Theory of Cell Body Lensing and Phototaxis Sign Reversal in "Eyeless" Mutants of
이 논문은 의 '눈이 없는' 돌연변이에서 세포체가 렌즈 역할을 하여 초점된 빛이 광수용체에 도달할 때 발생하는 광주성 신호 반전을 정량적으로 설명하는 이론을 제시하며, 이는 굴절률 차이로 인한 내부 광선 초점과 광수용체가 더 높은 시간 미분 값을 가진 신호에 반응함으로써 발생함을 보여줍니다.
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108 편의 논문
Cross-Species Transfer Learning for Electrophysiology-to-Transcriptomics Mapping in Cortical GABAergic Interneurons
이 논문은 마우스와 인간 대뇌 피질의 GABAergic 억제성 interneuron 데이터를 활용하여 전기생리학적 기록을 전사체학 정체성에 매핑하는 프레임워크를 재현하고, 주어진 시퀀스 모델을 통해 인간 데이터에서 마우스 데이터의 전이 학습이 분류 성능 향상에 기여함을 입증했습니다.
Uncovering statistical structure in large-scale neural activity with Restricted Boltzmann Machines
이 논문은 제한된 볼츠만 기계 (RBM) 를 사용하여 쥐 뇌의 대규모 신경 활동 데이터에서 고차원적 상관관계를 포착하고, 시각 피질 내의 강한 상호작용과 영역 간 약한 결합을 포함한 명확한 해부학적 구조를 가진 유효 신경 상호작용 네트워크를 성공적으로 추론함을 보여줍니다.
In-batch Relational Features Enhance Precision in An Unsupervised Medical Anomaly Detection Task
이 논문은 CNN 오토인코더의 잠재 표현에 미니배치 내 정상 코호트의 맥락적 유사성을 통합하는 하이퍼그래프 추정 및 그래프 합성곱 레이어를 도입하여, 뇌 MRI 영상에서의 무감독 이상 탐지 시 정상 해부학적 변이와 병리를 혼동하는 문제를 해결하고 위양성률을 낮추며 성능을 크게 향상시켰음을 보여줍니다.
Multicellular Tumour Spheroids Exposure to Pulsed Electric Field: A Combined Experimental and Mathematical Modelling Study Highlighting Temporal Dynamics of DAMP Release and Accelerated Regrowth at Intermediate Field Intensities
이 연구는 실험과 수학적 모델을 결합하여 펄스 전기장 노출 후 다세포 종양 구형체의 손상 관련 분자 패턴 (DAMP) 방출 역학과 중간 강도에서의 재성장 가속화를 규명하고, 휴면 세포의 이중적 역할이 치료 설계에 중요함을 밝혔습니다.
Sampling-based Continuous Optimization for Messenger RNA Design
이 논문은 mRNA 설계의 복잡한 다목적 최적화 문제를 해결하기 위해, 후보 서열을 샘플링하고 평가하여 파라미터화된 샘플링 분포를 반복적으로 업데이트하는 새로운 연속 최적화 프레임워크를 제안하고, 이를 통해 기존 방법들보다 안정성 및 성능 관련 지표에서 우수한 성능을 입증했습니다.
drGT: Attention-Guided Gene Assessment of Drug Response Utilizing a Drug-Cell-Gene Heterogeneous Network
drGT 는 약물, 유전자, 세포주 간의 이종 네트워크와 어텐션 메커니즘을 활용하여 약물 반응의 민감도를 예측하고 기존 지식을 기반으로 한 생물학적 해석 가능성을 제공하는 그래프 딥러닝 모델입니다.
A practical identifiability criterion leveraging weak-form parameter estimation
이 논문은 관측 노이즈와 추정 오차를 고려한 새로운 실용적 식별성 기준인 (e, q)-식별성을 정의하고, 미분 대수 기법과 WENDy 방법을 결합한 약형 방정식 오차 기반 추정법을 통해 기존 방법보다 빠르고 강건하게 시스템의 식별성을 평가하는 방법을 제시합니다.
The role of topology on protein thermal stability
이 논문은 몬테카를로 시뮬레이션을 통해 단백질 YibK 의 열적 안정성 (Tm) 이 위상적 상태 (매듭 유무) 에 의존하지 않으며, 실험과 계산 결과 간의 불일치는 깊은 매듭 단백질에서 풀림과 풀리는 과정의 시간 척도 분리로 인해 DSC 실험이 비평형 상태를 측정하기 때문임을 규명했습니다.
