A Phase-field Model for Apoptotic Cell Death
이 논문은 세포 사멸 (아포토시스) 을 활성화 장에 의해 유도되는 위상장 모델로 시뮬레이션하여 세포 수축, 막 돌출, 공동 형성 및 분열과 같은 다양한 형태적 전이를 모사하고 전자 현미경 이미지와 비교함으로써 치료제 개발을 위한 계산적 검증 도구를 제시합니다.
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108 편의 논문
Technological folie à deux: Feedback Loops Between AI Chatbots and Mental Illness
이 논문은 고립감과 정신건강 서비스 부족 속에서 AI 챗봇의 과도한 의존이 사용자의 인지 편향과 챗봇의 순응적 행동 간 피드백 고리를 형성하여 정신질환자의 현실 검증 능력을 약화시키고 심각한 심리적 위험을 초래할 수 있음을 지적하며, 이에 대한 임상·개발·규제 차원의 통합적 대응을 요구합니다.
Multi-factor modeling of chlorophyll-a in South China's subtropical reservoirs using long-term monitoring data for quantitative analysis
이 논문은 2020 년부터 2024 년까지 중국 광동성 세 개의 저수지에서 수집된 장기 모니터링 데이터를 바탕으로 수온과 영양염 (특히 총질소) 의 상승이 클로로필-a 증가에 미치는 비선형적 상호작용을 규명하고, 이를 정량적으로 분석하는 다인자 수생태 모델을 개발하여 부영양화 관리에 기여했습니다.
Trade-offs between structural richness and communication efficiency in music network representations
이 논문은 음악 네트워크 표현에서 단일 특징 기반의 압축된 표현이 높은 불확실성과 낮은 모델 오차를 보이는 반면, 풍부한 다중 특징 표현은 더 정교한 구분을 제공하지만 상태 공간 확대로 인해 모델 오차가 증가함을 보여주어, 특징 선택이 네트워크 구조뿐만 아니라 청자의 기대를 반영하는 불확실성의 적합성까지 결정한다는 것을 규명합니다.
Uncovering Semantic Selectivity of Latent Groups in Higher Visual Cortex with Mutual Information-Guided Diffusion
이 논문은 상호정보량 기반 확산 모델을 활용하여 고차 시각 피질의 뉴런 집단이 객체 자세 및 범주 간 변환 등 의미 있는 시각적 특징으로 구조화된 잠재 하위 공간에 선택적으로 인코딩되어 있음을 규명한 MIG-Vis 방법을 제안합니다.
pHapCompass: Probabilistic Assembly and Uncertainty Quantification of Polyploid Haplotype Phase
이 논문은 배수체 게놈의 해독에 따른 불확실성을 명시적으로 모델링하고 정량화할 수 있는 확률적 해독 알고리즘 'pHapCompass'를 제안하고, 현실적인 배수체 시뮬레이션 워크플로우와 평가 기준을 마련하여 기존 방법들보다 우수한 성능을 입증했습니다.
Equivariant Asynchronous Diffusion: An Adaptive Denoising Schedule for Accelerated Molecular Conformation Generation
이 논문은 분자 구조의 계층적 인과관계를 포착하면서도 분자 전체의 범위를 유지하기 위해 적응적 비동기 탈노이즈 일정을 도입한 'Equivariant Asynchronous Diffusion (EAD)' 모델을 제안하여 3D 분자 생성 성능을 획기적으로 개선했음을 보여줍니다.
Omics Data Discovery Agents
이 논문은 대규모 언어 모델 에이전트를 활용하여 비정형화된 생물의학 문헌에서 오믹스 데이터를 자동으로 추출, 재분석 및 통합함으로써 정적인 문헌을 실행 가능하고 대규모로 재사용 가능한 자원으로 변환하는 새로운 프레임워크를 제시합니다.
Single-cell directional sensing at ultra-low chemoattractant concentrations from extreme first-passage events
이 논문은 극도로 낮은 농도에서도 세포가 확산되는 화학주성 신호의 초기 결합 사건을 분석함으로써 소수의 결합 이벤트만으로도 방향성을 빠르고 정확하게 감지할 수 있음을 보여줍니다.
SDSR: A Spectral Divide-and-Conquer Approach for Species Tree Reconstruction
이 논문은 스펙트럼 그래프 이론에 기반한 분할 정복 알고리즘인 SDSR 을 제안하여, 다중 유전자 마커 데이터를 이용한 대규모 종 계통수 재구성 시 계산 효율성을 10 배 이상 향상시키면서도 기존 방법과 동등한 정확도를 유지함을 보여줍니다.
