Structural insight into sodium-dependent bile acid transport by members of the SLC10 family
이 논문은 SLC10 계열의 나트륨 의존성 담즙산 수송체 (ASBT) 의 구조적 특징을 규명하여, NTCP 와 달리 단백질 내부에 관형 공극이 존재하지 않으며 막 지질이 담즙산의 소수성 스테롤 부분과 상호작용하여 수송 메커니즘에 관여함을 밝혔습니다.
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biochemistry
388 편의 논문
Magnesium as a Conformational Gatekeeper of KRAS: Structural Dynamics and Therapeutic Implications
본 연구는 HDX-MS 등 다양한 기법을 통해 마그네슘 이온이 KRAS 의 구조적 역학을 조절하는 '게이트키퍼' 역할을 하며, 특히 SOS1 매개 핵산 교환 시 마그네슘 배위 교란과 스위치 I 안정화를 통해 KRAS 의 활성을 제어한다는 새로운 기작을 규명했습니다.
Rapid Histone Post-Translational Modification Analysis Using Alternative Proteases and Tandem Mass Tags
이 논문은 기존 방법보다 훨씬 빠르고 정확한 히스톤 번역후수식 (PTM) 분석을 위해 새로운 프로테아제와 TMT 라벨링을 결합한 'RIPUP' 워크플로우를 개발하여, 기존에는 탐지되지 않았던 '어두운 후성유전체' 영역을 포함한 광범위한 PTM 을 신속하게 규명할 수 있음을 입증했습니다.
Are hyaluronic acid synthases widely encoded in fungi?
이 연구는 진균계 (특히 담자균문) 에 히알루론산 합성효소가 더 널리 존재할 수 있음을 예측하고, 68 개의 후보 유전자를 발굴하여 세균 및 동물 유래 합성효소와 구별되는 고유한 구조적·진화적 특징을 규명했습니다.
A Global Ligandability Map of Tryptoline Butynamide Stereoprobes Identifies Covalent Inhibitors of the Actin Maturation Protease ACTMAP
이 연구는 아크릴아미드와 달리 전 세계적 반응성이 낮지만 특정 단백질과 선택적으로 결합하는 부티나마이드 기반 프로브를 개발하여, ACTMAP 효소를 표적하는 공유 결합 억제제를 발견함으로써 인간 프로테옴의 리간드성 확장에 기여했습니다.
Towards crystal structures of filament forming proteins
이 논문은 TasA 와 칼렐리신과 같은 필라멘트 형성 단백질의 결정화 및 구조 분석을 어렵게 만드는 자가 결합 및 다분산성 문제를 해결하기 위해 N 말단 및 C 말단 절단 변이체 제작과 N 말단 확장 등의 아미노산 서열 변형 전략이 필수적임을 제시합니다.
A conserved archaeal ribosome-associated factor linking bacterial hibernation and eukaryotic energy sensing
이 연구는 고균에서 발견된 새로운 리보솜 휴면 인자 AHA 가 세균의 휴면 촉진 인자 (HPF) 와 진핵생물의 에너지 감지 단백질 (AMPKγ) 과 진화적으로 연결되어 있음을 규명함으로써, 원핵생물의 번역 정지와 진핵생물의 에너지 감지 메커니즘 사이의 직접적인 진화적 연관성을 제시했습니다.
Regulation of mitochondrial DNA homeostasis by a mitochondrial microprotein
이 논문은 AltSLC35A4 라는 대체 오픈 리딩 프레임 (AltORF) 으로 암호화된 보존된 마이크로단백질이 액틴 - 마이오신 세포골격 조절 인자와 상호작용하여 미토콘드리아 DNA 의 복제 및 전사와 무관하게 미토콘드리아 뉴클레오타이드의 항상성과 공간적 분포를 조절하는 새로운 역할을 수행함을 규명했습니다.
Self-S-sulfonation in a bacterial persulfide dioxygenase mediates thiol persulfide detoxification
이 논문은 황색포도상구균의 CstB 효소가 C201 의 자가-S-설폰산화를 통해 다양한 반응성 황 종을 독성이 없는 티오황산염으로 전환하는 독특한 기작을 규명함으로써, 세균이 황화수소 독성을 해독하고 세포 보호 효과를 활용하는 방식을 설명합니다.
Linking biochemical and cellular efficacy of MERS coronavirus main protease inhibitors
본 논문은 MERS-CoV 주단백질효소 억제제의 이상 농도 - 반응 곡선을 분석할 때, 이량체화와 리간드 결합을 고려한 효소 동역학 모델을 적용하는 것이 세포 내 효능을 가장 정확하게 예측할 수 있음을 규명했습니다.