Neuronal Spike Trains as Functional-Analytic Distributions: Representation, Analysis, and Significance
이 논문은 슈바르츠 분포 이론에 기반한 통합 함수해석학적 프레임워크를 개발하여, 이산적 사건 집합으로 표현된 뉴런의 스파이크 열을 이산화나 근사 없이 정확한 연산 미적분으로 분석하고, 이를 두 뉴런 상호 회로에 적용하여 시냅스 구동력 및 스파이크 타이밍 민감도 등에 대한 정확한 결과를 도출했습니다.
Extracting useful information about reversible evolutionary processes from irreversible evolutionary accumulation models
이 논문은 실제 진화 과정이 가역적임에도 불구하고 계산적으로 효율적인 비가역적 축적 모델을 사용하여 진화적 획득 순서와 핵심 역동 구조를 추론하는 것이 신뢰할 수 있는 결과를 제공할 수 있음을 시뮬레이션 연구를 통해 입증합니다.
Extending Sequence Length is Not All You Need: Effective Integration of Multimodal Signals for Gene Expression Prediction
이 논문은 긴 DNA 서열 길이 확장보다는 표적 유전자 근처의 다중 모달 후성유전 신호를 효과적으로 통합하여 배경 염색질 패턴의 혼란 효과를 줄이는 'Prism' 프레임워크를 제안함으로써, 짧은 서열로도 최첨단 수준의 유전자 발현 예측 성능을 달성할 수 있음을 보여줍니다.
Expectation and Acoustic Neural Network Representations Enhance Music Identification from Brain Activity
이 논문은 음악 청취 시 뇌 활동에서 추출된 음향적 정보와 기대 관련 정보를 별도의 교사 표적으로 활용하는 사전 학습된 신경망 표현을 결합함으로써, 기존 베이스라인을 능가하는 EEG 기반 음악 식별 성능을 달성했음을 보여줍니다.
Cross-Species Antimicrobial Resistance Prediction from Genomic Foundation Models
이 논문은 진화 기반 모델 (Evo-1-8k-base) 의 임베딩에서 안정성 경계 근처의 레이어를 선택하고, 국소적 항생제 내성 신호를 보존하기 위해 MiniRocket 을 적용함으로써 종 간 항생제 내성 예측의 일반화 성능을 획기적으로 개선하는 방법을 제시합니다.
A Standardized Framework For Evaluating Gene Expression Generative Models
이 논문은 단일 세포 유전자 발현 생성 모델의 평가 기준 부재 문제를 해결하기 위해, 일관된 메트릭 구현과 생물학적 기반 평가를 가능하게 하는 오픈소스 파이썬 프레임워크인 GGE 를 제안합니다.
The macaque IT cortex but not current artificial vision networks encode object position in perceptually aligned coordinates
이 논문은 원숭이 하측 측두엽 (IT) 피질이 과거 시각 경험에 기반한 지각적 좌표계로 물체 위치를 인코딩하는 반면, 현재 인공지능 비전 네트워크는 동일한 적응 현상을 보이지 않아 생물학적 및 인공 시각 시스템 간의 공간 코딩 메커니즘에 차이가 있음을 규명했습니다.
Single molecule localization microscopy challenge: a biologically inspired benchmark for long-sequence modeling
이 논문은 생물학적 이미징의 희소하고 불규칙한 시공간 점 과정 데이터를 평가하기 위해 '단일 분자 국소화 현미경 챌린지 (SMLM-C)' 벤치마크를 제안하고, 상태 공간 모델이 시간적 단절이 심한 깜빡임 역학을 모델링하는 데 있어 근본적인 한계를 보임을 규명했습니다.
Ill-Conditioning in Dictionary-Based Dynamic-Equation Learning: A Systems Biology Case Study
이 논문은 시스템 생물학 사례 연구를 통해 희소 회귀 기반 동역학 식 학습에서 다중공선성으로 인한 수치적 불안정성 문제를 분석하고, 데이터 분포와 일치하는 직교 다항식 기저를 사용할 때 모델 복원 정확도가 향상됨을 보여줍니다.
Human Navigation Behaviour and Brain Dynamics in Real-world Contexts
이 논문은 최근 몇 년간 자연주의적이고 생태학적 관점에서 인간 내비게이션 행동과 뇌 역학을 연구한 네 가지 주요 접근법 (실제 환경 실험, 일상생활 추적 데이터 분석, 가상 환경 시뮬레이션, 이동식 뇌 기록) 을 검토하고 향후 연구 방향을 제시합니다.
abx_amr_simulator: A simulation environment for antibiotic prescribing policy optimization under antimicrobial resistance
이 논문은 항생제 내성 (AMR) 관리와 처방 정책 최적화를 위해 강화학습 에이전트 훈련에 활용 가능한 모듈형 시뮬레이션 패키지인 'abx_amr_simulator'를 소개하고 있습니다.