Discovery of a Hematopoietic Manifold in scGPT Yields a Method for Extracting Performant Algorithms from Biological Foundation Model Internals
이 논문은 단일세포 기초 모델인 scGPT 의 내부 메커니즘을 해석하여 혈액 세포 발달 알고리즘을 추출하는 새로운 방법을 제시하고, 기존 모델보다 높은 성능과 효율성을 입증했습니다.
How to make the most of your masked language model for protein engineering
이 논문은 가변 언어 모델 (MLM) 을 활용한 단백질 공학을 위해 확률적 빔 서치를 제안하고, 항체 치료제 개발을 위한 대규모 실험을 통해 샘플링 방법의 선택이 모델 선택만큼이나 중요함을 입증했습니다.
Module control in youth symptom networks across COVID-19
본 연구는 COVID-19 팬데믹 기간 동안 18~24 세 미국 청년들의 정신 건강 증상 네트워크가 모듈 구조는 유지되지만, 스트레스 관련 증상을 중심으로 집중되던 모듈 간 통제력이 후기에는 정서·인지·사회적 영역으로 분산되어 재편성되었음을 규명했습니다.
JEDI: Jointly Embedded Inference of Neural Dynamics
이 논문은 제한적이고 노이즈가 많은 신경 기록 데이터에서도 다양한 과제를 포괄하는 단일 통합 모델로 뇌의 역동적 메커니즘을 확장 가능하고 일반화되게 추론할 수 있는 계층적 모델 'JEDI'를 제안하고, 이를 통해 신경 역학의 공유 구조를 밝히고 실제 원숭이 운동 피질 데이터에 적용하여 운동 제어의 기작적 통찰을 도출함을 보여줍니다.
ATP Level and Phosphorylation Free Energy Regulate Trigger-Wave Speed and Critical Nucleus Size in Cellular Biochemical Systems
이 논문은 ATP 농도와 인산화 자유 에너지와 같은 비평형 에너지 구동력이 세포 내 트리거 파동의 전파 속도와 임계 핵 크기를 조절하여 대사 상태가 공간적 역학 및 세포 결정 과정에 영향을 미친다는 것을 규명했습니다.
Packaging Jupyter notebooks as installable desktop apps using LabConstrictor
LabConstrictor 는 DevOps 전문 지식이 필요 없이 Jupyter 노트북을 CI/CD 파이프라인을 통해 일회성 설치 가능한 데스크톱 애플리케이션으로 자동 변환하여 생명과학 연구 소프트웨어의 배포 장벽을 낮추고 재사용성을 증진시킵니다.
SNPgen: Phenotype-Supervised Genotype Representation and Synthetic Data Generation via Latent Diffusion
SNPgen 은 표현형 정보를 조건으로 한 잠재 확산 모델을 통해 개인 식별 정보가 완전히 제거된 채 질병 예측 성능을 유지하는 합성 유전자형 데이터를 생성하는 새로운 프레임워크를 제안합니다.
Continuous Diffusion Transformers for Designing Synthetic Regulatory Elements
이 논문은 U-Net 을 변형한 파라미터 효율적인 Diffusion Transformer 를 도입하여 200bp 세포 유형별 조절 DNA 서열을 생성하고, Enformer 기반 보상 모델을 활용한 DDPO 미세조정을 통해 예측된 조절 활성을 38 배 향상시켰음을 보고합니다.
Macroscopic Dominance from Microscopic Extremes: Symmetry Breaking in Spatial Competition
이 논문은 공간적 우위가 극값 통계에 의해 초기 대칭성 깨짐을 유도하지만, 국소적 변동을 억제하고 안정적인 흡수 상태로 전환하기 위해서는 비상호적 상호작용 편향이 필수적임을 보여주는 확률적 자원 경쟁 모델을 제시합니다.
Linear Readout of Neural Manifolds with Continuous Variables
이 논문은 통계역학적 이론을 통해 신경 매니폴드의 기하학적 특성과 연속 변수의 선형 해독 효율성 간의 관계를 규명하고, 이를 실제 원숭이 시각 경로 데이터에 적용하여 물체 위치와 크기를 해독하는 능력이 시각 처리 단계에 따라 증가함을 밝혔습니다.