機能的側面を再編成し、耐性菌拡散のリスクを高める可能性を明らかにしたものである。
Pathogen priming reveals host immune training and microbiome conditioning in corals
この研究は、サンゴが非致死性の病原菌（*Vibrio coralliilyticus*）に慢性的に曝露されることで免疫が訓練され、微生物叢が調整される結果、熱ストレス下での感染に対する耐性が向上し、サンゴの健全性回復と保全に向けた新たな戦略の基盤が示されたことを明らかにしています。
A novel Flavobacterium quisquiliarum porphyrin binding protein independently disrupts Pseudomonas aeruginosa biofilms
本論文は、Flavobacterium quisquiliarum 由来の未同定ポルフィリン結合タンパク質（FqPBP）が、ポルフィリンのキレート作用を介して鉄ホメオスタシスを乱すことで、Pseudomonas aeruginosa のバイオフィルムを独立して破壊・分散させる新たなメカニズムを解明し、感染症治療における新たな戦略を示したものである。
D-gluconate drives Salmonella growth during acute and chronic infection
本論文は、D-グルコン酸が炎症を伴う腸内環境においてサルモネラ属菌の増殖を駆動する主要な栄養源であることを明らかにした。
Discovery of resistance-resilient quinoline papain-like protease inhibitors through topology-constrained molecular generative design
AI 駆動のトポロジー制約分子生成モデルと構造指針最適化を組み合わせることで、耐性変異体（E167K）に対しても有効な強力なキナリン系 PLpro 阻害剤 GZNL-2016 を発見し、SARS-CoV-2 感染症に対する新たな治療戦略を確立しました。
Expanding vaginal microbiome pangenomes via a custom MIDAS database reveals Lactobacillus crispatus accessory genes associated with cervical dysplasia
18,000 以上のゲノムから構築された膣特異的パノゲノムデータベースを用いたメタゲノム解析により、子宮頸異形成と関連する Lactobacillus crispatus の 13 種類のアクセサリ遺伝子が同定され、生殖健康における種内微生物変異の重要性が示されました。
Bovine H5N1 influenza viruses have adapted to more efficiently use receptors abundant in cattle
2024 年に米国で牛群に流行した H5N1 型インフルエンザウイルスは、D104G と V147M の変異を獲得して牛特有の NeuGc 受容体を効率的に利用できるよう進化し、牛での複製能力を高める一方でヒトへの感染リスクは即座には高まっていないことが示されました。
Novel African Rhinolophus bat ACE2 sequences reveal the determinants of Afro-Eurasian sarbecovirus entry
ザンビア産のアフリカ産コウモリ（Rhinolophus simulator および R. blasii）の ACE2 遺伝子配列を新たに解明し、アフリカ・ユーラシア系サベコウイルスの感染決定因子や宿主特異性を分子レベルで解き明かした。
Methanol-specific methyltransferase isozymes have large carbon kinetic isotope effects that impact methane isotopic signatures
メタノール特異的メチル転移酵素複合体（MTA）が触媒する反応における大きな炭素および水素の運動性同位体効果（KIE）が、メタノール基質を用いたメタン生成に伴うメタンの同位体組成の特徴的なシグネチャーを決定づけていることを、*Methanosarcina acetivorans* の培養実験と逆モデル解析により実証しました。
Atlas of HIV cis-regulatory elements reveals extensive transcriptional variation across clades, isolates, and within individuals
本研究は、大規模並列レポーターアッセイと比較配列解析を組み合わせることで、HIV-1 および HIV-2 のクローン、分離株、さらには個体内においても転写調節に広範な変異が存在し、特定の転写因子構成や保存されたイントラ遺伝子 cis 調節要素によって駆動されていることを明らかにし、配列に基づく予測モデルの開発を通じてウイルス多様性の機能的注釈を可能にしました。
Similarities Between Antibiotic-Resistant Escherichia coli from Raw Meat, Commercial Raw Dog Food and Those Causing Extraintestinal Human Infections: A Contemporaneous Geographically Focussed Genomic Epidemiology Study
英国ブリストルにおける同時かつ地理的に焦点を絞ったゲノム疫学研究により、生肉や生食ドッグフードから分離された抗生物質耐性大腸菌と、ヒトの感染症を引き起こす同菌との間に近縁な系統関係が確認されたことから、生食ドッグフードの微生物基準の強化や、ペット所有者へのリスク啓発、ならびに統合耐性菌監視への組み込みが推奨されます。
A conserved in-frame stop codon acts as a multipotent defense mechanism in alphaviruses
本論文は、アルファウイルスが脊椎動物および昆虫の両宿主において、非構造タンパク質の処理や複製構造の維持、ならびに RNAi などの自然免疫応答を回避する多機能な防御機構として、保存されたインフレームの終止コドン（オパール）を利用していることを明らかにしたものである。
Strain-Specific Epistasis Shapes Fitness Landscapes of APOBEC3G Antagonism By HIV-1 Vif Proteins
深変異スキャンを用いた解析により、HIV-1 Vif タンパク質が宿主の APOBEC3G を拮抗する際の適応度地形は、株特異的なエピスタシスと時間的なエピスタシスによって形成され、構造的な頑健性が適応を可能にする一方で、エピスタシスが Vif の進化に制約を課していることが明らかになりました。
Genomic Insights into a Multispecies Bacterial Pathogen Complex Driving Bacterial Blotch in White Button Mushrooms.
この研究は、従来の単一病原体説を覆し、アメリカのシイタケ栽培における細菌性斑点病が、以前は病原性不明だった P. azotoformans を含む多様な Pseudomonas 属細菌の複合体によって引き起こされることを、ゲノム解析と表現型評価を通じて明らかにした。
The tobacco hornworm as a novel host for the study of bacterial virulence
本論文は、タバコホウカイガラムシ（Manduca sexta）が、細菌の病原性や宿主 - 病原体の動態を研究するための、従来のワックスガの幼虫よりも感度の高い新たなモデル宿主として有効であることを示している。