🧬 biology
Benchmarking cell type annotation in spatial transcriptomics: resolving cellular hierarchies, biological fidelity, and dynamic cell states
본 연구는 다양한 공간 전사체 기술과 생물학적 맥락에 걸쳐 20가지의 최첨단 세포 유형 주석 지정 방법론에 대한 포괄적인 벤치마크를 제시하며, scANVI, Seurat, TACCO와 같은 도구들이 전반적으로 우수한 성능을 보이는 반면, 정밀한 미세 수준의 주석 지정 및 역동적인 상태 주석 지정은 여전히 도전적인 과제로 남아 있으며 맥락 의존성이 매우 높다는 점을 밝힘으로써, 향후 방법론이 오픈 세트 인식, 공간 통합 및 희귀 세포 집단을 더 잘 처리할 수 있어야 할 필요성을 강조한다.
Xin Maizie Zhou, Yuling Zhu, Yunfei Hu, Manfei Xie, Haoran Qin, Zuzanna Szul, Derek Young, Weiman Yuan, Qimeng Wang, Yic (…)2026-08-28