726 件の論文
微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。
Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。
以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。
本論文は、AIエージェントが現実世界のマイクロバイオームデータを分析する能力を評価するために、多様なメタゲノム領域にわたる100の評価からなる検証可能なベンチマークであるMetagenomicsBenchを導入しており、最強の構成が60%の合格率を達成している一方で、エージェントは技術的な習熟度にもかかわらず、問題の解釈、統計的推論、および生物学的解釈において頻繁に苦戦していることを明らかにしている。
本研究は、ラディッシュの種子に由来する合成マルチキングダム微生物コミュニティ、特に細菌、糸状菌、および酵母を組み合わせたものが、病害発生率を減少させ、成長を回復させ、相補的な生態学的機能を通じて病原体の定着を抑制することにより、真菌性病原体である*Alternaria brassicicola*から苗を効果的に保護することを実証している。
本研究は、AlphaFold2を用いて新たにモデリングされた87のファミリーを通じて、クラスB β-ラクタマーゼに対するGalleni-Garau標準番号付けスキーム（BBL）の堅牢性を検証し、その汎用的な適用可能性を確認すると同時に、実験的な追跡調査を必要とする構造的分岐を持つ変異体の少数のサブセットを特定した。
本研究では、RB-TnSeqを用いて、ジャガイモ塊茎感染時における6種のペクトバクテリウム属細菌における条件必須遺伝子を特性評価し、軟腐病の病原性に寄与する保存された代謝要件と種特異的な適応度決定因子の両方を明らかにしている。
本研究は、これまで単一の標準株からのみ知られていた希少なバチルス・セレウス・グループの種が、公開データベースから新規のメタゲノムアセンブリゲノムを特定および構築することによって、想定よりも地理的に広く分布していることを明らかにし、それによってそれらの機能的ポテンシャルと進化に関する初の株レベルの評価を可能にした。
本研究は、細菌の遷移を能動的なファージの複製が駆動している一方で、全体的な発酵プロセスおよび代謝物生成は、これらウイルスと細菌の相互作用にもかかわらず、回復力があり安定した状態を維持していることを示している。
本研究は、バルト海における高度に合理化された*Nitrosopumilus*集団が、強い浄化選択の下で実質的なビタミン生合成能を維持していることを明らかにしており、これは保持されたこれらの経路が進化的に保存されており、生産者およびより広範な微生物コミュニティの両方にとって生態学的に重要であることを示唆している。
本研究は、共有結合したc型ヘムの獲得を通じて進化した、Cacheドメインタンパク質の明確な一族を特定および特徴付け、これらのドメインが一酸化窒素センサーまたはレドックス調節因子として機能するという、細菌の感覚系進化における新たなメカニズムを明らかにしている。
本研究は、藻類*Chrysochromulina parva*から単離されたポリントン様ウイルス（PLV）が、複製のためのヘルパーとしてAlgaviralesウイルスを利用できることを示す、初の培養に基づく証拠を提示しており、既知のImiterviralesへの依存とは異なる、新たな超寄生関係を確立するものである。
本研究は、シングルセル・トランスクリプトミクスを用いて、in vitro培養された*Leishmania major*および*L. mexicana*のライフサイクルと細胞周期遺伝子発現のダイナミクスをマッピングし、種特異的な発生軌道を明らかにするとともに、発生上の転換と特定の細胞周期フェーズを結びつける保存された細胞周期制御遺伝子を特定するものである。