Unleashed condensation by recurrent mutations of an epigenetic regulator promotes cancer
이 연구는 ASXL1 의 빈번한 말단 절단 돌연변이가 정상적으로 억제되던 응집 (condensation) 능력을 해제하여 BAP1 의 탈유비퀴틴화 활성을 증폭시키고 조혈모세포 악성화를 유도하며, 이는 무질서 영역의 전하 조절 메커니즘을 통한 생체 분자 응집체의 비정상적 형성이 암 발생의 핵심 기전임을 규명했습니다.
Integrated Multi-Omics Enabled by Sequential Extraction for Comprehensive Molecular Profiling of Small Extracellular Vesicles
이 논문은 시퀀셜 추출을 통해 단일 sEV 샘플에서 단백질, 지질, 대사물질을 동시에 분석하는 통합 멀티오믹스 플랫폼을 개발하여 저입력 샘플 분석의 한계를 극복하고 생체표지자 발견 및 치료 개발을 위한 견고한 분석 기반을 마련했다는 내용을 담고 있습니다.
The promoter-poised Rpd3 HDAC complex orchestrates global chromatin reprogramming upon nutrient transition
이 연구는 효모에서 Rpd3 HDAC 복합체가 영양 상태 변화에 반응하여 프로모터의 아세틸화 균형을 조절하고 전사 프로그램을 재편성함으로써 대사 전환을 가능하게 하는 핵심 기작을 규명했습니다.
Identification of 4,5,6,7-Tetrabromo-1H-benzotriazole (TBB) as a Small Molecule MESH1 Inhibitor that Suppresses Ferroptosis
이 논문은 4,5,6,7-테트라브로모-1H-벤조트리아졸 (TBB) 이 MESH1 을 표적으로 하는 소분자 억제제로서 페로토시스를 억제하여 신경퇴행성 질환 등 다양한 병리학적 상태에 대한 치료 가능성을 제시한다는 사실을 규명했습니다.
Structural basis of metalloid transport by the arsenite efflux pump ArsB
이 논문은 고해상도 Cryo-EM 구조 분석과 기능적 실험을 통해 세균의 비소 배출 펌프인 ArsB 가 수소 이온 (H+) 과 결합된 2 차 수송체로서 비소를 인식하고 세포 밖으로 방출하는 분자적 기작을 규명했습니다.
PXL: a Nucleic Acid-Binding Module of Promyelocytic Leukemia Protein
이 논문은 PML 단백질의 주요 아이소폼인 PML-1 이 X-선 결정학을 통해 규명된 새로운 구조 모듈인 PXL 을 통해 단일 가닥 G-풍부 RNA 와 DNA 를 선택적으로 결합하여 전사체를 조절한다는 사실을 발견하여 PML 의 분자적 기능과 핵 내 유전자 조절 기작에 대한 이해를 확장했다고 요약할 수 있습니다.
Mechanistic machine learning enables interpretable and generalizable prediction of prime editing outcomes
이 논문은 prime editing 의 메커니즘을 기반으로 한 머신러닝 모델 'OptiPrime'을 개발하여 pegRNA 최적화, MMR 회피 전략 수립, 그리고 생체 내 유전자 교정 등 다양한 치료적 맥락에서 prime editing 의 효율성과 예측 가능성을 획기적으로 향상시켰음을 보고합니다.
Seamless workflow of hydroxy acid-modified metal oxide chromatography for rapid and sensitive phosphoproteomics sample preparation
이 논문은 pH 버퍼 및 유기 용매 최적화, SAX-SDB StageTip 을 활용한 직접 정제, 그리고 LMNG 첨가를 통해 저시료량에서도 높은 민감도와 신속성을 확보한 새로운 인산화 프로테오믹스 enrichment 워크플로우인 'Rapid HAMMOC'를 제안하고 있습니다.
Cryo-EM of ATP-driven dynamics and itraconazole binding of the fungal drug efflux ABC pump Candida glabrata Cdr1
이 논문은 아데노신 삼인산 (ATP) 가수분해에 의해 유발되는 Candida glabrata Cdr1 펌프의 동적 구조 변화와 이트라코나졸 결합 메커니즘을 고해상도 Cryo-EM 을 통해 규명하여, 진균의 아졸계 약물 내성 기작을 설명하는 역동적인 구조적 틀을 제시합니다.
Structural basis for regulation of Frizzled-4 signaling by the co-receptor Tetraspanin-12
이 연구는 크라이오-전자현미경을 통해 노린 (Norrin) 신호 전달을 증폭시키는 핵심 조절자로서 프리즈들 -4(FZD4) 와 테트라스파닌 -12(Tspan12) 의 직접적인 복합체 구조를 규명하고, 이 복합체가 노린의 고친화성 결합을 촉진하여 망막 혈관 생성을 조절하는 분자 기전을 밝혔습니다.